BMKCloud Log in
条形banner-03

נייַעס

גענאָם עוואָלוציע, פּאַנגנאָם

וואָס איז פּאַנ-גענאָמע?

אַקיומיאַלייטיד עווידענסעס ווייַזן אַז די דיפעראַנסיז צווישן פאַרשידענע סטריינז פון אַ מינים קענען זיין ריזיק.איין גענאָמע איז ווייט פון גענוג צו באַקומען די גאנצע בילד פון גענעטיק אינפֿאָרמאַציע פון ​​​​אַ איין מינים.דער ציל פון פּאַנ-גענאָמע לערנען איז צו קריגן אַ מער פולשטענדיק גענאָמיק גראַפיק פון אַ מינים און דעקאָדע די באַציונגען צווישן טרייץ און גענעטיק קאָודז דורך קאַנדאַקטינג גענאָמע דע נייַ פֿאַרזאַמלונג פון פילע סטריינז, וואָס אַלאַוז אַ דיפּער און ברייטערער מיינינג פון די ווערייישאַנז.

טרענדס פון פּאַנ-גענאָמע לערנען

1

פיגורע 1 די טרענדס פון ארויס פאָרשונג צייטונגען פון פּאַן-גענאָמע.
באַמערקונג: די פיגור ווייזט די רעזולטאַט פון גענומען "פּאַן-גענאָמע" ווי די שליסל וואָרט צו זוכן די טיטלען פון אַרטיקלען ארויס אין נאַטור, צעל און וויסנשאַפֿט סעריע דזשערנאַלז

א.לייענען פון קייפל סאַמפּאַלז זענען אַליינד צו אַ רעפֿערענץ און אַנאַליינז זענען פארזאמלט אין ראָמאַן קאָנטיגס.דורך אַדינג די ראָמאַן קאָנטיגס צו דער אָריגינעל רעפֿערענץ סיקוואַנס, אַ פּאַנגענאָם רעפֿערענץ קענען זיין קאַנסטראַקטאַד.דיספּענסאַבאַל מקומות זענען באשלאסן באזירט אויף מאַפּינג אַלע לייענען צוריק צו די פּאַנגענאָמע.

ב.די נייַע פֿאַרזאַמלונג פון די גענאָמעס פון קייפל אַקסעשאַנז אַלאַוז די אַפּראָוטשיז פון גאַנץ גענאָמע אַליינמאַנט צו ידענטיפיצירן דיספּענסאַבאַל גענאָמיק מקומות.

ג.א פּאַן-גענאָמע גראַפיק קענען זיין קאַנסטראַקטאַד פון גאַנץ גענאָמע אַליינמאַנץ אָדער דורך דע נאָוואָ גראַפיק פֿאַרזאַמלונג, וואָס יפישאַנטלי סטאָרז וועריאַנט אינפֿאָרמאַציע פון ​​דיספּענסאַבאַל מקומות ווי יינציק פּאַטס דורך די גראַפיק.

ווי צו בויען אַ פּאַן-גענאָמע?

2

פיגורע 2 פאַרגלייַך פון פּאַנ-גענאָמע אַפּראָוטשיז1

א.לייענען פון קייפל סאַמפּאַלז זענען אַליינד צו אַ רעפֿערענץ און אַנאַליינז זענען פארזאמלט אין ראָמאַן קאָנטיגס.דורך אַדינג די ראָמאַן קאָנטיגס צו דער אָריגינעל רעפֿערענץ סיקוואַנס, אַ פּאַנגענאָם רעפֿערענץ קענען זיין קאַנסטראַקטאַד.דיספּענסאַבאַל מקומות זענען באשלאסן באזירט אויף מאַפּינג אַלע לייענען צוריק צו די פּאַנגענאָמע.

ב.די נייַע פֿאַרזאַמלונג פון די גענאָמעס פון קייפל אַקסעשאַנז אַלאַוז די אַפּראָוטשיז פון גאַנץ גענאָמע אַליינמאַנט צו ידענטיפיצירן דיספּענסאַבאַל גענאָמיק מקומות.

ג.א פּאַן-גענאָמע גראַפיק קענען זיין קאַנסטראַקטאַד פון גאַנץ גענאָמע אַליינמאַנץ אָדער דורך דע נאָוואָ גראַפיק פֿאַרזאַמלונג, וואָס יפישאַנטלי סטאָרז וועריאַנט אינפֿאָרמאַציע פון ​​דיספּענסאַבאַל מקומות ווי יינציק פּאַטס דורך די גראַפיק.

