נייַעס

טראַנספּאָסאַבלע עלעמענט (TE) אַמפּלאַפאַקיישאַן איז אנערקענט ווי אַ דרייווינג קראַפט מעדיאַטינג גענאָמע גרייס יקספּאַנשאַן און עוואָלוציע, אָבער די קאַנסאַקווענסאַז פֿאַר פורעמונג 3 ד גענאָמיק אַרקאַטעקטשער בלייבט לאַרגעלי אומבאַקאַנט אין געוויקסן.דאָ, מיר באַריכט רעפֿערענץ-מיינונג גענאָמע אַסעמבליז פֿאַר דריי מינים פון וואַטע ריינדזשינג דריי-פאַרלייגן אין גענאָמע גרייס, ניימלי.Gossypium rotundifolium(ק2),דזשי אַרבאָרעום(אַ2), אוןG. raimondii(D5), ניצן Oxford Nanopore Technologies.קאָמפּאַראַטיווע גענאָמע אַנאַליזעס דאָקומענט די דעטאַילס פון ייכעס-ספּעציפיש TE אַמפּלאַפאַקיישאַן קאַנטריביוטינג צו די גרויס דזשינאָום גרייס דיפעראַנסיז (K2, 2.44 Gb; A2, 1.62 Gb; D5, 750.19 Mb), און אָנווייַזן לעפיערעך קאַנסערווד דזשין אינהאַלט און סינטעני שייכות צווישן גענאָמעס.מיר געפונען אַז בעערעך 17% פון סינטעניק גענעס ויסשטעלונג טשראָמאַטין סטאַטוס ענדערונגען צווישן אַקטיוו ("א") און ינאַקטיוו ("ב") קאַמפּאַרטמאַנץ, און TE אַמפּלאַפאַקיישאַן איז פארבונדן מיט די פאַרגרעסערן פון די פּראָפּאָרציע פון ​​א אָפּטייל אין דזשין מקומות (~ 7,000 גענעס ) אין K2 און A2 קאָרעוו צו D5.בלויז 42% פון טאָפּאָלאָגיקאַללי אַססאָסיאַטינג פעלד (TAD) באַונדריז זענען קאַנסערווד צווישן די דריי גענאָמעס.אונדזער דאַטן ימפּלייז די לעצטע אַמפּלאַפאַקיישאַן פון טע נאָך פאָרמירונג פון ייכעס-ספּעציפיש טאַד באַונדריז.די לערנען אָפּדאַך ליכט אויף די ראָלע פון ​​טראַנספּאָסאָן-מעדיאַטעד גענאָמע יקספּאַנשאַן אין דער עוואָלוציע פון ​​העכער-סדר טשראָמאַטין סטרוקטור אין געוויקסן.