-
Nikan- arin RNA Sequencing
Ilọsiwaju ni yiya sẹẹli ẹyọkan ati ilana iṣelọpọ ile ikawe ẹni kọọkan ni apapọ pẹlu ilana ṣiṣe-giga ngbanilaaye awọn iwadii ikosile jiini lori ipilẹ sẹẹli-nipasẹ-cell.O jẹ ki itupalẹ eto ti o jinlẹ ati pipe lori awọn olugbe sẹẹli ti o nipọn, ninu eyiti o yago fun boju-boju ti ilopọ wọn nipa gbigbe apapọ gbogbo awọn sẹẹli.
Bibẹẹkọ, diẹ ninu awọn sẹẹli ko dara lati ṣe si idaduro sẹẹli-ẹyọkan, nitorinaa awọn ọna igbaradi ayẹwo miiran - isediwon iparun lati awọn tisọ ni a nilo, iyẹn ni, a ti fa iparun taara lati awọn tisọ tabi sẹẹli ati pese sile sinu idadoro-orun kan fun ẹyọkan- sẹẹli lesese.
BMK n pese 10× Genomics ChromiumTM ti o da lori iṣẹ ṣiṣe atẹle sẹẹli-ẹyọkan RNA.Iṣẹ yii ti ni lilo pupọ ni awọn iwadii lori awọn iwadii ti o ni ibatan arun, gẹgẹbi iyatọ sẹẹli ti ajẹsara, ilopọ tumọ, idagbasoke ti ara, ati bẹbẹ lọ.
Chip transcriptome aaye: 10× Genomics
Platform: Illumina NovaSeq Platform
-
Ohun ọgbin / Animal Gbogbo Jiome Sequencing
Gbogbo genome tun-tẹle, ti a tun mọ ni WGS, ngbanilaaye iṣafihan ti awọn iyipada ti o wọpọ ati ti o ṣọwọn lori gbogbo jiini pẹlu Nikan Nucleotide Polymorphism (SNP), Ifilọlẹ Ifibọ (InDel), Iyatọ igbekalẹ (SV), ati Iyatọ Nọmba Daakọ (CNV) ).Awọn SV ṣe ipin ti o tobi ju ti ipilẹ iyatọ ju awọn SNPs ati pe o ni ipa ti o tobi julọ lori genome, eyiti o ni ipa pataki lori awọn ohun alumọni alãye.Atunṣe kika gigun ngbanilaaye idanimọ deede diẹ sii ti awọn ajẹkù nla ati awọn iyatọ idiju nitori kika gigun jẹ ki o rọrun pupọ lati kọja chromosomal lori awọn agbegbe idiju bii awọn atunwi tandem, awọn agbegbe GC/AT-ọlọrọ, ati awọn agbegbe hyper-ayipada.
Platform: Illumina, PacBio, Nanopore
-
BMKMANU S1000 Spatial Transcriptome
Awọn transcriptomics aaye duro ni iwaju ti imotuntun imọ-jinlẹ, n fun awọn oniwadi ni agbara lati wa sinu awọn ilana ikosile jiini intricate laarin awọn tissu lakoko ti o tọju ipo aye wọn.Laarin awọn iru ẹrọ lọpọlọpọ, BMKGene ti ṣe agbekalẹ BMKManu S1000 Spatial Transcriptome Chip, nṣogo ohunti mu dara si ipinnuti 5µM, ti o de opin iwọn sẹẹli, ati mimuuṣiṣẹolona-ipele ipinnu eto.Chirún S1000, ti o nfihan isunmọ awọn aaye miliọnu 2, n gba awọn microwells ti o ni fẹlẹfẹlẹ pẹlu awọn ilẹkẹ ti o kojọpọ pẹlu awọn iwadii imudani ti aye.Ile-ikawe cDNA kan, ti o ni idarato pẹlu awọn koodu iwọle aye, ti pese sile lati chirún S1000 ati atẹle atẹle lori pẹpẹ Illumina NovaSeq.Apapo ti awọn ayẹwo ni aaye barcoded ati awọn UMI ṣe idaniloju deede ati pato ti data ti ipilẹṣẹ.Ẹya alailẹgbẹ ti chirún BMKManu S1000 wa ni isọpọ rẹ, nfunni ni awọn eto ipinnu ipele pupọ ti o le jẹ aifwy daradara si oriṣiriṣi awọn ara ati awọn ipele ti alaye.Aṣamubadọgba yii wa ni chirún bi yiyan ti o tayọ fun awọn ikẹkọ aye transcriptomics lọpọlọpọ, aridaju iṣupọ aye to peye pẹlu ariwo kekere.
