BMKCloud Log in
条形banner-03

פּראָדוקטן

בולקט סעגרעגאַנט אַנאַליסיס

בולקט סעגרעגאַנט אַנאַליסיס (BSA) איז אַ טעכניק געניצט צו געשווינד ידענטיפיצירן פענאָטיפּע פֿאַרבונדן גענעטיק מאַרקערס.דער הויפּט וואָרקפלאָוו פון BSA כּולל סאַלעקטינג צוויי גרופּעס פון מענטשן מיט גאָר אַפּאָוזינג פענאָטיפּעס, פּולינג די דנאַ פון אַלע מענטשן צו פאָרעם צוויי פאַרנעם פון דנאַ, ידענטיפיצירן דיפערענטשאַל סיקוואַנסיז צווישן צוויי פּאָאָלס.די טעכניק איז געווען וויידלי געניצט אין ידענטיפיינג גענעטיק מאַרקערס שטארק פֿאַרבונדן דורך טאַרגעטעד גענעס אין פאַבריק / כייַע גענאָמעס.


סערוויס דעטאַילס

דעמאָ רעזולטאַטן

קאַסע סטודיע

סערוויס אַדוואַנטאַגעס

12

Takagi עט על., דער פאַבריק זשורנאַל, 2013

● פּינטלעך לאָוקאַלאַזיישאַן: מיקסינג בולקס מיט 30+30 צו 200+200 מענטשן צו מינאַמייז הינטערגרונט ראַש;ניט-סאַנאַנאַמאַס מיוטאַטאַנץ-באזירט קאַנדידאַט געגנט פּראָגנאָז.

● פולשטענדיק אַנאַליסיס: אין-טיפקייַט קאַנדידאַט דזשין פונקציע אַנאָטאַציע, אַרייַנגערעכנט NR, SwissProt, GO, KEGG, COG, KOG, עטק.

● פאַסטער טערנעראַונד צייט: גיך דזשין לאָוקאַלאַזיישאַן ין 45 ארבעטן טעג.

● ברייט דערפאַרונג: BMK האט קאַנטריביוטיד אין טויזנטער פון טרייץ לאָוקאַלאַזיישאַן, קאַווערינג פאַרשידן מינים ווי קראַפּס, וואַסער פּראָדוקטן, וואַלד, בלומען, פירות, אאז"ו ו.

סערוויס ספּעסאַפאַקיישאַנז

באפעלקערונג:
סעגרעגאַטינג נאָכקום פון עלטערן מיט אַפּאָוזינג פענאָטיפּעס.
למשל פ 2 נאָכקום, באַקקראָססינג (בק), רעקאָמבינאַנט ינברעד שורה (ריל)

מיקסינג בעקן
פֿאַר קוואַליטאַטיווע טרייץ: 30-50 מענטשן (מינימום 20) / פאַרנעם
פֿאַר קוואַנטיטאַטיווע טראַטיס: שפּיץ 5% צו 10% מענטשן מיט עקסטרעם פענאָטיפּעס אין דער גאנצער באַפעלקערונג (מינימום 30+30).

רעקאַמענדיד סיקוואַנסינג טיפקייַט
אין מינדסטער 20 קס / פאָטער און 1 קס / זאמען יחיד (למשל פֿאַר זאמען מיקסינג בעקן פון 30 + 30 יחיד, סיקוואַנסינג טיפקייַט וועט זיין 30 קס פּער פאַרנעם)

ביאָינפאָרמאַטיקס אַנאַליסיס

● גאַנץ גענאָמע ריסעקווענסינג
 
● דאַטאַ פּראַסעסינג
 
● סנפּ / ינדעל פאַך
 
● קאַנדידאַט געגנט זיפּונג
 
● קאַנדידאַט דזשין פונקציאָנירן אַנאָטאַציע

流程图-BS-A1

מוסטער רעקווירעמענץ און עקספּרעס

מוסטער רעקווירעמענץ:

נוקלעאָטידע:

גDNA מוסטער

געוועב מוסטער

קאַנסאַנטריישאַן: ≥30 נג/μל

געוויקסן: 1-2 ג

סומע: ≥2 μג (באַנד ≥15 μl)

אַנימאַלס: 0.5-1 ג

ריינקייַט: OD260/280= 1.6-2.5

גאַנץ בלוט: 1.5 מל

סערוויס אַרבעט לויפן

מוסטער QC

עקספּערימענט פּלאַן

מוסטער עקספּרעס

מוסטער עקספּרעס

פּילאָט עקספּערימענט

רנאַ יקסטראַקשאַן

ביבליאָטעק צוגרייטונג

ביבליאָטעק קאַנסטראַקשאַן

סיקוואַנסינג

סיקוואַנסינג

דאַטאַ אַנאַליסיס

דאַטאַ אַנאַליסיס

נאָך פאַרקויף באַדינונגס

נאָך-פאַרקויף באַדינונגען


  • פֿריִער:
  • ווייַטער:

