Nanopore-ipari Tiranscriptome Sequencing ni kikun-gigun
Ilana Nanopore ṣe iyatọ si ararẹ lati awọn iru ẹrọ atẹle miiran, ni pe a ka awọn nucleotides taara laisi iṣelọpọ DNA ati ṣe ipilẹṣẹ kika gigun ni mewa ti kilobases.Eyi n fun ni agbara kika-taara ti awọn iwe afọwọkọ ipari-kikun ati koju awọn italaya ni awọn ikẹkọ transcriptomic.
√ Iyatọ-ipin-ni-tẹle kekere
√ Iwe kika ipari-kikun ti cDNA si fun awọn ẹkọ igbekalẹ apilẹṣẹ
√ Awọn data ti o kere ju nilo lati bo nọmba kanna ti awọn iwe afọwọkọ
√ Idanimọ ti ọpọ isoforms fun pupọ
√ Iwọn ikosile lori ipele isoform
Aṣoju Pipeline Bioinformatics
Awọn ọran Aṣeyọri Tuntun pẹlu Awọn Imọ-ẹrọ Biomarker
1. Awọn itupalẹ afiwera ti awọn iwe-kikun ni kikun ṣe afihan Gnetum luofuense stem awọn agbara idagbasoke idagbasoke
Iwe akosile: Awọn iwaju ni Genetics
Atejade: Oṣu Kẹta ọdun 2021
Koko: MinION |Yiyan splicing |APA |lncRNA |Awọn iwe afọwọkọ ti a fihan ni iyatọ
Ka ni kikun-ọrọ
2. Iṣipopada unidirectional ti awọn RNA kekere lati awọn abereyo si awọn gbongbo ni awọn heterografts interspecific
Iwe akosile: Awọn ohun ọgbin iseda
Atejade: Jan. 2021
Koko: Nanopore |Illumina |wiwa mRNA alagbeka gigun ni kikun
3. Ayẹwo transcriptome gigun ni kikun ti awọn gbongbo asparagus ṣe afihan ilana molikula ti ifarada iyọ ti o fa nipasẹ awọn elu mycorrhizal arbuscular
Akosile: Ayika ati Ese idanwo
Atejade: Jan. 2021
Koko: MinION |Awọn iwe afọwọkọ ti a fihan ni iyatọ |Awọn ifosiwewe transcription |Yiyan splicing
4. Awọn Ayipada Ẹda Ẹda ati Tiransikiripiti Gigun Gigun ti Rose (Rosa chinensis) Awọn gbongbo ati Awọn leaves ni Idahun si Wahala Ogbele
Iwe akosile: Ohun ọgbin ati Ẹkọ-ara sẹẹli
Atejade: Oṣu Kẹwa 2020
Koko: PromethION |Awọn iwe afọwọkọ ti a fihan ni iyatọ |Asọtẹlẹ iṣẹ-ṣiṣe |Spliced isoforms |TF ati lncRNA
5. Itupalẹ ati lafiwe okeerẹ ti PacBio ati ilana RNA ti o da lori nanopore ti transcriptome Arabidopsis
Iwe akosile: Ọna ọgbin
Atejade: Oṣu Kẹrin Ọjọ 2020
Koko: GridION |PromethION |PacBio Sequel |Illumina NovaSeq |Titete Jiini |Tiransikiripiti idanimọ |Yiyan splicing |SSR |LncRNA |Isoform quantification
News ati Ifojusi ifọkansi ni pinpin awọn ọran aṣeyọri tuntun pẹlu Awọn imọ-ẹrọ Biomarker, yiya awọn aṣeyọri imọ-jinlẹ aramada bi daradara bi awọn ilana olokiki ti a lo lakoko iwadii naa.
Akoko ifiweranṣẹ: Jan-08-2022