פּלאַטפאָרמע | ביבליאָטעק גרייס | טעאָרעטיש דאַטאַ ייעלד (פּער צעל) | איין-באַזע אַקיעראַסי | אַפּפּליקאַטיאָנס |
נאַנאָפּאָרע | 8Kb, 10Kb, 20Kb, Ultralong, cDNA-PCR | 70-90 גיגאבייט / צעל | 85-92% | SV פאַך, דע נייַ, פול-לענג סיקוואַנסינג, יסאָ-סעק, דזשין אַנאַטיישאַן, דיטעקשאַן פון דנאַ מעטהילאַטיאָן |
● איבער 5 יאָר דערפאַרונג אויף PacBio סיקוואַנסינג פּלאַטפאָרמע מיט טויזנטער פון פארמאכט פּראַדזשעקס מיט פאַרשידן מינים.
● BMKGENE איז אַ באַאַמטער שוטעף פון אָקספֿאָרד נאַנאָפּאָרע, מיט צווייענדיק פּלאַטפאָרמע רנאַ / דנאַ סערטאַפאַקיישאַן.
● עס זענען מיינסטרים מאָדעלס פון סיקוואַנסערז מיט גאַנץ ויסריכט און גענוג סיקוואַנסינג טרופּוט.
● באזירט אויף די נאַנאָפּאָרע פּלאַטפאָרמע, מער ווי 10 כייַע און פאַבריק דענאָוואָ ריסערטשערז האָבן שוין ארויס אין ינטערנאַשאַנאַלי באַרימט דזשערנאַלז.
מוסטער טיפּ | סומע | קאַנסאַנטריישאַן (קווביט ®) | באַנד | ריינקייַט | אנדערע |
גענאָמיק דנאַ | אָפענגען אויף דאַטאַ רעקווירעמענץ | ≥20נג/μל | ≥15μל | אָד260/280=1.7-2.2; OD260/230≥1.5; קלאָר שפּיץ ביי 260 נם, קיין קאַנטאַמאַניישאַנז | קאַנסאַנטריישאַן דאַרף זיין געמאסטן דורך קוביט און קוביט / נאַנאָפּאָרע ≤ 2 |
גאַנץ רנאַ | ≥1.2μג | ≥100μג/μל | ≥15μל | אָד260/280=1.7-2.5; OD260/230=0.5-2.5; קיין קאַנטאַמאַניישאַנז | RIN ווערט ≥7.5 |
דאַטאַ קוואַליטי אַססעססמענט פון דנאַ מוסטער
טיש 1. סטאַטיסטיק אויף ריין דאַטן.
במקיד | rawSeqNum | rawSumBase | cleanSeqNum | cleanSumBase | cleanN50Len | cleanN90Len | cleanMeanLen | cleanMaxLen | cleanMeanQual |
DNA_BMK01 | 1,218,239 | 26.37 | 1,121,736 | 25.90 | 28,014 | 15,764 | 23,090 | 143,181 | 9 |
דאַטאַ קוואַליטי אַססעססמענט פון רנאַ מוסטער
טיש 1. סטאַטיסטיק אויף ריין דאַטן.
טעקע נאָמען | ClientID | ReadNum | BaseNum | N50 | MeanLength | MaxLength | MeanQscore |
RNA_BMK001 | C2 | 8,947,708 | 4,047,230,083 | 398 | 452 | 129,227 | ק12 |
פיגורע 1. לייענען לענג פאַרשפּרייטונג
פיגורע 2. קוואַליטי כעזשבן פאַרשפּרייטונג פון ריין דאַטן
פיגורע 3. לענג און קוואַליטעט כעזשבן פאַרשפּרייטונג פון ריין דאַטן