סיררנאַ סיקוואַנסינג-יללומינאַ
איינריכטונגען
● ררנאַ דיפּלישאַן נאכגעגאנגען דורך דירעקטיאָנאַל ביבליאָטעק צוגרייטונג, ענייבאַלינג סיקוואַנסינג דאַטן וואָס איז שנירל-ספּעציפיש.
● ביאָינפאָרמאַטיק וואָרקפלאָוו ינייבאַלז סיררנאַ פּראָגנאָז און אויסדרוק קוואַנטאַפאַקיישאַן
סערוויס אַדוואַנטאַגעס
●מער פולשטענדיק רנאַ לייברעריז:מיר נוצן rRNA דיפּלישאַן אַנשטאָט פון לינעאַר רנאַ דיפּלישאַן אין אונדזער פאַר-ביבליאָטעק צוגרייטונג, ינשורינג אַז די סיקוואַנסינג דאַטן ינקלודז ניט בלויז סיררנאַ אָבער אויך mRNA און lncRNA, וואָס ינייבאַלז שלאָס אַנאַליסיס אויף די דאַטאַסעץ.
●אָפּטיאָנאַל אַנאַליסיס פון קאַמפּעטיטיוו ענדאָגענאָוס רנאַ (סערנאַ) נעטוואָרקס: פּראַוויידינג דיפּער ינסייץ אין סעליאַלער רעגולאַטאָרי מעקאַניזאַמז
●ברייט עקספּערטיז: מיט אַ שפּור רעקאָרד פון פּראַסעסינג איבער 20,000 סאַמפּאַלז ביי BMK, ספּאַנינג דייווערס מוסטער טייפּס און lncRNA פּראַדזשעקס, אונדזער מאַנשאַפֿט ברענגט אַ עשירות פון דערפאַרונג צו יעדער פּרויעקט.
●שטרענג קוואַליטי קאָנטראָל: מיר ינסטרומענט האַרץ קאָנטראָל פונקטן אין אַלע סטאַגעס, פֿון מוסטער און ביבליאָטעק צוגרייטונג צו סיקוואַנסינג און ביאָינפאָרמאַטיקס.דעם מאַטיקיאַלאַס מאָניטאָרינג ינשורז די עקספּרעס פון קאַנסיסטאַנטלי הויך-קוואַליטעט רעזולטאַטן.
● פּאָסטן-סאַלעס שטיצן: אונדזער היסכייַוועס יקסטענדז ווייַטער פון פּרויעקט קאַמפּלישאַן מיט אַ 3-חודש נאָך-פאַרקויף דינסט צייַט.בעשאַס דעם צייט, מיר פאָרשלאָגן פּרויעקט נאָכגיין-אַרויף, טראָובלעשאָאָטינג הילף און ק & א סעשאַנז צו אַדרעס קיין פֿראגן שייַכות צו די רעזולטאַטן.
מוסטער רעקווירעמענץ און עקספּרעס
| ביבליאָטעק | פּלאַטפאָרמע | רעקאַמענדיד דאַטן | Data QC |
| פּאָלי א ענריטשט | Illumina PE150 | 16-20 גיגאבייט | Q30≥85% |
מוסטער רעקווירעמענץ:
נוקלעאָטידע:
| קאָנס. (נג/μל) | סומע (μg) | ריינקייַט | אָרנטלעכקייַט |
| ≥ 100 | ≥ 0.5 | OD260/280=1.7-2.5 אָד260/230=0.5-2.5 לימיטעד אָדער קיין פּראָטעין אָדער דנאַ קאַנטאַמאַניישאַן געוויזן אויף געל. | פֿאַר געוויקסן: RIN≥6.5; פֿאַר אַנימאַלס: RIN≥7.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; לימיטעד אָדער קיין באַסעלינע הייך |
● געוויקסן:
וואָרצל, סטעם אָדער פּעטאַל: 450 מג
בלאַט אָדער זוימען: 300 מג
פרוכט: 1.2 ג
● כייַע:
האַרץ אָדער קישקע: 450 מג
וויסעראַ אָדער מאַרך: 240 מג
מוסקל: 600 מג
ביינער, האָר אָדער הויט: 1.5 ג
● אַרטראַפּאָדס:
ינסעקץ: 9ג
קראַסטאַסיאַ: 450 מג
● גאַנץ בלוט:2 טובז
● צעלן: 106 סעלז
● סערום און פּלאַזמע: 6 מל
רעקאַמענדיד מוסטער עקספּרעס
קאַנטיינער: 2 מל סענטריפודזש רער (צין שטער איז נישט רעקאַמענדיד)
מוסטער לייבלינג: גרופע + רעפּלאַקייט למשל A1, A2, A3;ב 1, ב 2, ב 3 ... ...
