-
פּלאַנט / כייַע די נייַ גענאָמע סיקוואַנסינג
די נייַסיקוואַנסינג רעפערס צו קאַנסטראַקשאַן פון אַ גאַנץ גענאָמע פון אַ מינים ניצן סיקוואַנסינג טעקנאַלאַדזשיז, למשל PacBio, Nanopore, NGS, אאז"ו ו, אין פעלן פון אַ רעפֿערענץ גענאָמע.די מערקווירדיק פֿאַרבעסערונג אין לייענען לענג פון דריט דור סיקוואַנסינג טעקנאַלאַדזשיז האט געבראכט נייַ אַפּערטונאַטיז אין אַסעמבאַלינג קאָמפּלעקס גענאָמעס, אַזאַ ווי יענע מיט הויך העטעראָזיגאָסיטי, הויך פאַרהעלטעניש פון ריפּעטיטיוו מקומות, פּאָליפּלאָידס, אאז"ו ו. ריזאַלווינג פון ריפּעטיטיוו עלעמענטן, מקומות מיט אַבנאָרמאַל גק אינהאַלט און אנדערע העכסט קאָמפּלעקס מקומות.
פּלאַטפאָרמע: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Illumina NovaSeq6000
-
Hi-C באזירט גענאָמע אַסעמבלי
Hi-C איז אַ מעטאָד דיזיינד צו כאַפּן כראָמאָסאָם קאַנפיגיעריישאַן דורך קאַמביינינג פּראָובינג פּראַקסימאַטי-באזירט ינטעראַקשאַנז און הויך-טראַפּוט סיקוואַנסינג.די ינטענסיטי פון די ינטעראַקשאַנז איז געגלויבט צו זיין נעגאַטיוולי קאָראַלייטאַד מיט גשמיות דיסטאַנסע אויף טשראָמאָסאָומז.דעריבער, Hi-C דאַטן קען פירן די קלאַסטערינג, אָרדערינג און אָריענטירונג פון אַסעמבאַלד סיקוואַנסיז אין אַ פּלאַן גענאָמע און אַנגקערינג די אויף זיכער נומער פון טשראָמאָסאָומז.די טעכנאָלאָגיע ימפּאַוערז אַ כראָמאָסאָם-מדרגה גענאָמע פֿאַרזאַמלונג אין פעלן פון באַפעלקערונג-באזירט גענעטיק מאַפּע.יעדער גענאָמע דאַרף אַ Hi-C.
פּלאַטפאָרמע: Illumina NovaSeq6000 / DNBSEQ
-
עוואָלוטיאָנאַרי גענעטיקס
עוואָלוטיאָנאַרי דזשאַנעטיקס איז אַ פּאַקט סיקוואַנסינג דינסט דיזיינד פֿאַר פּראַוויידינג אַ פולשטענדיק ינטערפּריטיישאַן אויף עוואָלוטיאָנאַרי אינפֿאָרמאַציע פון געגעבן מאַטעריאַלס באזירט אויף גענעטיק ווערייישאַנז, אַרייַנגערעכנט SNPs, InDels, SVs און CNVs.עס גיט אַלע פונדאַמענטאַל אַנאַליסיס פארלאנגט פֿאַר דיסקרייבינג עוואָלוטיאָנאַרי ענדערונגען און גענעטיק פֿעיִקייטן פון פּאַפּיאַליישאַנז, אַזאַ ווי באַפעלקערונג סטרוקטור, גענעטיק דייווערסיטי, פילאָגעני באציונגען, אאז"ו ו עס אויך כּולל שטודיום אויף דזשין לויפן, וואָס ימפּאַוערז אָפּשאַצונג פון עפעקטיוו באַפעלקערונג גרייס, דייווערדזשאַנס צייט.
-
קאָמפּאַראַטיווע גענאָמיקס
קאָמפּאַראַטיווע גענאָמיקס ממש מיטל קאַמפּערינג די גאַנץ גענאָמע סיקוואַנסיז און סטראַקטשערז פון פאַרשידענע מינים.דער דיסציפּלין יימז צו אַנטדעקן מינים עוואָלוציע, דזשין פונקציע, דזשין רעגולאַטאָרי מעקאַניזאַם אויף גענאָמע מדרגה דורך ידענטיפיצירן די סיקוואַנס סטראַקטשערז און עלעמענטן וואָס קאַנסערווד אָדער דיפערענשיייטאַד צווישן פאַרשידענע מינים.טיפּיש קאָמפּאַראַטיווע גענאָמיקס לערנען כולל אַנאַליזעס אין דזשין משפּחה, עוואָלוטיאָנאַרי אַנטוויקלונג, גאַנץ גענאָמע דופּליקיישאַן, סעלעקטיוו דרוק, עטק.
-
בולקט סעגרעגאַנט אַנאַליסיס
בולקט סעגרעגאַנט אַנאַליסיס (BSA) איז אַ טעכניק געניצט צו געשווינד ידענטיפיצירן פענאָטיפּע פֿאַרבונדן גענעטיק מאַרקערס.דער הויפּט וואָרקפלאָוו פון BSA כּולל סאַלעקטינג צוויי גרופּעס פון מענטשן מיט גאָר אַפּאָוזינג פענאָטיפּעס, פּולינג די דנאַ פון אַלע מענטשן צו פאָרעם צוויי פאַרנעם פון דנאַ, ידענטיפיצירן דיפערענטשאַל סיקוואַנסיז צווישן צוויי פּאָאָלס.די טעכניק איז געווען וויידלי געניצט אין ידענטיפיינג גענעטיק מאַרקערס שטארק פֿאַרבונדן דורך טאַרגעטעד גענעס אין פאַבריק / כייַע גענאָמעס.
