-
Genome-jakejado Association Analysis
Iwadi ẹgbẹ-jakejado Genome (GWAS) ni ifọkansi lati ṣe idanimọ awọn iyatọ jiini (genotype) ti o ni nkan ṣe pẹlu awọn abuda kan pato (phenotype).Iwadi GWAS ṣe iwadii awọn asami jiini kọja gbogbo genome ti nọmba nla ti awọn eniyan kọọkan ati sọtẹlẹ awọn ẹgbẹ genotype-phenotype nipasẹ itupalẹ iṣiro ni ipele olugbe.O ti wa ni lilo pupọ ni iwadii lori awọn arun eniyan ati iwakusa jiini iṣẹ ṣiṣe lori awọn abuda eka ti awọn ẹranko tabi awọn irugbin.
-
Ohun ọgbin / Animal Gbogbo Jiome Sequencing
Gbogbo genome tun-tẹle, ti a tun mọ ni WGS, ngbanilaaye iṣafihan ti awọn iyipada ti o wọpọ ati ti o ṣọwọn lori gbogbo jiini pẹlu Nikan Nucleotide Polymorphism (SNP), Ifilọlẹ Ifibọ (InDel), Iyatọ igbekalẹ (SV), ati Iyatọ Nọmba Daakọ (CNV) ).Awọn SV ṣe ipin ti o tobi ju ti ipilẹ iyatọ ju awọn SNPs ati pe o ni ipa ti o tobi julọ lori genome, eyiti o ni ipa pataki lori awọn ohun alumọni alãye.Atunṣe kika gigun ngbanilaaye idanimọ deede diẹ sii ti awọn ajẹkù nla ati awọn iyatọ idiju nitori kika gigun jẹ ki o rọrun pupọ lati kọja chromosomal lori awọn agbegbe idiju bii awọn atunwi tandem, awọn agbegbe GC/AT-ọlọrọ, ati awọn agbegbe hyper-ayipada.
Platform: Illumina, PacBio, Nanopore
-
Genetics ti itiranya
Jiini ti itiranya jẹ iṣẹ ṣiṣe atẹle ti o kun ti a ṣe apẹrẹ fun ipese itumọ pipe lori alaye itankalẹ ti awọn ohun elo ti o da lori awọn iyatọ jiini, pẹlu SNPs, InDels, SVs ati CNVs.O pese gbogbo awọn itupalẹ ipilẹ ti o nilo fun apejuwe awọn iyipada itiranya ati awọn ẹya jiini ti awọn olugbe, gẹgẹbi igbekalẹ olugbe, oniruuru jiini, awọn ibatan phylogeny, bbl O tun ni awọn iwadii lori ṣiṣan pupọ, eyiti o funni ni agbara idiyele ti iwọn olugbe ti o munadoko, akoko iyatọ.
-
Ifiwera Genomics
Awọn jinomiki afiwera ni itumọ ọrọ gangan tumọ si ifiwera awọn ilana jiini pipe ati awọn ẹya ti awọn oriṣiriṣi oriṣiriṣi.Ibawi yii ni ifọkansi lati ṣafihan itankalẹ eya, iṣẹ jiini, ilana ilana jiini ni ipele jiini nipasẹ idamo awọn ọna lẹsẹsẹ ati awọn eroja ti o tọju tabi iyatọ laarin awọn oriṣiriṣi oriṣiriṣi.Iwadii jinomiki afiwera ti o wọpọ pẹlu awọn itupale ninu idile apilẹṣẹ, idagbasoke itankalẹ, ẹda ẹda-ara gbogbo, titẹ yiyan, ati bẹbẹ lọ.
-
Hi-C orisun Apejọ Genome
Hi-C jẹ ọna ti a ṣe apẹrẹ lati mu iṣeto chromosome mu nipa apapọ awọn ibaraẹnisọrọ orisun-isunmọ probing ati ilana ṣiṣe-giga.Kikan ti awọn ibaraenisepo wọnyi ni a gbagbọ pe o ni ibatan ni odi pẹlu ijinna ti ara lori awọn chromosomes.Nitorinaa, data Hi-C le ṣe itọsọna iṣakojọpọ, pipaṣẹ ati iṣalaye awọn ilana ti o pejọ ninu jiomeji osere ati didari awọn wọnyẹn sori nọmba kan ti awọn chromosomes.Imọ-ẹrọ yii n fun apejọ jiini ipele-chromosome ni agbara ni isansa ti maapu jiini ti o da lori olugbe.Gbogbo genome kan nilo Hi-C.
Platform: Illumina NovaSeq Platform / DNBSEQ
-
Ohun ọgbin / Animal De Novo Genome Sequencing
De Novoitọka itọka si ikole ti ẹda kan 'gbogbo genome nipa lilo awọn imọ-ẹrọ titele, fun apẹẹrẹ PacBio, Nanopore, NGS, ati bẹbẹ lọ, laisi jiini itọkasi kan.Ilọsiwaju iyalẹnu ni ipari kika ti awọn imọ-ẹrọ itẹlera iran kẹta ti mu awọn aye tuntun ni apejọ awọn genomes eka, gẹgẹbi awọn ti o ni heterozygosity giga, ipin giga ti awọn agbegbe atunwi, polyploids, bbl ipinnu awọn eroja ti atunwi, awọn agbegbe pẹlu awọn akoonu GC ajeji ati awọn agbegbe eka miiran ti o ga julọ.
Platform: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48/ Illumina NovaSeq Platform
-
Eda Eniyan Gbogbo Exome Sequencing
Odidi exome sequencing (WES) ni a gba bi ilana itọsẹ ti o ni iye owo fun idamo awọn iyipada ti o nfa arun.Botilẹjẹpe awọn exons nikan gba to 1.7% ti gbogbo genome, o duro fun profaili ti awọn iṣẹ amuaradagba lapapọ taara.Ninu jiini eniyan, o ti royin pe diẹ sii ju 85% ti awọn iyipada ti o ni ibatan arun waye ni agbegbe ifaminsi amuaradagba.
BMKGENE nfunni ni okeerẹ ati irọrun eniyan gbogbo awọn iṣẹ ṣiṣe atẹle exome pẹlu oriṣiriṣi awọn ilana yiya exon ti o wa lati pade ọpọlọpọ awọn ibi-afẹde iwadii.
Platform: Illumina NovaSeq Platform
-
Itọpa-apakan Iṣatunṣe Ibi-Pato-Pato (SLAF-Seq)
Genotyping ti o ga-giga, paapaa lori iye eniyan ti o tobi, jẹ igbesẹ ipilẹ ninu awọn iwadii ẹgbẹ jiini, eyiti o pese ipilẹ jiini fun wiwa jiini iṣẹ, itupalẹ itankalẹ, ati bẹbẹ lọ Dipo ti o jinlẹ gbogbo genome tun-tẹle, idinku oniduro genome sequencing (RRGS) ) ti ṣe afihan lati dinku iye owo itọka fun apẹẹrẹ, lakoko ti o ṣetọju ṣiṣe ti o ni oye lori wiwa asami jiini.Eyi ni a ṣe aṣeyọri nigbagbogbo nipa yiyọkuro ajẹku ihamọ laarin iwọn iwọn ti a fun, eyiti o jẹ orukọ ile-ikawe aṣoju idinku (RRL).Itọpa-apakan-ipo kan pato (SLAF-Seq) jẹ ilana ti ara ẹni ti o dagbasoke fun SNP genotyping pẹlu tabi laisi jiini itọkasi kan.
Platform: Illumina NovaSeq Platform
