פּראָדוקטן

1.היסטאָגראַם: מינים פאַרשפּרייטונג

2. פאַנגקשאַנאַל גענעס אַנאַטייטיד צו KEGG מעטאַבאַליק פּאַטווייז

3.העאַט מאַפּע: דיפפערענטשאַל פאַנגקשאַנז באזירט אויף קאָרעוו דזשין זעט4.סירקאָס פון קאַרד אַנטיביאָטיק קעגנשטעל גענעס

BMK קאַסע

פּרעוואַלאַנס פון אַנטיביאָטיק קעגנשטעל גענעס און באַקטיריאַל פּאַטאַדזשאַנז צוזאמען די באָדן-מאַנגראָווע וואָרצל קאָנטינוום

ארויס:זשורנאַל פון כאַזערדאַס מאַטעריאַלס, 2021

סיקוואַנסינג סטראַטעגיע:

מאַטעריאַלס: דנאַ אויסצוגן פון פיר פראַגמאַנץ פון מאַנגראָווע וואָרצל פֿאַרבונדן סאַמפּאַלז: אַנפּלאַנטיד באָדן, רהיזאָספערע, עפּיספערע און ענדאָספערע קאַמפּאַרטמאַנץ
פּלאַטפאָרמע: Illumina HiSeq 2500
טאַרגאַץ: מעטאַגענאָמע
16S rRNA דזשין וו3-וו4 געגנט

שליסל רעזולטאַטן

מעטאַגענאָמיק סיקוואַנסינג און מעטאַבאַרקאָודינג פּראָפילינג אויף באָדן-וואָרצל קאַנטיניום פון מאַנגראָווע סאַפּלינגז זענען פּראַסעסט אין סדר צו לערנען די דיסעמאַניישאַן פון אַנטיביאָטיק קעגנשטעל גענעס (ARGs) פֿון באָדן אין געוויקסן.מעטאַגענאָמיק דאַטן אנטפלעקט אַז 91.4% פון אַנטיביאָטיק קעגנשטעל גענעס זענען אָפט יידענאַפייד אין אַלע פיר באָדן קאַמפּאַרטמאַנץ דערמאנט אויבן, וואָס געוויזן אַ קעסיידערדיק מאָדע.16S rRNA אַמפּליקאָן סיקוואַנסינג דזשענערייטאַד 29,285 סיקוואַנסיז, רעפּריזענטינג 346 מינים.קאַמביינינג מיט מינים פּראָפילינג דורך אַמפּליקאָן סיקוואַנסינג, די דיסעמאַניישאַן איז געווען פרייַ פון וואָרצל-פארבונדן מיקראָביאָטאַ, אָבער, עס קען זיין פאַסילאַטייטיד דורך רירעוודיק פון גענעטיק עלעמענטן.דער לערנען יידענאַפייד די לויפן פון ARGs און פּאַטאַדזשאַנז פון באָדן אין די געוויקסן דורך ינטערקאַנעקטיד באָדן-וואָרצל קאָנטינוום.

רעפערענץ

וואַנג, סי, הו, ר, שטאַרק, פּדזש, זשואַנג, וו, & שו, ל.(2020).פּרעוואַלאַנס פון אַנטיביאָטיק קעגנשטעל גענעס און באַקטיריאַל פּאַטאַדזשאַנז צוזאמען דעם באָדן-מאַנגראָווע וואָרצל קאָנטינוום.זשורנאַל פון כאַזערדאַס מאַטעריאַלס, 408, 124985 .