העאַטמאַפּ
מאַטריץ דאַטן טעקע איז געניצט פֿאַר צייכענונג פון היץ מאַפּע, וואָס קענען פילטער, נאָרמאַלייז און קנויל מאַטריץ דאַטן.עס איז מערסטנס געניצט פֿאַר קנויל אַנאַליסיס פון דזשין אויסדרוק מדרגה צווישן פאַרשידענע סאַמפּאַלז.
גענע אַנאָטאַטיאָן
אַנאַטיישאַן פון דזשין פונקציע איז דורכגעקאָכט דורך מאַפּינג סיקוואַנסיז אין FASTA טעקע קעגן פאַרשידן דאַטאַבייס.
גענע אַנאָטאַטיאָן
יקערדיק לאקאלע אַליינמאַנט זוכן געצייַג
CDS_UTR_פּרעדיקטיאָן
דער געצייַג איז דיזיינד צו פאָרויסזאָגן קאָדירונג מקומות (CDS) און ניט-קאָדינג מקומות (UTR) אין געגעבן טראַנסקריפּט סיקוואַנסיז באזירט אויף בלאַסטינג קעגן באַוווסט פּראָטעין דאַטאַבייס און ORF פּראָגנאָז.
מאַנהאַטטאַן פּלאַנעווען
מאַנהאַטטאַן פּלאַנעווען ינייבאַלז ווייַז פון דאַטן מיט אַ גרויס נומער פון דאַטן פונקטן.עס איז קאַמאַנלי געניצט אין גענאָמע-ברייט פאַרבאַנד שטודיום (GWAS).
סירקאָס
CIRCOS דיאַגראַמע ינייבאַלז דירעקט פּרעזענטירונג פון SNP, InDeL, SV, CNV דיסטריביושאַנז אויף גענאָמע.
GO_Enrichment
TopGO איז אַ געצייַג דיזיינד פֿאַר פאַנגקשאַנאַל ענריטשמענט.TopGO-Bioconductor פּעקל באשטייט דיפערענטשאַל אויסדרוק אַנאַליסיס, GO ענריטשמענט אַנאַליסיס און וויזשוואַלאַזיישאַן פון די רעזולטאַטן.עס וועט דזשענערייט אַ טעקע מיט רעזולטאַט געהייסן "גראַף", וואָס כּולל רעזולטאַטן פֿאַר topGO_BP, topGO_CC און topGO_MF.
WGCNA
WGCNA איז אַ וויידלי געוויינט דאַטן מיינינג אופֿן פֿאַר דיסקאַווערד דזשין קאָ-אויסדרוק מאַדזשולז.עס איז אָנווענדלעך צו פאַרשידן אויסדרוק דאַטאַסעט אַרייַנגערעכנט מיקראָאַררייַ דאַטן און דזשין אויסדרוק דאַטן ערידזשאַנייטאַד פון ווייַטער דור סיקוואַנסינג.
ינטערפּראָסקאַן
ינטערפּראָ פּראָטעין סיקוואַנס אַנאַליסיס און קלאַסאַפאַקיישאַן
GO_KEGG_Enrichment
דער געצייַג איז דיזיינד צו דזשענערייט GO ענריטשמענט כיסטאַגראַם, KEGG ענריטשמענט כיסטאַגראַם און KEGG ענריטשמענט פּאַטוויי באזירט אויף צוגעשטעלט דזשין שטעלן און קאָראַספּאַנדינג אַנאָטאַציע.