  • 1.Association אַנאַליסיס באַזע אויף עוקלידיאַן דיסטאַנסע (עד) צו ידענטיפיצירן קאַנדידאַט געגנט.אין די פאלגענדע פיגור

    X-אַקס: טשראָמאָסאָם נומער;יעדער פּונקט רעפּראַזענץ אַן עד ווערט פון אַ SNP.די שווארצע שורה שטימען צו פיטאַד עד ווערט.א העכער עד ווערט ינדיקייץ אַ מער באַטייטיק פאַרבאַנד צווישן דעם פּלאַץ און די פענאָטיפּע.רויט לאָך שורה רעפּראַזענץ שוועל פון באַטייַטיק פאַרבאַנד.

    mRNA-FLNC-לייענען-לענג-פאַרשפּרייטונג

     

    2.אַססאָסיאַטיאָן אַנאַליסיס באזירט קיין סנפּ-אינדעקס

    X-אַקס: טשראָמאָסאָם נומער;יעדער פּונקט רעפּראַזענץ די SNP-אינדעקס ווערט.די שוואַרץ שורה שטייט פֿאַר פיטאַד SNP-אינדעקס ווערט.די גרעסערע די ווערט איז, די מער באַטייַטיק די פאַרבאַנד איז.

    מרנאַ-קאָמפּלעטע-אָרף-לענג-פאַרשפּרייטונג

     

    BMK קאַסע

    די הויפּט-ווירקונג קוואַנטיטאַטיווע טרייט לאָקוס Fnl7.1 ענקאָודאַז אַ שפּעט עמבריאָגענעסיס שעפעדיק פּראָטעין פֿאַרבונדן מיט פרוכט האַלדז לענג אין וגערקע

    ארויס: פּלאַנט ביאָטעטשנאָלאָגי זשורנאַל, 2020

    סיקוואַנסינג סטראַטעגיע:

    עלטערן (Jin5-508, YN): גאַנץ גענאָמע ריסעקווענסינג פֿאַר 34 × און 20 ×.

    דנאַ פּאָאָלס (50 לאַנג-האַלדז און 50 קורץ-האַלדז): רעסעקווענסינג פֿאַר 61 × און 52 ×

    שליסל רעזולטאַטן

    אין דעם לערנען, סעגרעגאַטינג באַפעלקערונג (F2 און F2:3) איז דזשענערייטאַד דורך אַריבער די לאַנג-האַלדז וגערקע שורה Jin5-508 און קורץ-האַלדז YN.צוויי דנאַ פּאָאָלס זענען קאַנסטראַקטאַד דורך 50 עקסטרעם לאַנג-האַלדז מענטשן און 50 עקסטרעם קורץ-האַלדז מענטשן.הויפּט-ווירקונג QTL איז יידענאַפייד אויף Chr07 דורך BSA אַנאַליסיס און טראדיציאנעלן QTL מאַפּינג.דער קאַנדידאַט געגנט איז געווען ווייַטער נעראָוד דורך פייַן-מאַפּינג, דזשין אויסדרוק קוואַנטאַפאַקיישאַן און טראַנסגעניק יקספּעראַמאַנץ, וואָס אנטפלעקט שליסל דזשין אין קאַנטראָולינג האַלדז-לענג, CsFnl7.1.אין אַדישאַן, פּאָלימאָרפיסם אין CsFnl7.1 פּראָמאָטער געגנט איז געווען פארבונדן מיט קאָראַספּאַנדינג אויסדרוק.ווייַטער פילאָגענעטיק אַנאַליסיס סאַגדזשעסטיד אַז Fnl7.1 לאָקוס איז זייער מסתּמא צו זיין ערידזשאַנייטאַד פון ינדיאַ.

    פּב-פול-לענג-רנאַ-סעקווענסינג-פאַל-שטודיע

    QTL-מאַפּינג אין BSA אַנאַליסיס צו ידענטיפיצירן קאַנדידאַט געגנט פֿאַרבונדן מיט וגערקע האַלדז לענג

    פּב-פול-לענג-רנאַ-אָלטערנאַטיוו-ספּלייסינג

    LOD פּראָופיילז פון וגערקע האַלדז-לענג QTL יידענאַפייד אויף Chr07

     
    רעפערענץ

    זו, X., עט על."די הויפּט-ווירקונג קוואַנטיטאַטיווע טרייט לאָקוס Fnl7.1 ענקאָודאַז אַ שפּעט עמבריאָגענעסיס שעפעדיק פּראָטעין פֿאַרבונדן מיט פרוכט האַלדז לענג אין וגערקע."פּלאַנט ביאָטעטשנאָלאָגי זשורנאַל 18.7 (2020).

    באַקומען אַ ציטירן

    שרייב דיין אָנזאָג דאָ און שיקן עס צו אונדז

    שיקן דיין אָנזאָג צו אונדז: