גענאָם עוואָלוציע
גענאָמע די נייַ
פֿאַרזאַמלונג | געשלעכט פעסטקייַט די גאנצע סיקוואַנסינג אַרבעט און פּאַרטיייש ביאָינפאָרמאַטיק באַדינונגס זענען צוגעשטעלט דורך Biomarker Techonologies.
אַבסטראַקט
"די יקאָניק פענאָטיפּע פון סידראַגאָנס כולל בלאַט-ווי אַפּפּענדאַגעס, אַ טאָאָטהלעסס טובולאַר מויל, און זכר שוואַנגערשאַפט ינוואַלווינג ינגקיוביישאַן פון פערטאַלייזד עגגס אויף אַ עפענען "ברוד לאַטע."מיר דע נאָוואָ-סיקוואַנסעד זכר און ווייַבלעך גענאָמעס פון די פּראָסט סידראַגאָן (Phyllopteryx taeniolatus) און זייַן ענג פֿאַרבונדענע מינים, די אַלאַגייטער פּייפּפיש (Syngnathoides biaculeatus).טראַנסקריפּציע פּראָופיילז פון אַן עוואָלוטיאָנאַרי נייַקייַט, די בלאַט-ווי אַפּפּענדאַגעס, ווייַזן אַז אַ סכום פון גענעס טיפּיקלי ינוואַלווד אין פלוספעדער אַנטוויקלונג זענען קאָאָפּטעד ווי געזונט ווי אַ ענריטשמענט פון טראַנסקריפּץ פֿאַר פּאָטענציעל געוועב פאַרריכטן און ימיון פאַרטיידיקונג גענעס.די זעבראַפיש מיוטאַנץ פֿאַר סקפּפּ5, וואָס איז פאַרפאַלן אין אַלע סינגאַטהידס, זענען געפונען צו פעלן אָדער האָבן דיפאָרמד פאַרינגעאַל ציין, וואָס שטיצן די כייפּאַטאַסאַס אַז די אָנווער פון סקפּפּ5 האט קאַנטריביוטיד צו די אָנווער פון ציין אין סינגאַטהידס.א פּאָטאַטיווע געשלעכט-דיטערמאַנינג לאָקוס קאָדירונג פון אַ זכר-ספּעציפיש אַמהר2י דזשין שערד דורך פּראָסט סעאַדראַגאָן און אַלאַגייטער פּייפּפיש איז יידענאַפייד. "
מאטריאל און מעטאדן:
מאַטעריאַלס
Fאונדזער פּראָסט סידראַגאָן (P. taeniolatus) און צוויי אַלאַגייטער פּייפפיש (S. biaculeatus) ספּעסאַמאַנז.צוויי פּראָסט סידראַגאָן (איינער זכר און איין ווייַבלעך) און צוויי אַלאַגייטער פּייפּפיש (איינער זכר און איין ווייַבלעך) מענטשן זענען געניצט פֿאַר גאַנץ דזשינאָום סיקוואַנסינג, און צוויי אנדערע זכר פּראָסט סידראַגאָן מענטשן זענען געניצט פֿאַר גענאָמע ריסעקווענסינג.
גענאָמע סיקוואַנסינג סטראַטעגיע
270/350 בפּ ביבליאָטעק (Hiseq 2500) + Pacbio 20Kb (Sequel) אָדער Nanopore 30 Kb (MinION) + Hi-C (NovaSeq 6000). סיקוואַנסינג, און צוויי אנדערע זכר פּראָסט סעדראַגאָן מענטשן זענען געניצט פֿאַר גענאָמע ריסעקווענסינג.
טראַנסקריפּטאָמע סיקוואַנסינג
Fאָדער פּראָסט סידראַגאָן, מאַרך, אויג, גיל, לעבער, האַרץ, ניר, מעסענטעריע, קישקע, מוסקל, פלוספעדער, הויט, בלאַט-ווי אַפּפּענדאַגעס, טעסטיס און אָוווערי זענען געזאמלט.
גענאָמע דע נייַ פֿאַרזאַמלונג סטראַטעגיע
Cאַנו (קאָררעקשאַן) + WTDBG2 (אַסעמבלי) + פּילאָן (פויליש) + לאַטשעסיס (הי-C).
הויפּט רעזולטאַטן
פיגורע 1. שליסל פֿעיִקייטן פון די פּראָסט סידראַגאָן (P. taeniolatus) און די אַלאַגייטער פּייפּפיש (S. biaculeatus) און זייער פילאָגענעטיק שטעלעס.
פיגורע 2. מאָרפאָלאָגי און גענעטיק באַשטאַנד פון די בלאַט-ווי אַפּפּענדאַגעס אין דער פּראָסט סידראַגאָן (P. taeniolatus).
פיגורע 3. פּוטאַטיווע געשלעכט פעסטקייַט דזשין אין דער פּראָסט סעאַדראַגאָן (P. taeniolatus) און די אַלאַגייטער פּיפּעפיש (S. biaculeatus).
פיגורע 4. פאַרינגעאַל צאָן פענאָטיפּעס אין זעבראַפיש סקפּפּ5 האָמאָזיגאָוס מיוטאַנץ.
פּאָסטן צייט: Jan-08-2022