פּלאַנט / כייַע גאַנץ גענאָמע סיקוואַנסינג
1.סערוויס אַדוואַנטאַגעס
ברייט דערפאַרונג אין גענאָמע סיקוואַנסינג פֿאַר איבער 1000 מינים.
איבער 800 ארויס קאַסעס מיט אַ אַקיומיאַלאַטיוו פּראַל פאַקטאָר פון איבער 4000.
פולשטענדיק ביאָינפאָרמאַטיקס אַנאַליסיס אויף ווערייישאַן פאַך און פונקציע אַנאַליסיס.
2. סערוויס ספּעסאַפאַקיישאַנז
| פּלאַטפאָרמע | ביבליאָטעק | רעקאַמענדיד סעק טיפקייַט | |
| Illumina | PE 150 | פֿאַר SNP, ינדעל רופן ≥ 10x פֿאַר SV, CNY פאַך ≥ 30x
| |
| נאַנאָפּאָרע
| 8 קב | פֿאַר SV, CNY פאַך ≥ 20x | |
| Pacbio | CCS | 15 קב | פֿאַר SNP, InDel, SV, CNY פאַך ≥ 10x |
3. מוסטער רעקווירעמענץ
| פּלאַטפאָרמע | קאָנס.(נג/μL)
| סומע (נג)
| ריינקייַט
| אַגאַראָסע געל
| ||
| OD260/280 | OD260/230 | 1. קלאָר הויפּט באַנד מיט קיין אָדער לימיטעדדערנידעריקונג באמערקט אויף געל. 2. קיין אָדער לימיטעד רנאַ אָדער פּראָטעין קאַנטאַמאַניישאַן
| ||||
| Illumina | ≥1 | ≥30
| - | - | ||
| נאַנאָפּאָרע
| ≥30 | דעפּענדס אויף דאַטן טראָגן 10μג / צעל | 1.7-2.2 | ≥1.5 | ||
| Pacbio | CCS | ≥50 | 1.7-2.2 | 1.8-2.5 | ||
4. ביאָינפאָרמאַטיאָן אַנאַליסיס
5. סערוויס אַרבעט לויפן
מוסטער עקספּרעס
דנאַ יקסטראַקשאַן
ביבליאָטעק קאַנסטראַקשאַן
סיקוואַנסינג
דאַטאַ אַנאַליסיס
דאַטאַ עקספּרעס
1) סטאַטיסטיק פון גענאָמע מאַפּינג
טיש 1 סטאַטיסטיק פון מאַפּינג רעזולטאַט
פיגורע 1 פאַרשפּרייטונג פון אַרייַנלייגן גרייס און לייענט קאַווערידזש.
2) וואַריאַט דעטעקשאַן
פיגורע 2 סטאַטיסטיק און אַנאַטיישאַן פון SNP / INDEL / SV צווישן סאַמפּאַלז
פיגורע 3 גענאָמע-ברייט פאַרשפּרייטונג פון וואַטיאַטיאָנס
3) פאַנגקשאַנאַל אַנאָטאַציע פון ווערייישאַנז
| 2019 | נאַטור קאָמוניקאַציע | ריסעקווענסינג פון גאַנץ דזשינאָום ריווילז די אָנהייב פון Brassica napus און גענעטיק לאָקי ינוואַלווד אין זיין פֿאַרבעסערונג |
| 2020 | PNAS | די עוואָלוטיאָנאַרי אָנהייב און דאָמעסטיקאַטיאָן געשיכטע פון גאָלדפיש (Carassius auratus) |
| 2021 | פּלאַנט ביאָטעטשנאָלאָגי זשורנאַל | רעפערענץ גענאָמעס פון די צוויי קאַלטאַווייטאַד דזשוט מינים |
| 2021 | פּלאַנט ביאָטעטשנאָלאָגי זשורנאַל | גענאָמיק סיגנאַטשערז פון גרינס און אָילסעעד אַללאָפּאָללאָיד בראַססיקאַ דזשונסעאַ און גענעטיק לאָקי קאַנטראָולינג די אַקיומיאַליישאַן פון גלוקאָסינאָלאַטעס |
| 2019 | מאָלעקולאַר פּלאַנט | גאַנץ דזשינאָום רעסקווענסינג פון אַ וועלט-ברייט זאַמלונג פון רייפּסיד אַקסעססיאָנס ריווילז די גענעטיק יקער פון זייער עקאָטיפּע דיווערדזשאַנס |
| 2022 | כאָרטיקאַלטשער פאָרשונג | גענאָמע-ברייט פאַרבאַנד אַנאַליסיס גיט מאָלעקולאַר ינסייץ אין די נאַטירלעך ווערייישאַן פון קאַווענע זוימען גרייס |
| 2021 | זשורנאַל פון עקספּערימענטאַל באָטאַני | גענאָמע-ברייט פאַרבאַנד לערנען יידענאַפייד וועריאַנץ פון GhSAD1 קאַנפערינג קאַלט טאָלעראַנץ אין וואַטע |
| 2021 | זשורנאַל פון עקספּערימענטאַל באָטאַני | גענאָמע-ברייט אַססאָסיאַטיאָן לערנען און טראַנסקריפּטאָמע פאַרגלייַך אַנטדעקן ראָמאַן QTL און קאַנדידאַט גענעס וואָס קאָנטראָלירן די גרייס פון די פּעטאַל אין רייפּסיד |