לעצטנס פֿאַרעפֿנטלעכט פּאַנ-גענאָמעס

● שענדונג פּאַן-גענאָמעס2

3

● פּאָמידאָר פּאַן-גענאָמעס 3

4

● רייס פּאַן -גענאָמע4

5

● זונרויז פּאַן-גענאָמע5

6

● סויבין פּאַן-גענאָמע 6

7

● רייס פּאַן-גענאָמע7

8

● גערשטן פּאַן-גענאָמע8

9

● ווייץ פּאַן-גענאָמע9

10

● Sorghum Pan-genome10

11

● פיטאָפּאַנקטאָן פּאַן-גענאָמע11

12

רעפערענץ

1. Bayer PE, Golicz AA, Scheben A, Batley J, Edwards D. פּלאַנט פּאַן-גענאָמעס זענען די נייַע רעפֿערענץ.נאַט פּלאַנץ.2020; 6(8):914-920.דוי: 10.1038/s41477-020-0733-0

2. ליד דזשם, גואַן ז, הו דזש, עט על.אַכט הויך-קוואַליטעט גענאָמעס אַנטדעקן פּאַן-גענאָמע אַרקאַטעקטשער און עקאָטיפּע דיפערענשייישאַן פון Brassica napus.נאַט פּלאַנץ.2020;6(1):34-45.דוי: 10.1038/s41477-019-0577-7

3. גאַאָ ל, גאָנדאַ איך, זון ה, עט על.די פּאָמידאָר פּאַן-גענאָמע אַנטדעקן נייַ גענעס און אַ זעלטן אַללע רעגיאַלייטינג פרוכט טאַם.נאט גענעט.2019;51(6):1044-1051.דוי: 10.1038/s41588-019-0410-2

4. דזשאַו ק, פענג ק, לו ה, עט על.פּאַנ-גענאָמע אַנאַליסיס כיילייץ די מאָס פון גענאָמיק ווערייישאַן אין קאַלטאַווייטאַד און ווילד רייַז [ארויס קערעקשאַן איז ארויס אין Nat Genet.2018 אויגוסט; 50 (8): 1196].נאט גענעט.2018;50(2):278-284.דוי: 10.1038/s41588-018-0041-z

5. Hübner S, Bercovich N, Todesco M, et al.זונרויז פּאַנ-גענאָמע אַנאַליסיס ווייזט אַז כייברידיזיישאַן אָלטערד דזשין אינהאַלט און קרענק קעגנשטעל.נאַט פּלאַנץ.2019; 5(1):54-62.דוי: 10.1038/s41477-018-0329-0

6. ליו י, דו ה, לי פּ, עט על.פּאַן-גענאָמע פון ​​ווילד און קאַלטיווייטיד סויבינז.צעל.2020;182(1):162-176.ע13.דאָי: 10.1016/דזש.סעלל.2020.05.023

7. קין פּ, לו ה, דו ה, עט על.פּאַן-גענאָמע אַנאַליסיס פון 33 דזשאַנעטיקלי דייווערס רייַז אַקסעססיאָנס ריווילז פאַרבאָרגן גענאָמיק ווערייישאַנז [ארויס אָנליין פאָרויס פון דרוק, 25 מאי 2021].צעל.2021;S0092-8674(21)00581-X.דאָי: 10.1016/דזש.סעלל.2021.04.046

8. Jayacodi M, Padmarasu S, Haberer G, et al.די גערשטן פּאַן-גענאָמע ריווילז די פאַרבאָרגן לעגאַט פון מיוטיישאַן ברידינג.נאַטור.2020; 588 (7837): 284-289.דוי: 10.1038/s41586-020-2947-8

9. וואַלקאָוויאַק ז, גאַאָ ל, מאָנאַט C, עט על.קייפל ווייץ גענאָמעס אַנטדעקן גלאבאלע ווערייישאַן אין מאָדערן ברידינג.נאַטור.2020; 588 (7837): 277-283.דוי: 10.1038/s41586-020-2961-x

10. טאַו י, לואָ ה, זו דזש, עט על.ברייט ווערייישאַן אין די פּאַן-גענאָמע פון ​​קאַלטאַווייטאַד און ווילד סאָרגאַם [ארויס אָנליין פאָרויס פון דרוק, 20 מאי 2021].נאַט פּלאַנץ.2021;10.1038 / s41477-021-00925-x.דוי: 10.1038/s41477-021-00925-x

11. פאַן רענטגענ, קיו ה, האַן וו, עט על.פיטאָפּאַנקטאָן פּאַנגענאָמע ריווילז ברייט פּראָקאַריאָטיק האָריזאָנטאַל דזשין אַריבערפירן פון דייווערס פאַנגקשאַנז.Sci Adv.2020;6(18):eaba0111.פֿאַרעפֿנטלעכט 2020 אפריל 29. doi:10.1126/sciadv.aba0111


פּאָסטן צייט: Jan-04-2022

שיקן דיין אָנזאָג צו אונדז: