-
Ilana Metagenomic -NGS
Metagenome n tọka si akojọpọ awọn ohun elo jiini lapapọ ti agbegbe ti o dapọ ti awọn oganisimu, gẹgẹbi awọn metagenome ayika, metagenome eniyan, ati bẹbẹ lọ O ni awọn jinomes ti awọn microorganisms mejeeji ti o le gbin ati ti a ko le gbin.Ilana ti Metagenomic jẹ ohun elo molikula ti a lo lati ṣe itupalẹ awọn ohun elo genomic adalu ti a fa jade lati inu awọn apẹẹrẹ ayika, eyiti o pese alaye alaye ni oniruuru eya ati opo, eto olugbe, ibatan phylogenetic, awọn jiini iṣẹ ati nẹtiwọọki ibamu pẹlu awọn ifosiwewe ayika.
Syeed:Illumina NovaSeq Platform
-
Metagenomic Sequencing-Nanopore
Metagenomics jẹ ohun elo molikula ti a lo lati ṣe itupalẹ awọn ohun elo genomic ti o dapọ ti a fa jade lati awọn apẹẹrẹ ayika, eyiti o pese alaye alaye ni oniruuru eya ati opo, eto olugbe, ibatan phylogenetic, awọn jiini iṣẹ ati nẹtiwọọki ibamu pẹlu awọn ifosiwewe ayika, ati bẹbẹ lọ Awọn iru ẹrọ ilana atẹle Nanopore ti ṣafihan laipẹ. si awọn ẹkọ metagenomic.Iṣe to dayato si ni ipari kika ni ilọsiwaju pupọ si isalẹ ṣiṣan metagenomic, ni pataki apejọ metagenome.Gbigba awọn anfani ti kika-ipari, Nanopore-orisun metagenomic iwadi ni anfani lati se aseyori diẹ lemọlemọfún ijọ akawe pẹlu shot-ibon metagenomics.O ti ṣe atẹjade pe awọn metagenomics ti o da lori Nanopore ni aṣeyọri ti ipilẹṣẹ ni pipe ati tiipa awọn genomes kokoro arun lati awọn microbiomes (Moss, EL, et. al,Biotech iseda, 2020)
Syeed:Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Subunit ti o wa lori 16S ati 18S rRNA ti o ni awọn mejeeji ni ipamọ giga ati awọn ẹkun-iyipada hyper jẹ itẹka molikula pipe fun idanimọ prokaryotic ati awọn oganisimu eukaryotic.Ni anfani ti ṣiṣe atẹle, awọn amplicons wọnyi le jẹ ifọkansi ti o da lori awọn apakan ti a fipamọ ati awọn agbegbe hyper-ayipada ni a le ṣe afihan ni kikun fun idanimọ makirobia ti o ṣe idasi si awọn iwadii ti o bo itusilẹ oniruuru microbial, taxonomy, phylogeny, bbl. Ilana ti ipasẹ PacBio ngbanilaaye lati gba awọn kika gigun ti o peye gaan, eyiti o le bo awọn amplicons gigun ni kikun (isunmọ 1.5 Kb).Wiwo ti o gbooro ti aaye jiini ṣe alekun ipinnu gaan ni asọye eya ni awọn kokoro arun tabi agbegbe elu.
Syeed:PacBio Sequel II
-
16S / 18S / IT Amplicon Sequencing-NGS
16S/18S/ITS amplicon sequencing ni ifọkansi ni ṣiṣafihan phylogeny, taxonomy, ati opo eya ni agbegbe makirobia nipasẹ ṣiṣewadii awọn ọja PCR ti awọn asami jiini ti itọju ile ti o ni awọn ibaraẹnisọrọ mejeeji ati awọn ẹya hypervariable.Ifihan itẹka molikula pipe wọnyi nipasẹ Woeses et al, (1977) n fun profaili microbiome ti ko ni ipinya ni agbara.Tito lẹsẹsẹ ti 16S (kokoro), 18S ( elu) ati Inu transcribed spacer(ITS, elu) ngbanilaaye idanimọ ti awọn ẹya lọpọlọpọ ati awọn ẹya toje ati ti a ko mọ.Imọ-ẹrọ yii ti di ohun elo ti a lo lọpọlọpọ ati ohun elo pataki ni idamo akojọpọ makirobia ti o yatọ ni ọpọlọpọ awọn agbegbe, gẹgẹbi ẹnu eniyan, ifun, feces, ati bẹbẹ lọ.
Syeed:Illumina NovaSeq Platform
-
Kokoro ati Olu Gbogbo Jiini Tun-sequencing
Bakteria ati olu gbogbo genome tun-sequencing jẹ ohun elo to ṣe pataki lati pari awọn genomes ti kokoro arun ti a mọ ati elu, bakannaa lati ṣe afiwe awọn genomes pupọ tabi lati ṣe maapu awọn genomes ti awọn oganisimu tuntun.O ṣe pataki pupọ lati ṣe lẹsẹsẹ gbogbo awọn genomes ti kokoro arun ati elu lati le ṣe agbekalẹ awọn genomes itọkasi deede, lati ṣe idanimọ makirobia ati awọn iwadii jiini afiwera miiran.
Platform: Illumina NovaSeq Platform
-
Metatranscriptome Sequencing
Metatranscriptome sequencing ṣe afihan ikosile pupọ ti awọn microbes (mejeeji eukaryotes ati prokaryotes) laarin awọn agbegbe adayeba (ie ile, omi, okun, feces, ati ikun.) Ni pato, awọn iṣẹ yii n gba ọ laaye lati gba gbogbo ikosile jiini ti awọn agbegbe microbial eka, itupalẹ taxonomic ti eya, igbekale imudara iṣẹ-ṣiṣe ti awọn Jiini ti o yatọ ti a sọ, ati diẹ sii.
Platform: Illumina NovaSeq Platform
-
Olu Genome
Awọn imọ-ẹrọ Biomarker n pese iwadii jiometirika, genome itanran ati pene-pipe genome ti olu da lori ibi-afẹde iwadii kan pato.Itọpa-ara-ara-ara, apejọ ati akọsilẹ iṣẹ-ṣiṣe le ṣee ṣe nipasẹ pipọpọ titobalẹ-iran-iran + Atẹle iran kẹta lati ṣaṣeyọri apejọ genome ipele giga.Imọ-ẹrọ Hi-C tun le ṣe oojọ ti lati dẹrọ apejọ genome ni ipele chromosome.
Syeed:PacBio Sequel II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq Platform
-
Awọn kokoro arun pipe Genome
Awọn imọ-ẹrọ Biomarker n pese iṣẹ ṣiṣe lẹsẹsẹ lori ṣiṣe jiini pipe ti kokoro arun pẹlu aafo odo.Ṣiṣan iṣẹ akọkọ ti awọn kokoro arun pipe iṣelọpọ jiini pẹlu tito lẹsẹsẹ iran kẹta, apejọ, asọye iṣẹ ṣiṣe ati itupalẹ bioinformatic ti ilọsiwaju ti nmu awọn ibi-afẹde iwadii kan pato ṣẹ.Ifitonileti okeerẹ diẹ sii ti jiini kokoro arun n fun ni agbara ifihan ti awọn ilana ipilẹ ti o wa labẹ awọn ilana ti ibi wọn, eyiti o tun le pese itọkasi ti o niyelori fun awọn iwadii jinomiki ni awọn eya eukaryotic ti o ga julọ.
Syeed:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq Platform
PacBio Sequel II
