-
PacBio-גאַנץ-לענג 16S/18S/ITS אַמפּליקאָן סיקוואַנסינג
Amplicon (16S/18S/ITS) פּלאַטפאָרמע איז דעוועלאָפּעד מיט יאָרן פון דערפאַרונג אין מיקראָביאַל דייווערסיטי פּרויעקט אַנאַליסיס, וואָס כּולל סטאַנדערדייזד יקערדיק אַנאַליסיס און פערזענליכען אַנאַליסיס: יקערדיק אַנאַליסיס קאָווערס די מיינסטרים אַנאַליסיס אינהאַלט פון קראַנט מייקראָוביאַל פאָרשונג, די אַנאַליסיס אינהאַלט איז רייַך און פולשטענדיק, און אַנאַליסיס רעזולטאַטן זענען דערלאנגט אין די פאָרעם פון פּרויעקט ריפּאָרץ;דער אינהאַלט פון פערזענליכען אַנאַליסיס איז דייווערס.סאַמפּאַלז קענען זיין אויסגעקליבן און פּאַראַמעטערס קענען זיין שטעלן פלעקסאַבאַל לויט די גרונט אַנאַליסיס באַריכט און פאָרשונג ציל, צו פאַרשטיין פערזענליכען רעקווירעמענץ.Windows אָפּערייטינג סיסטעם, פּשוט און שנעל.
-
PacBio-גאַנץ-לענג טראַנסקריפּטאָמע (ניט-רעפֿערענץ)
מיט פּאַסיפיק ביאָססיענסעס (PacBio) יסאָפאָרם סיקוואַנסינג דאַטן ווי אַרייַנשרייַב, די אַפּ איז ביכולת צו ידענטיפיצירן פול-לענג טראַנסקריפּט סיקוואַנסיז (אָן פֿאַרזאַמלונג).דורך מאַפּינג פול-לענג סיקוואַנסיז קעגן רעפֿערענץ גענאָמע, טראַנסקריפּץ קענען זיין אָפּטימיזעד דורך באקאנט גענעס, טראַנסקריפּץ, קאָדירונג מקומות, אאז"ו ו. אין דעם פאַל, מער פּינטלעך לעגיטימאַציע פון מרנאַ סטראַקטשערז, אַזאַ ווי אָלטערנאַטיוו ספּלייינג, עטק, קענען זיין אַטשיווד.שלאָס אַנאַליסיס מיט NGS טראַנסקריפּטאָמע סיקוואַנסינג דאַטן ינייבאַלז מער פולשטענדיק אַנאָטאַציע און מער פּינטלעך קוואַנטאַפאַקיישאַן אין אויסדרוק אויף טראַנסקריפּט מדרגה, וואָס לאַרגעלי בענעפיץ דאַונסטרים דיפערענטשאַל אויסדרוק און פאַנגקשאַנאַל אַנאַליסיס.
-
מכשירים
BMKCloud איז אַ לידינג ביאָינפאָרמאַטיק פּלאַטפאָרמע פּראַוויידינג איין-האַלטן לייזונג פֿאַר גענאָמיק מגילה, וואָס איז וויידלי טראַסטיד דורך ריסערטשערז אין פאַרשידן ארענע אַרייַנגערעכנט מעדיציניש, לאַנדווירטשאַפטלעך, ינווייראַנמענאַל, אאז"ו ו. , קאַמפּיוטינג רעסורסן, עפנטלעך דאַטאַבייס, ביאָינפאָרמטיק אָנליין קאָרסאַז, אאז"ו ו אַנאַליסיס, אאז"ו ו.
