-
BSA
באַלקעד סעגרעגאַנט אַנאַליסיס פּלאַטפאָרמע באשטייט פון איין-שריט נאָרמאַל אַנאַליסיס און אַוואַנסירטע אַנאַליסיס מיט קאַסטאַמייזד פּאַראַמעטער באַשטעטיקן.BSA איז אַ טעכניק געניצט צו געשווינד ידענטיפיצירן פענאָטיפּע פֿאַרבונדן גענעטיק מאַרקערס.הויפּט וואָרקפלאָוו פון BSA כּולל: 1. סעלעקטינג צוויי גרופּעס פון מענטשן מיט גאָר אַפּאָוזינג פענאָטיפּעס;2. פּולינג די דנאַ, רנאַ אָדער SLAF-סעק (דעוועלאָפּעד דורך ביאָמאַרקער) פון אַלע מענטשן צו פאָרעם צוויי פאַרנעם פון דנאַ;3. ידענטיפיצירן דיפערענטשאַל סיקוואַנסיז קעגן רעפֿערענץ גענאָמע אָדער אין צווישן, 4. פּרידיקטינג קאַנדידאַט לינגקט מקומות דורך עד און סנפּ אינדעקס אַלגערידאַם;5. פאַנגקשאַנאַל אַנאַליסיס און ענריטשמענט אויף גענעס אין קאַנדידאַט מקומות, אאז"ו ו. מער אַוואַנסירטע מיינינג אין דאַטן אַרייַנגערעכנט גענעטיק מאַרקער זיפּונג און אָנפאַנגער פּלאַן זענען אויך בנימצא.
-
אַמפּליקאָן (16S/18S/ITS)
Amplicon (16S/18S/ITS) פּלאַטפאָרמע איז דעוועלאָפּעד מיט יאָרן פון דערפאַרונג אין מיקראָביאַל דייווערסיטי פּרויעקט אַנאַליסיס, וואָס כּולל סטאַנדערדייזד יקערדיק אַנאַליסיס און פערזענליכען אַנאַליסיס: יקערדיק אַנאַליסיס קאָווערס די מיינסטרים אַנאַליסיס אינהאַלט פון קראַנט מייקראָוביאַל פאָרשונג, די אַנאַליסיס אינהאַלט איז רייַך און פולשטענדיק, און אַנאַליסיס רעזולטאַטן זענען דערלאנגט אין די פאָרעם פון פּרויעקט ריפּאָרץ;דער אינהאַלט פון פערזענליכען אַנאַליסיס איז דייווערס.סאַמפּאַלז קענען זיין אויסגעקליבן און פּאַראַמעטערס קענען זיין שטעלן פלעקסאַבאַל לויט די גרונט אַנאַליסיס באַריכט און פאָרשונג ציל, צו פאַרשטיין פערזענליכען רעקווירעמענץ.Windows אָפּערייטינג סיסטעם, פּשוט און שנעל.
-
עוואָלוטיאָנאַרי גענעטיקס
עוואָלוטיאָנאַרי דזשאַנעטיקס איז אַ פּאַקט סיקוואַנסינג דינסט דיזיינד פֿאַר פּראַוויידינג אַ פולשטענדיק ינטערפּריטיישאַן אויף עוואָלוטיאָנאַרי אינפֿאָרמאַציע פון געגעבן מאַטעריאַלס באזירט אויף גענעטיק ווערייישאַנז, אַרייַנגערעכנט SNPs, InDels, SVs און CNVs.עס גיט אַלע פונדאַמענטאַל אַנאַליסיס פארלאנגט פֿאַר דיסקרייבינג עוואָלוטיאָנאַרי ענדערונגען און גענעטיק פֿעיִקייטן פון פּאַפּיאַליישאַנז, אַזאַ ווי באַפעלקערונג סטרוקטור, גענעטיק דייווערסיטי, פילאָגעני שייכות, אאז"ו ו עס אויך כּולל שטודיום אויף דזשין לויפן, וואָס ימפּאַוערז אָפּשאַצונג פון עפעקטיוו באַפעלקערונג גרייס, דייווערדזשאַנס צייט.
-
קאָמפּאַראַטיווע גענאָמיקס
קאָמפּאַראַטיווע גענאָמיקס ממש מיטל קאַמפּערינג די גאַנץ גענאָמע סיקוואַנסיז און סטראַקטשערז פון פאַרשידענע מינים.דער דיסציפּלין יימז צו אַנטדעקן מינים עוואָלוציע, דזשין פונקציע, דזשין רעגולאַטאָרי מעקאַניזאַם אויף גענאָמע מדרגה דורך ידענטיפיצירן די סיקוואַנס סטראַקטשערז און עלעמענטן וואָס קאַנסערווד אָדער דיפערענשיייטאַד צווישן פאַרשידענע מינים.טיפּיש קאָמפּאַראַטיווע גענאָמיקס לערנען כולל אַנאַליזעס אין דזשין משפּחה, עוואָלוטיאָנאַרי אַנטוויקלונג, גאַנץ גענאָמע דופּליקיישאַן, סעלעקטיוו דרוק, עטק.