טראַנספּאָרט:
1. טרוקן-אייז: סאַמפּאַלז דאַרפֿן צו זיין פּאַקט אין באַגס און בעריד אין טרוקן-אייז.
2. רנאַסטאַבלע טובז: רנאַ סאַמפּאַלז קענען זיין דאַר אין רנאַ סטייבאַלאַזיישאַן רער (למשל רנאַסטאַבלע®) און שיפּט אין צימער טעמפּעראַטור.
סערוויס אַרבעט לויפן
עקספּערימענט פּלאַן
מוסטער עקספּרעס
רנאַ יקסטראַקשאַן
ביבליאָטעק קאַנסטראַקשאַן
סיקוואַנסינג
דאַטאַ אַנאַליסיס
נאָך-פאַרקויף באַדינונגען
ביאָינפאָרמאַטיקס
סיררנאַ פּראָגנאָז: טשראָמאָסאָמאַל פאַרשפּרייטונג
דיפערענטשאַלי אויסגעדריקט סיררנאַס - ווולקאַן פּלאַנעווען
דיפערענטשאַלי אויסגעדריקט סיררנאַס - כייעראַרקאַקאַל קלאַסטערינג
פאַנגקשאַנאַל ענריטשמענט פון סיררנאַ ס באַלעבאָס גענעס
ויספאָרשן די פאָרשונג אַדוואַנטידזשיז פאַסילאַטייטיד דורך BMKGene 'סיררנאַ סיקוואַנסינג באַדינונגס דורך אַ קוראַטעד זאַמלונג פון אויסגאבעס.
וואַנג, X. עט על.(2021) 'CPSF4 רעגיאַלייץ סעררנאַ פאָרמירונג און מיקראָרנאַ מידיייטיד דזשין סילענסינג אין העפּאַטאָסעללולאַר קאַרסינאָמאַ', אָנקאָגענע 2021 40:25, 40(25), פּפּ. 4338-4351.דאָי: 10.1038/s41388-021-01867-6.
קסיאַ, קיי עט על.(2023) 'X oo-אָפּרופיק טראַנסקריפּטאָמע ריווילז די ראָלע פון די קייַלעכיק רנאַ133 אין קרענק קעגנשטעל דורך רעגיאַלייטינג אויסדרוק פון OsARAB אין רייַז', Phytopathology Research, 5 (1), פּפּ. 1-14.דאָי: 10.1186/S42483-023-00188-8/FIGURES/6.
י, ה. עט על.(2023) 'CPSF3 מאַדזשאַלייץ די וואָג פון קייַלעכיק און לינעאַר טראַנסקריפּץ אין העפּאַטאָסעללולאַר קאַרסינאָמאַ.דאָי: 10.21203/רס.3.רס-2418311/וו1.
זשאַנג, י עט על.(2023) 'פולשטענדיק אפשאצונג פון סיררנאַס אין סירראָטיק קאַרדיאָמיאָפּאַטהי איידער און נאָך לעבער טראַנספּלאַנטיישאַן', ינטערנאַטיאָנאַל יממונאָפאַרמאַקאָלאָגי, 114, פּ.109495. דאָי: 10.1016/דזש.ינטימפּ.2022.109495.