Lilo chirún BMKManu S1000 ati awọn imọ-ẹrọ transcriptomics aye miiran, awọn oniwadi le ni oye ti o dara julọ ti eto aye ti awọn sẹẹli ati awọn ibaraenisepo molikula ti o waye laarin awọn tisọ, pese awọn oye ti ko niye si awọn ilana ti o wa labẹ awọn ilana ti ibi ni ọpọlọpọ awọn aaye, pẹlu oncology, Neuroscience, isedale idagbasoke, ajesara ati Botanical-ẹrọ.
Platform: BMKManu S1000 ërún ati Illumina NovaSeq
-
10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
Awọn transcriptomics aaye jẹ imọ-ẹrọ gige-eti ti o fun laaye awọn oniwadi lati ṣe iwadii awọn ilana ikosile pupọ laarin awọn tisọ lakoko ti o tọju ipo aye wọn.Syeed ti o lagbara ni agbegbe yii jẹ 10x Genomics Visium pọ pẹlu ilana ilana Illumina.Ilana ti 10X Visium wa lori chirún amọja kan pẹlu agbegbe imudani ti a yan nibiti a ti gbe awọn apakan ara.Agbegbe yiyaworan ni awọn aaye ti o ni koodu koodu, kọọkan ti o baamu si ipo aye alailẹgbẹ laarin àsopọ.Awọn ohun elo RNA ti o gba lati inu ẹran ara lẹhinna ni aami pẹlu awọn idamọ molikula alailẹgbẹ (UMIs) lakoko ilana iṣipopada.Awọn aaye ti o ni koodu koodu ati awọn UMI jẹ ki aworan agbaye to peye ati iwọn ikosile jiini ni ipinnu sẹẹli-ẹyọkan.Apapo ti awọn ayẹwo ni aaye barcoded ati awọn UMI ṣe idaniloju deede ati pato ti data ti ipilẹṣẹ.Nipa lilo imọ-ẹrọ Spatial Transcriptomics yii, awọn oniwadi le ni oye ti o jinlẹ ti eto aye ti awọn sẹẹli ati awọn ibaraenisepo molikula ti o nwaye laarin awọn tisọ, fifun awọn oye ti ko niyelori si awọn ilana ti o wa labẹ awọn ilana ti ibi ni awọn aaye pupọ, pẹlu oncology, neuroscience, isedale idagbasoke, ajẹsara , ati awọn ẹkọ imọ-aye.
Platform: 10X Genomics Visium ati Illumina NovaSeq
-
Ipari-kikun mRNA Sequencing-Nanopore
Lakoko ti ilana mRNA ti o da lori NGS ṣe iranṣẹ bi ohun elo to wapọ fun titobi ikosile pupọ, igbẹkẹle rẹ lori kika kukuru ni ihamọ ipa rẹ ni awọn itupalẹ transcriptomic eka.Atẹle Nanopore, ni ida keji, nlo imọ-ẹrọ kika-gigun, ti o mu ki ilana ti awọn iwe afọwọkọ mRNA gigun-kikun.Ọna yii n ṣe irọrun iwadii kikun ti splicing yiyan, awọn idapọ pupọ, poly-adenylation, ati iwọn awọn isoforms mRNA.
Itọsẹ Nanopore da lori nanopore ẹyọ-moleku gidi-akoko awọn ifihan agbara itanna.Ti o ni itọsọna nipasẹ awọn ọlọjẹ mọto, DNA ti o ni ilọpo meji ni asopọ si awọn ọlọjẹ nanopore ti a fi sinu biofilm, ṣiṣi silẹ bi o ti n kọja nipasẹ ikanni nanopore labẹ iyatọ foliteji.Awọn ifihan agbara itanna iyasọtọ ti ipilẹṣẹ nipasẹ awọn ipilẹ oriṣiriṣi lori okun DNA ni a rii ati tito lẹtọ ni akoko gidi, ni irọrun deede ati itọsẹ ipasẹ nucleotide.Ọna imotuntun yii bori awọn idiwọn kika kukuru ati pese pẹpẹ ti o ni agbara fun itupalẹ jiini intricate, pẹlu awọn ikẹkọ transcriptomic eka.
Syeed: Nanopore Promethion P48
-
Ipari mRNA ni kikun -PacBio
Lakoko ti ilana mRNA ti o da lori NGS jẹ ohun elo wapọ fun iwọn ikosile jiini, igbẹkẹle rẹ lori kika kukuru ni ihamọ lilo rẹ ni awọn itupalẹ transcriptomic eka.PacBio sequencing (Iso-Seq), ni apa keji, nlo imọ-ẹrọ kika gigun, ti o mu ki ilana ti awọn iwe afọwọkọ mRNA gigun-kikun.Ọna yii n ṣe iranlọwọ fun iwadii pipe ti splicing yiyan, awọn idapọ pupọ ati poly-adenylation botilẹjẹpe kii ṣe yiyan akọkọ fun titobi ikosile pupọ, nitori iye giga ti data ti o nilo.
Imọ-ẹrọ ilana ipasẹ PacBio da lori ilana-ẹyọkan, akoko gidi (SMRT), ti n pese anfani ti o yatọ ni yiya awọn iwe afọwọkọ mRNA gigun-kikun.Ọna imotuntun yii jẹ pẹlu lilo awọn itọsọna igbi odo-ipo (ZMW), awọn kanga microfabricated ti o jẹ ki akiyesi akoko gidi ti iṣẹ ṣiṣe DNA polymerase lakoko tito-tẹle.Laarin awọn ZMW wọnyi, PacBio's DNA polymerase ṣajọpọ okun ibaramu ti DNA, ti n ṣe ipilẹṣẹ kika gigun ti o ni gbogbo awọn iwe afọwọkọ mRNA.Iṣiṣẹ PacBio ni ipo itẹwọgba Ipinnu Ijẹwọgbigba (CCS) ṣe imudara deede nipasẹ titẹle moleku kanna leralera.Awọn kika HiFi ti ipilẹṣẹ ni deede ti o ṣe afiwe si NGS, idasi siwaju si okeerẹ ati igbekale igbẹkẹle ti awọn ẹya transcriptomic eka.Platform: PacBio Sequel II
-
Eukaryotic mRNA Sequencing-Ilumina
Itọpa mRNA n fun ni agbara ni kikun ti gbogbo awọn iwe afọwọkọ mRNA laarin awọn sẹẹli labẹ awọn ipo kan pato.Imọ-ẹrọ gige-eti yii ṣiṣẹ bi ohun elo ti o lagbara, ṣiṣafihan awọn profaili ikosile jiini intricate, awọn ẹya pupọ, ati awọn ọna ṣiṣe molikula ti o ni nkan ṣe pẹlu awọn ilana isedale oniruuru.Ti a gba jakejado ni iwadii ipilẹ, awọn iwadii ile-iwosan, ati idagbasoke oogun, ilana-iṣe mRNA n funni ni awọn oye si awọn intricacies ti awọn agbara cellular ati ilana ilana jiini.
Syeed: Illumina NovaSeq X
-
Ti kii ṣe Itọkasi orisun mRNA Sequencing-Ilumina
Itọpa mRNA n fun ni agbara ni kikun ti gbogbo awọn iwe afọwọkọ mRNA laarin awọn sẹẹli labẹ awọn ipo kan pato.Imọ-ẹrọ gige-eti yii ṣiṣẹ bi ohun elo ti o lagbara, ṣiṣafihan awọn profaili ikosile jiini intricate, awọn ẹya pupọ, ati awọn ọna ṣiṣe molikula ti o ni nkan ṣe pẹlu awọn ilana isedale oniruuru.Ti a gba jakejado ni iwadii ipilẹ, awọn iwadii ile-iwosan, ati idagbasoke oogun, ilana-iṣe mRNA n funni ni awọn oye si awọn intricacies ti awọn agbara cellular ati ilana ilana jiini.