-
עוואָלוטיאָנאַרי גענעטיקס
באַפעלקערונג און עוואָלוטיאָנאַרי גענעטיק אַנאַליסיס פּלאַטפאָרמע איז געגרינדעט אויף באַזע פון מאַסיוו דערפאַרונג אַקיומיאַלייטיד אין BMK R&D מאַנשאַפֿט פֿאַר יאָרן.עס איז אַ באַניצער-פרייַנדלעך געצייַג ספּעציעל פֿאַר ריסערטשערז וואָס זענען נישט מאַדזשאָרינג אין ביאָינפאָרמאַטיקס.דער פּלאַטפאָרמע ינייבאַלז יקערדיק עוואָלוטיאָנאַרי דזשאַנעטיקס פֿאַרבונדענע יקערדיק אַנאַליסיס אַרייַנגערעכנט פילאָגענעטיק בוים קאַנסטראַקשאַן, לינגקאַדזש דיסעקוויליבריום אַנאַליסיס, גענעטיק דייווערסיטי אַסעסמאַנט, סעלעקטיוו ויסקערן אַנאַליסיס, משפּחה אַנאַליסיס, פּקאַ, באַפעלקערונג סטרוקטור אַנאַליסיס, עטק.
-
Hi-C באזירט גענאָמע אַסעמבלי
Hi-C איז אַ מעטאָד דיזיינד צו כאַפּן כראָמאָסאָם קאַנפיגיעריישאַן דורך קאַמביינינג פּראָובינג פּראַקסימאַטי-באזירט ינטעראַקשאַנז און הויך-טרופּוט סיקוואַנסינג.די ינטענסיטי פון די ינטעראַקשאַנז איז געגלויבט צו זיין נעגאַטיוולי קאָראַלייטאַד מיט גשמיות דיסטאַנסע אויף טשראָמאָסאָומז.דעריבער, Hi-C דאַטן קען פירן די קלאַסטערינג, אָרדערינג און אָריענטירונג פון אַסעמבאַלד סיקוואַנסיז אין אַ פּלאַן גענאָמע און אַנגקערינג די אויף אַ זיכער נומער פון טשראָמאָסאָומז.די טעכנאָלאָגיע ימפּאַוערז אַ כראָמאָסאָם-מדרגה גענאָמע פֿאַרזאַמלונג אין פעלן פון באַפעלקערונג-באזירט גענעטיק מאַפּע.יעדער גענאָמע דאַרף אַ Hi-C.
פּלאַטפאָרמע: Illumina NovaSeq Platform / DNBSEQ
-
פּלאַנט / כייַע די נאָוואָ גענאָמע סיקוואַנסינג
די נאָוואָסיקוואַנסינג רעפערס צו קאַנסטראַקשאַן פון אַ גאַנץ גענאָמע פון אַ מינים ניצן סיקוואַנסינג טעקנאַלאַדזשיז, למשל PacBio, Nanopore, NGS, אאז"ו ו, אין פעלן פון אַ רעפֿערענץ גענאָמע.די מערקווירדיק פֿאַרבעסערונג אין לייענען לענג פון דריט דור סיקוואַנסינג טעקנאַלאַדזשיז האט געבראכט נייַע אַפּערטונאַטיז אין אַסעמבאַלינג קאָמפּלעקס גענאָמעס, אַזאַ ווי די מיט הויך העטעראָזיגאָסיטי, הויך פאַרהעלטעניש פון ריפּעטיטיוו מקומות, פּאָליפּלאָידס, אאז"ו ו. ריזאַלווינג פון ריפּעטיטיוו עלעמענטן, מקומות מיט אַבנאָרמאַל גק אינהאַלט און אנדערע העכסט קאָמפּלעקס מקומות.
פּלאַטפאָרמע: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Illumina NovaSeq Platform
-
מענטש גאַנץ עקסאָמע סיקוואַנסינג
גאַנץ עקסאָמע סיקוואַנסינג (WES) איז גערעכנט ווי אַ קאָס-עפעקטיוו סיקוואַנסינג סטראַטעגיע פֿאַר ידענטיפיינג קרענק-קאָזינג מיוטיישאַנז.כאָטש עקסאָנס נעמען בלויז בעערעך 1.7% פון די גאנצע גענאָמע, עס רעפּראַזענץ די פּראָפיל פון גאַנץ פּראָטעין פאַנגקשאַנז גלייַך.אין מענטש גענאָמע, עס איז געווען געמאלדן אַז מער ווי 85% פון קרענק פֿאַרבונדענע מיוטיישאַנז פאַלן אין פּראָטעין קאָודינג געגנט.
BMKGENE אָפפערס פולשטענדיק און פלעקסאַבאַל מענטש גאַנץ עקסאָמע סיקוואַנסינג באַדינונגס מיט פאַרשידענע עקסאָן קאַפּטשערינג סטראַטעגיעס בנימצא צו טרעפן פאַרשידן פאָרשונג גאָולז.