-
קליין רנאַ
קליין רנאַ זענען טיפּ פון קורץ ניט-קאָדינג רנאַ מיט אַ דורכשניטלעך לענג פון 18-30 נט, אַרייַנגערעכנט מירנאַ, סירנאַ און פּירנאַ.די קליין רנאַ זענען מאַסיוולי רעפּאָרטעד צו זיין ינוואַלווד אין פאַרשידן בייאַלאַדזשיקאַל פּראַסעסאַז אַזאַ ווי מרנאַ דערנידעריקונג, איבערזעצונג ינאַבישאַן, העטעראָטשראָמאַטין פאָרמירונג, אאז"ו ו סיקוואַנסינג אַנאַליסיס פּלאַטפאָרמע באשטייט פון נאָרמאַל אַנאַליסיס און אַוואַנסירטע דאַטן מיינינג.אויף די באַזע פון רנאַ-סיק דאַטן, נאָרמאַל אַנאַליסיס קענען דערגרייכן מירנאַ לעגיטימאַציע און פּראָגנאָז, מירנאַ ציל דזשין פּראָגנאָז, אַנאָטאַציע און אויסדרוק אַנאַליסיס.אַוואַנסירטע אַנאַליסיס ינייבאַלז קאַסטאַמייזד מירנאַ זוכן און יקסטראַקשאַן, Venn דיאַגראַמע דור, מירנאַ און ציל דזשין נעץ בנין.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS איז אַ גאַנץ גענאָמע שייַעך-סיקוואַנסינג אַנאַליסיס פּלאַטפאָרמע, וואָס איז דעוועלאָפּעד אויף דער באַזע פון רייך דערפאַרונג אין Biomarker Technologies.די יז-צו-נוצן פּלאַטפאָרמע אַלאַוז שנעל סאַבמישאַן פון אַ ינאַגרייטיד אַנאַליסיס וואָרקפלאָוו דורך פשוט באַשטעטיקן אַ ביסל יקערדיק פּאַראַמעטער, וואָס פּאַסיק פֿאַר דנאַ סיקוואַנסינג דאַטן דזשענערייטאַד פֿון ביידע Illumina פּלאַטפאָרמע און BGI סיקוואַנסינג פּלאַטפאָרמע.דער פּלאַטפאָרמע איז דיפּלויד אויף הויך פאָרשטעלונג קאַמפּיוטינג סערווער, וואָס ימפּאַוערז העכסט עפעקטיוו דאַטן אַנאַליסיס אין זייער לימיטעד צייט.פערזענליכען דאַטן מיינינג איז בנימצא אויף די באַזע פון נאָרמאַל אַנאַליסיס, אַרייַנגערעכנט מיוטייטיד דזשין אָנפֿרעג, פּקר אָנפאַנגער פּלאַן, עטק.
-
mRNA (רעפערענץ)
טראַנסקריפּטאָמע איז דער פֿאַרבינדונג צווישן גענאָמיק גענעטיק אינפֿאָרמאַציע און די פּראָטעאָמע פון בייאַלאַדזשיקאַל פונקציע.רעגולירן טראַנסקריפּציע מדרגה איז די מערסט וויכטיק און די מערסט וויידלי געלערנט רעגולירן מאָדע פון אָרגאַניזאַמז.טראַנסקריפּטאָמע סיקוואַנסינג קענען סיקוואַנס די טראַנסקריפּטאָמע אין קיין צייט אָדער אונטער קיין צושטאַנד, מיט אַ האַכלאָטע פּינטלעך צו אַ איין נוקלעאָטידע. מוסטער ספּעציפיש טראַנסקריפּץ.
דערווייַל, טראַנסקריפּטאָמע סיקוואַנסינג טעכנאָלאָגיע איז וויידלי געניצט אין אַגראָנאָמיע, מעדיצין און אנדערע פאָרשונג פעלדער, אַרייַנגערעכנט כייַע און פאַבריק אַנטוויקלונג רעגולירן, ינווייראַנמענאַל אַדאַפּטיישאַן, ימיון ינטעראַקשאַן, דזשין לאָוקאַלאַזיישאַן, מינים גענעטיק עוואָלוציע און דיטעקשאַן פון אָנוווקס און גענעטיק קרענק.
