Kekere RNA sequencing-Ilumina
Awọn ẹya ara ẹrọ
● Aṣayan iwọn ti RNA ṣaaju igbaradi ile-ikawe
● Itupalẹ bioinformatic ti dojukọ ni ayika asọtẹlẹ miRNA ati awọn ibi-afẹde wọn
Awọn anfani Iṣẹ
●Itupalẹ bioinformatics ni kikun:jẹ ki idanimọ mejeeji ti a mọ ati awọn miRNA aramada, idanimọ ti awọn ibi-afẹde miRNAs ati alaye iṣẹ ṣiṣe ti o baamu ati imudara pẹlu awọn apoti isura data pupọ (KEGG, GO)
●Iṣakoso Didara lile: a ṣe awọn aaye iṣakoso mojuto ni gbogbo awọn ipele, lati apẹẹrẹ ati igbaradi ile-ikawe si ilana ati bioinformatics.Abojuto to ṣe pataki yii ṣe idaniloju ifijiṣẹ ti awọn abajade didara to gaju nigbagbogbo.
●Post-Tita Support: Ifaramo wa ti kọja ipari iṣẹ akanṣe pẹlu akoko iṣẹ-iṣẹ 3-osu lẹhin-tita.Lakoko yii, a funni ni atẹle iṣẹ akanṣe, iranlọwọ laasigbotitusita, ati awọn akoko Q&A lati koju eyikeyi awọn ibeere ti o ni ibatan si awọn abajade.
●Amoye nla: pẹlu igbasilẹ orin ti pipade ni aṣeyọri lori ọpọlọpọ awọn iṣẹ akanṣe sRNA ti o bo awọn eya 100 ni ọpọlọpọ awọn agbegbe iwadii, ẹgbẹ wa mu ọpọlọpọ iriri wa si gbogbo iṣẹ akanṣe.
Awọn ibeere Ayẹwo ati Ifijiṣẹ
| Ile-ikawe | Platform | Data ti a ṣe iṣeduro | Data QC |
| Ti yan iwọn | Illumina SE50 | 10M-20M kika | Q30≥85% |
Awọn ibeere Apeere:
Nucleotides:
| Konc.(ng/μl) | Iye (μg) | Mimo | Òtítọ́ |
| ≥ 80 | ≥ 0.5 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 Lopin tabi ko si amuaradagba tabi idoti DNA ti o han lori jeli. | RIN≥6.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; ni opin tabi ko si igbega ipilẹ |
● Awọn ohun ọgbin:
Gbongbo, Jeyo tabi Petal: 450 mg
Ewe tabi Irugbin: 300 mg
Eso: 1.2 g
● Ẹranko:
Okan tabi ifun: 450 mg
Viscera tabi Ọpọlọ: 240 mg
Isan: 600 mg
Egungun, Irun tabi Awọ: 1.5g
● Arthropods:
Kokoro: 9g
Crustacea: 450 mg
● Odidi ẹjẹ: 2 tubes
● Awọn sẹẹli: 106 awọn sẹẹli
● Omi ara ati Plasma:6 milimita
Niyanju Ifijiṣẹ Apeere
Apoti:
tube centrifuge 2 milimita (a ko ṣeduro bankanje Tin)
Ifamisi apẹẹrẹ: Ẹgbẹ+ ṣe ẹda fun apẹẹrẹ A1, A2, A3;B1, B2, B3......
Gbigbe:
1.Dry-ice: Awọn ayẹwo nilo lati wa ni aba ti awọn apo ati ki o sin ni gbẹ-yinyin.
2.RNAstable tubes: Awọn ayẹwo RNA le gbẹ ni tube imuduro RNA (fun apẹẹrẹ RNAstable®) ati gbigbe ni iwọn otutu yara.
Sisan Iṣẹ Iṣẹ
Apẹrẹ adanwo
Ifijiṣẹ apẹẹrẹ
RNA isediwon
Ikole ìkàwé
Titele
Itupalẹ data
Lẹhin-tita awọn iṣẹ
Bioinformatics
Idanimọ ti miRNA: ọna ati ijinle
Iyatọ ti miRNA – ikojọpọ akoso
Itọkasi iṣẹ ṣiṣe ti ibi-afẹde ti awọn miRNA ti a fihan ni iyatọ
Ṣawakiri awọn ilọsiwaju iwadii ti o ni irọrun nipasẹ awọn iṣẹ itọsẹ BMKGene'sRNA nipasẹ ikojọpọ ti awọn atẹjade.
Chen, H. et al.(2023) 'Awọn akoran ti o gbogun ti dẹkun biosynthesis saponin ati photosynthesis ni Panax notoginseng', Plant Physiology and Biochemistry, 203, p.108038. doi: 10.1016 / J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. et al.(2023) Ohun ọgbin FYVE-ašẹ ti o ni amuaradagba FREE1 ṣe ajọṣepọ pẹlu awọn paati microprocessor lati ṣe atunṣe miRNA biogenesis, awọn ijabọ EMBO, 24(1).doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. et al.(2023) 'MicroRNA Ame-Bantam-3p' n ṣakoso Idagbasoke Pupal Larval nipasẹ Ifojusi Awọn Ifojusi Idagbasoke Epidermal Multiple-like Domains 8 Gene (megf8) ninu Honeybee, Apis mellifera', Iwe akọọlẹ International ti Awọn sáyẹnsì Molecular, 24(6), p .5726. doi: 10.3390 / IJMS24065726 / S1.
Zhang, M. et al.(2018) 'Onínọmbà Ijọpọ ti MiRNA ati Awọn Jiini ti o ni nkan ṣe pẹlu Didara Eran Fihan pe Gga-MiR-140-5p Ni ipa lori Intramuscular Fat Deposition in Chicken', Cellular Physiology and Biochemistry, 46 (6), pp. 2421-2433.doi: 10.1159/000489649.