פּלאַטפאָרמע: Illumina NovaSeq Platform
-
ספּעציפיש לאָקוס אַמפּלאַפייד פראַגמענט סיקוואַנסינג (SLAF-Seq)
גענאָטיפּינג מיט הויך-דורכקייט, ספּעציעל אויף גרויס-וואָג באַפעלקערונג, איז אַ פונדאַמענטאַל שריט אין גענעטיק פאַרבאַנד שטודיום, וואָס גיט גענעטיק יקער פֿאַר פאַנגקשאַנאַל דזשין ופדעקונג, עוואָלוטיאָנאַרי אַנאַליסיס, עטק. ) איז ינטראָודוסט צו מינאַמייז סיקוואַנסינג קאָס פּער מוסטער, און האַלטן אַ גלייַך עפעקטיווקייַט אויף גענעטיק מאַרקער ופדעקונג.דעם איז קאַמאַנלי אַטשיווד דורך יקסטראַקטינג ריסטריקשאַן פראַגמענט אין אַ געגעבן גרייס קייט, וואָס איז גערופֿן רידוסט פאַרטרעטונג ביבליאָטעק (רל).ספּעציפֿיש-לאָקוס אַמפּלאַפייד פראַגמענט סיקוואַנסינג (SLAF-Seq) איז אַ זיך-דעוועלאָפּעד סטראַטעגיע פֿאַר SNP גענאָטיפּינג מיט אָדער אָן אַ רעפֿערענץ גענאָמע.
פּלאַטפאָרמע: Illumina NovaSeq Platform -
Illumina און BGI
Illumina סיקוואַנסינג טעכנאָלאָגיע, באזירט אויף סיקוואַנסינג דורך סינטעז (SBS), איז אַ גלאָובאַלי עמברייסט NGS כידעש, פאַראַנטוואָרטלעך פֿאַר דזשענערייטינג איבער 90% פון די וועלט 'ס סיקוואַנסינג דאַטן.דער פּרינציפּ פון SBS ינוואַלווז ימאַגינג פלואָרעססענטלי לייבאַלד ריווערסאַבאַל טערמינאַטאָרס ווי יעדער דנטפּ איז מוסיף, און דערנאָך קלעאַוועד צו לאָזן די ינקאָרפּעריישאַן פון דער ווייַטער באַזע.מיט אַלע פיר ריווערסאַבאַל טערמינאַטאָר-געבונדן דנטפּס פאָרשטעלן אין יעדער סיקוואַנסינג ציקל, נאַטירלעך פאַרמעסט מינאַמייזיז ינקאָרפּעריישאַן פאָרורטייל.די ווערסאַטאַל טעכנאָלאָגיע שטיצט ביידע איין-לייענען און פּערד-סוף לייברעריז, קייטערינג צו אַ קייט פון גענאָמיק אַפּלאַקיישאַנז.די הויך-דורכקייט קייפּאַבילאַטיז און פּינטלעכקייט פון Illumina סיקוואַנסינג שטעלן עס ווי אַ קאָרנערסטאָון אין גענאָמיקס פאָרשונג, ימפּאַוערינג סייאַנטיס צו אַנראַוואַל די ינטראַקאַסיז פון גענאָמעס מיט אַ גלייַכן דעטאַל און עפעקטיווקייַט.
DNBSEQ, דעוועלאָפּעד דורך BGI, איז אן אנדער ינאַווייטיוו NGS טעכנאָלאָגיע וואָס האט געראטן צו פאַרמינערן ווייַטער אַראָפּ די סיקוואַנסינג קאָס און פאַרגרעסערן טרופּוט.צוגרייטונג פון DNBSEQ לייברעריז ינוואַלווז דנאַ פראַגמאַנטיישאַן, צוגרייטונג פון ssDNA און ראָולינג קרייַז אַמפּלאַפאַקיישאַן צו באַקומען די דנאַ נאַנאָבאָלז (דנב).די זענען דעמאָלט לאָודיד אַנטו אַ האַרט ייבערפלאַך און דערנאָך סיקוואַנסעד דורך קאָמבינאַטאָריאַל פּראָבע-אַנקער סינטעז (קפּאַס).
אונדזער פאַר-געמאכט ביבליאָטעק סיקוואַנסינג דינסט פאַסילאַטייץ קאַסטאַמערז אין פּריפּערינג זייער סיקוואַנסינג לייברעריז פֿון דייווערס קוואלן (מרנאַ, גאַנץ גענאָמע, אַמפּליקאָן, צווישן אנדערע).דערנאָך, די לייברעריז קענען זיין שיפּט צו אונדזער סיקוואַנסינג סענטערס פֿאַר קוואַליטעט קאָנטראָל און סיקוואַנסינג אין Illumina אָדער BGI פּלאַטפאָרמס.