-
מעטאַגענאָמיקס (NGS)
די אַנאַליסיס פּלאַטפאָרמע איז דיזיינד פֿאַר שאַטגאַן מעטאַגענאָמיק דאַטן אַנאַליסיס אויף אַ באַזע פון יאָרן פון דערפאַרונג.עס באשטייט ינאַגרייטיד וואָרקפלאָוו מיט פאַרשידן קאַמאַנלי נויטיק מעטאַגענאָמיקס אַנאַליזעס אַרייַנגערעכנט דאַטן פּראַסעסינג, מינים-מדרגה שטודיום, דזשין פונקציאָנירן-מדרגה שטודיום, מעטאַגענאָמע בינינג, אאז"ו ו , פּאַראַמעטער באַשטעטיקן, פערזענליכען פיגור דזשענערייטינג, עטק.
-
LncRNA
לאנג ניט-קאָדינג רנאַ (לנקרנאַ) זענען אַ טיפּ פון טראַנסקריפּץ מיט לענג מער ווי 200 נט, וואָס קענען נישט קאָד פּראָטעינס.אַקיומיאַלאַטיוו זאָגן סאַגדזשעסץ אַז רובֿ פון lncRNAs זענען זייער מסתּמא צו זיין פאַנגקשאַנאַל.סיקוואַנסינג טעקנאַלאַדזשיז מיט הויך-טראַפּוט און ביאָינפאָרמאַטיק אַנאַלייזינג מכשירים ימפּאַוער אונדז צו אַנטדעקן lncRNA סיקוואַנסיז און פּאַזישאַנינג אינפֿאָרמאַציע מער יפישאַנטלי און פירן אונדז צו אַנטדעקן lncRNAs מיט קריטיש רעגולאַטאָרי פאַנגקשאַנז.BMKCloud איז שטאָלץ צו צושטעלן אונדזער קאַסטאַמערז לנקרנאַ סיקוואַנסינג אַנאַליסיס פּלאַטפאָרמע צו דערגרייכן שנעל, פאַרלאָזלעך און פלעקסאַבאַל לנקרנאַ אַנאַליסיס.
-
GWAS
גענאָמע-ברייט פאַרבאַנד לערנען (GWAS) יימז צו ידענטיפיצירן גענעטיק וועריאַנץ (גענאָטיפּע) וואָס איז פארבונדן מיט ספּעציפיש טרייץ (פענאָטיפּע).GWA שטודיום ינוועסטאַגייץ גענעטיק מאַרקערס קרייַז גאַנץ גענאָמע פון גרויס נומער פון מענטשן און פּרידיקס גענאָטיפּע-פענאָטיפּע אַסאָוסייישאַנז דורך סטאַטיסטיש אַנאַליסיס אין באַפעלקערונג מדרגה.גאַנץ דזשינאָום ריסעקווענסינג קענען פּאַטענטשאַלי אַנטדעקן אַלע גענעטיק וועריאַנץ.קאַפּלינג מיט פענאָטיפּיק דאַטן, GWAS קענען זיין פּראַסעסט צו ידענטיפיצירן פענאָטיפּע פֿאַרבונדענע סנפּס, QTLs און קאַנדידאַט גענעס, וואָס שטארק באַקס אַרויף מאָדערן כייַע / פאַבריק ברידינג.SLAF איז אַ זיך-דעוועלאָפּעד סימפּלאַפייד גענאָמע סיקוואַנסינג סטראַטעגיע, וואָס דיסקאַווערז גענאָמע-ברייט פונאנדערגעטיילט מאַרקערס, SNP.די סנפּס, ווי מאָלעקולאַר גענעטיק מאַרקערס, קענען זיין פּראַסעסט פֿאַר אַססאָסיאַטיאָן שטודיום מיט טאַרגעטעד טרייץ.עס איז אַ קאָסט-עפעקטיוו סטראַטעגיע צו ידענטיפיצירן קאָמפּלעקס טרייץ פֿאַרבונדן גענעטיק ווערייישאַנז.
-
נאַנאָפּאָרע גאַנץ-לענג טראַנסקריפּטאָמיקס
קאָמפּלעקס און בייַטעוודיק אָלטערנאַטיוו יסאָפאָרמס אין אָרגאַניזאַמז זענען וויכטיק גענעטיק מעקאַניזאַמז פֿאַר רעגיאַלייטינג דזשין אויסדרוק און פּראָטעין דייווערסיטי.פּינטלעך לעגיטימאַציע פון טראַנסקריפּט סטראַקטשערז איז די יקער פֿאַר טיף לערנען פון דזשין אויסדרוק רעגולירן פּאַטערנז.נאַנאָפּאָרע סיקוואַנסינג פּלאַטפאָרמע האט הצלחה געבראכט טראַנסקריפּטאָמיק לערנען צו יסאָפאָרם-מדרגה.די אַנאַליסיס פּלאַטפאָרמע איז דיזיינד צו פונאַנדערקלייַבן RNA-Seq דאַטן דזשענערייטאַד אויף נאַנאָפּאָרע פּלאַטפאָרמע באזירט אויף רעפֿערענץ גענאָמע, וואָס אַטשיווז קוואַליטאַטיווע און קוואַנטיטאַטיווע אַנאַליזעס אין ביידע דזשין מדרגה און טראַנסקריפּץ מדרגה.
-
סיר-רנאַ
סירקולאַר רנאַ (סיררנאַ) איז אַ טיפּ פון ניט-קאָדינג רנאַ, וואָס איז לעצטנס געפונען צו שפּילן וויטאַל ראָלע אין רעגולאַטאָרי נעטוואָרקס ינוואַלווד אין דעוועלאָפּינג, ינווייראַנמענאַל קעגנשטעל, אאז"ו ו ענדס פון סיררנאַ זענען דזשוינד צוזאַמען צו פאָרעם אַ קייַלעכיק סטרוקטור, וואָס ראַטעווען זיי פון דיידזשעסטשאַן פון עקסאָנוקלעאַסע און זענען מער סטאַביל ווי רובֿ פון לינעאַר רנאַ.סירקרנאַ האָבן שוין געפֿונען פאַרשידן פאַנגקשאַנז אין רעגיאַלייטינג דזשין אויסדרוק.CircRNA קענען דורכפירן ווי סערנאַ, וואָס ביינדז מירנאַ קאַמפּעטיטיוו, באקאנט ווי מירנאַ שוואָם.CircRNA סיקוואַנסינג אַנאַליסיס פּלאַטפאָרמע ימפּאַוערז סעררנאַ סטרוקטור און אויסדרוק אַנאַליסיס, ציל פאָרויסזאָגן און שלאָס אַנאַליסיס מיט אנדערע טייפּס פון רנאַ מאַלאַקיולז
-
BSA
באַלקעד סעגרעגאַנט אַנאַליסיס פּלאַטפאָרמע באשטייט פון איין-שריט נאָרמאַל אַנאַליסיס און אַוואַנסירטע אַנאַליסיס מיט קאַסטאַמייזד פּאַראַמעטער באַשטעטיקן.BSA איז אַ טעכניק געניצט צו געשווינד ידענטיפיצירן פענאָטיפּע פֿאַרבונדן גענעטיק מאַרקערס.הויפּט וואָרקפלאָוו פון BSA כּולל: 1. סעלעקטינג צוויי גרופּעס פון מענטשן מיט גאָר אַפּאָוזינג פענאָטיפּעס;2. פּולינג די דנאַ, רנאַ אָדער SLAF-סעק (דעוועלאָפּעד דורך ביאָמאַרקער) פון אַלע מענטשן צו פאָרעם צוויי פאַרנעם פון דנאַ;3. ידענטיפיצירן דיפערענטשאַל סיקוואַנסיז קעגן רעפֿערענץ גענאָמע אָדער אין צווישן, 4. פּרידיקטינג קאַנדידאַט לינגקט מקומות דורך עד און סנפּ אינדעקס אַלגערידאַם;5. פאַנגקשאַנאַל אַנאַליסיס און ענריטשמענט אויף גענעס אין קאַנדידאַט מקומות, אאז"ו ו. מער אַוואַנסירטע מיינינג אין דאַטן אַרייַנגערעכנט גענעטיק מאַרקער זיפּונג און אָנפאַנגער פּלאַן זענען אויך בנימצא.
