מעטאַגענאָמיק סיקוואַנסינג-נאַנאָפּאָרע
סערוויס אַדוואַנטאַגעס
● הויך-קוואַליטעט פֿאַרזאַמלונג-ענכאַנסינג אַקיעראַסי פון מינים לעגיטימאַציע און פאַנגקשאַנאַל דזשין פּראָגנאָז
● פארמאכט באַקטיריאַל גענאָמע אפגעזונדערטקייט
● מער שטאַרק און פאַרלאָזלעך אַפּלאַקיישאַן אין דייווערס געגנט, למשל דיטעקשאַן פון פּאַטאַדזשעניק מייקראָואָרגאַניזאַמז אָדער אַנטיביאָטיק קעגנשטעל פֿאַרבונדענע גענעס
● קאָמפּאַראַטיווע מעטאַגענאָמע אַנאַליסיס
סערוויס ספּעסאַפאַקיישאַנז
| פּלאַטפאָרמע | סיקוואַנסינג | רעקאַמענדיד דאַטן | טערנעראַונד צייט |
| נאַנאָפּאָרע | ONT | 6 ג / 10 ג | 65 אַרבעט טעג |
ביאָינפאָרמאַטיקס אַנאַליסיס
● רוי דאַטן קוואַליטעט קאָנטראָל
● מעטאַגענאָמע פֿאַרזאַמלונג
● ניט-יבעריק דזשין שטעלן און אַנאַטיישאַן
● מינים דייווערסיטי אַנאַליסיס
● גענעטיק פונקציע דייווערסיטי אַנאַליסיס
● ינטער-גרופּע אַנאַליסיס
● אַססאָסיאַטיאָן אַנאַליסיס קעגן יקספּערמענאַל סיבות
מוסטער רעקווירעמענץ און עקספּרעס
מוסטער באדערפענישן און עקספּרעס
מוסטער רעקווירעמענץ:
פֿאַרדנאַ אויסצוגן:
| מוסטער טיפּ | סומע | קאָנצענטראַציע | ריינקייַט |
| דנאַ אויסצוגן | 1-1.5 μג | ＞ 20 נג/μל | אָד260/280 = 1.6-2.5 |
פֿאַר ינווייראַנמענאַל סאַמפּאַלז:
| מוסטער טיפּ | רעקאַמענדיד מוסטערונג פּראָצעדור |
| באָדן | מוסטערונג סומע: אַפּפּראָקס.5 ג;רימיינדינג פאַרדאַרט מאַטעריע דאַרף צו זיין אַוועקגענומען פון ייבערפלאַך;מאָל גרויס ברעקלעך און פאָרן דורך 2 מם פילטער;אַליקוואָט סאַמפּאַלז אין סטערילע עפּ-רער אָדער סיראָטובע פֿאַר רעזערוואַציע. |
| פעסעס | מוסטערונג סומע: אַפּפּראָקס.5 ג;קלייַבן און אַליקוואָט סאַמפּאַלז אין סטערילע עפּ-רער אָדער קריאָטובע פֿאַר רעזערוואַציע. |
| ינטעסטאַנאַל אינהאַלט | סאַמפּאַלז דאַרפֿן צו זיין פּראַסעסט אונטער אַסעפּטיק צושטאַנד.וואַשן געזאמלט געוועב מיט פּבס;סענטריפיודזש די פּבס און זאַמלען די פּרעסיפּיטאַנט אין עפּ-טובז. |
| סלאַדזש | מוסטערונג סומע: אַפּפּראָקס.5 ג;קלייַבן און אַליקוואָט סלאַדזש מוסטער אין סטערילע עפּ-רער אָדער קריאָטובע פֿאַר רעזערוואַציע |
| וואַטערבאָדי | פֿאַר אַ מוסטער מיט אַ לימיטעד סומע פון מייקראָוביאַל, אַזאַ ווי צאַפּן וואַסער, געזונט וואַסער, אאז"ו ו, קאַלעקט בייַ מינדסטער 1 ל וואַסער און פאָרן דורך 0.22 μם פילטער צו באַרייַכערן מייקראָוביאַל אויף די מעמבראַנע.סטאָר די מעמבראַנע אין אַ סטערילע רער. |
| הויט | קערפאַלי סקראַפּ הויט ייבערפלאַך מיט סטערילע וואַטע ווישער אָדער כירורגיש בלייד און שטעלן עס אין סטערילע רער. |
רעקאַמענדיד מוסטער עקספּרעס
פרירן די סאַמפּאַלז אין פליסיק ניטראָגען פֿאַר 3-4 שעה און קראָם אין פליסיק ניטראָגען אָדער -80 גראַד צו לאַנג-טערמין רעזערוואַציע.מוסטער שיפּינג מיט טרוקן-אייז איז פארלאנגט.