Syeed: Illumina NovaSeq X
-
Gigun ti kii ṣe ifaminsi-Illumina
Awọn RNA ti kii ṣe ifaminsi gigun (lncRNAs) jẹ awọn RNA to gun ju 200 nucleotides ti o ni agbara ifaminsi iwonba ati pe o jẹ awọn eroja pataki laarin RNA ti kii ṣe ifaminsi.Ti a rii ni arin ati cytoplasm, awọn RNA wọnyi ṣe awọn ipa to ṣe pataki ni epigenetic, transcriptional, ati ilana transcriptional lẹhin, ti n tẹnumọ pataki wọn ni sisọ awọn ilana cellular ati molikula.Ilana LncRNA jẹ ohun elo ti o lagbara ni iyatọ sẹẹli, Ontogenesis, ati awọn arun Eda eniyan.
Platform: Illumina NovaSeq
-
Kekere RNA sequencing-Ilumina
Awọn ohun elo RNA (sRNA) kekere, deede labẹ awọn nucleotides 200 ni gigun, pẹlu microRNAs (miRNAs), awọn RNAs kekere (siRNAs), ati awọn RNA ti o nbaṣepọ piwi (piRNAs).Lara iwọnyi, awọn miRNA, ni ayika 20-24 nucleotides gigun, jẹ akiyesi pataki fun awọn ipa ilana pataki wọn ni ọpọlọpọ awọn ilana alagbeka.Pẹlu awọn ilana ikosile ti ara-pato ati ipele-ipele, awọn miRNA ṣe afihan itọju giga kọja awọn oriṣiriṣi oriṣiriṣi.
Platform: Illumina NovaSeq
-
circRNA sequencing-Ilumina
Atẹle RNA yipo (circRNA-seq) ni lati ṣe profaili ati ṣe itupalẹ awọn RNAs ipin, kilasi kan ti awọn ohun elo RNA ti o ṣe awọn iyipo pipade nitori awọn iṣẹlẹ splicing ti kii-canonical, pese RNA wọnyi pẹlu iduroṣinṣin to pọ si.Lakoko ti diẹ ninu awọn circRNA ti ṣe afihan lati ṣe bi awọn kanrinkan microRNA, titọ awọn microRNAs ati idilọwọ wọn lati ṣe ilana mRNAs ibi-afẹde wọn, awọn circRNA miiran le ṣe ajọṣepọ pẹlu awọn ọlọjẹ, ṣatunṣe ikosile jiini, tabi ni awọn ipa ninu awọn ilana cellular.Ṣiṣayẹwo ikosile circRNA n pese awọn oye sinu awọn ipa ilana ti awọn ohun elo wọnyi ati pataki wọn ni ọpọlọpọ awọn ilana cellular, awọn ipele idagbasoke, ati awọn ipo arun, ti n ṣe idasi si oye ti o jinlẹ ti idiju ti ilana RNA ni aaye ti ikosile pupọ.
-
Gbogbo transcriptome lesese – Illumina
Gbogbo itọsẹ transcriptome n funni ni ọna pipe si sisọ awọn ohun elo RNA oniruuru, yika ifaminsi mejeeji (mRNA) ati awọn RNA ti kii ṣe ifaminsi (lncRNA, circRNA, ati miRNA).Ilana yii gba iwe-kikọ kikun ti awọn sẹẹli kan pato ni akoko ti a fun, gbigba fun oye pipe ti awọn ilana cellular.Paapaa ti a mọ bi “apapọ RNA lapapọ,” o ni ero lati ṣipaya awọn nẹtiwọọki ilana intricate ni ipele transcriptome, ṣiṣe itupalẹ ijinle gẹgẹbi idije RNA endogenous (ceRNA) ati itupalẹ RNA apapọ.Eyi ṣe samisi igbesẹ akọkọ si ọna abuda iṣẹ, ni pataki ni ṣiṣafihan awọn nẹtiwọọki ilana ti o kan awọn ibaraenisepo ceRNA-orisun circRNA-miRNA-mRNA.
