Ohun ọgbin / Animal Gbogbo Jiome Sequencing
1.Service Anfani
Iriri ti o gbooro ni tito-ara-ara-ara fun awọn ẹya 1000 ti o ju.
Ju awọn ọran 800 ti a tẹjade pẹlu ipin ipa ikojọpọ ti o ju 4000 lọ.
Itupalẹ bioinformatics okeerẹ lori pipe iyatọ ati itupalẹ iṣẹ.
2. Iṣẹ pato
| Platform | Ile-ikawe | Niyanju ijinle atele | |
| Illumina | PE 150 | Fun SNP, InDel pipe ≥ 10x Fun SV, CNY pipe ≥ 30x
| |
| Nanopore
| 8 kb | Fun SV, CNY pipe ≥ 20x | |
| Pacbio | CCS | 15 kb | Fun SNP, InDel, SV, CNY pipe ≥ 10x |
3. Awọn ibeere ayẹwo
| Platform | Konc.(ng/μL)
| Iye (ng)
| Mimo
| Agarose jeli
| ||
| OD260/280 | OD260/230 | 1. Ko akọkọ iye pẹlu ko si tabi lopinibajẹ ti a ṣe akiyesi lori gel. 2. Ko si tabi lopin RNA tabi amuaradagba koti
| ||||
| Illumina | ≥1 | ≥30
| - | - | ||
| Nanopore
| ≥30 | Da lori ikore data 10μg / sẹẹli | 1.7-2.2 | ≥1.5 | ||
| Pacbio | CCS | ≥50 | 1.7-2.2 | 1.8-2.5 | ||
4. Bioinformation Analysis
5. Sisan Iṣẹ Iṣẹ
Ifijiṣẹ apẹẹrẹ
DNA isediwon
Ikole ìkàwé
Titele
Itupalẹ data
Ifijiṣẹ data
1) Awọn iṣiro ti Jinomi Mapping
Table 1 Statistics ti ìyàwòrán esi
Ṣe nọmba 1 Pipin iwọn ifibọ ati kika agbegbe.
2) Iwari iyatọ
Ṣe nọmba 2 Awọn iṣiro ati asọye ti SNP/INDEL/SV laarin Awọn ayẹwo
olusin 3 Genome-jakejado pinpin vatiations
3) Apejuwe iṣẹ-ṣiṣe ti awọn iyatọ
| 2019 | Awọn ibaraẹnisọrọ iseda | Itọpa-pipalẹ-jiomeji ṣe afihan ipilẹṣẹ Brassica napus ati loci jiini ti o ni ipa ninu ilọsiwaju rẹ |
| 2020 | PNAS | Ipilẹṣẹ itankalẹ ati itan-akọọlẹ ile ti ẹja goolu (Carassius auratus) |
| 2021 | Eweko Biotechnology akosile | Awọn genomes itọkasi ti awọn eya jute meji ti a gbin |
| 2021 | Eweko Biotechnology akosile | Awọn ibuwọlu genomic ti ẹfọ ati awọn irugbin epo allopolyploid Brassicajuncea ati loci jiini ti n ṣakoso ikojọpọ ti awọn glucosinolates |
| 2019 | Ohun ọgbin Molecular | Odidi-jinomii ti o tẹle ti ikojọpọ jakejado agbaye ti awọn ifipabanilopo irugbin ṣe afihan ipilẹ jiini ti iyatọ ecotype wọn |
| 2022 | Iwadi Horticulture | Ṣiṣayẹwo ẹgbẹ jakejado-genome n pese awọn oye molikula sinu iyatọ adayeba ti iwọn irugbin elegede |
| 2021 | Iwe akosile ti Botany Experimental | Iwadi ẹgbẹ jakejado Genome ṣe idanimọ awọn iyatọ ti GhSAD1 ti n funni ni ifarada tutu ni owu |
| 2021 | Iwe akosile ti Botany Experimental | Iwadi ẹgbẹ jakejado Genome ati lafiwe transcriptome ṣe afihan aramada QTL ati awọn jiini oludije ti o ṣakoso iwọn petal ni irugbin ifipabanilopo |