סערוויס אַרבעט לויפן
מוסטער עקספּרעס
ביבליאָטעק קאַנסטראַקשאַן
סיקוואַנסינג
דאַטאַ אַנאַליסיס
נאָך-פאַרקויף באַדינונגען
1.העאַטמאַפּ: מינים ריטשנאַס קלאַסטערינג
2. פאַנגקשאַנאַל גענעס אַנאַטייטיד צו KEGG מעטאַבאַליק פּאַטווייז
3.ספּעסיעס קאָראַליישאַן נעץ
4.סירקאָס פון קאַרד אַנטיביאָטיק קעגנשטעל גענעס
BMK קאַסע
נאַנאָפּאָרע מעטאַגענאָמיקס ינייבאַלז גיך קליניש דיאַגנאָסיס פון באַקטיריאַל נידעריקער רעספּעראַטאָרי ינפעקציע
ארויס:נאַטור ביאָטעטשנאָלאָגי, 2019
טעכניש כיילייץ
סיקוואַנסינג: Nanopore MinION
קליניש מעטאַגענאָמיקס ביאָינפאָרמאַטיקס: האָסט דנאַ דיפּלישאַן, WIMP און ARMA אַנאַליסיס
גיך דיטעקשאַן: 6 שעה
הויך סענסיטיוויטי: 96.6%
שליסל רעזולטאַטן
אין 2006, נידעריקער רעספּעראַטאָרי ינפעקציע (לר) געפֿירט 3 מיליאָן מענטש טויט גלאָובאַלי.די טיפּיש מעטאָד פֿאַר LR1 פּאַטאַדזשאַן דיטעקשאַן איז קאַלטיוויישאַן, וואָס האט אַ נידעריק סענסיטיוויטי, לאַנג קער-אַרום צייט און איז פעלן פון גיידאַנס אין פרי אַנטיביאָטיק טעראַפּיע.א גיך און פּינטלעך מייקראָוביאַל דיאַגנאָסיס איז לאַנג שוין אַ דרינגלעך נויט.ד"ר דזשאַסטין פון אוניווערסיטעט פון מזרח אַנגליאַ און זיין פּאַרטנערס הצלחה דעוועלאָפּעד אַ נאַנאָפּאָרע-באזירט מעטאַגענאָמיק אופֿן פֿאַר פּאַטאַדזשאַן דיטעקשאַן.לויט זייער וואָרקפלאָוו, 99.99% פון באַלעבאָס דנאַ קענען זיין דיפּליטיד.דיטעקשאַן אין פּאַטאַדזשאַנז און אַנטיביאָטיק קעגנשטעליק גענעס קענען זיין פאַרטיק אין 6 שעה.
רעפערענץ
טשאַראַלאַמפּאָוס, טי, קייַ, גל, ריטשאַרדסאָן, ה, יידין, יי, & אָ'גראַדי, י.(2019).נאַנאָפּאָרע מעטאַגענאָמיקס ינייבאַלז גיך קליניש דיאַגנאָסיס פון באַקטיריאַל נידעריקער רעספּעראַטאָרי ינפעקציע.נאַטור ביאָטעטשנאָלאָגי, 37 (7), 1.
