Ngăn kéo bản đồ nhiệt được sử dụng để vẽ bản đồ nhiệt, có thể lọc, chuẩn hóa và phân cụm dữ liệu ma trận. Nó chủ yếu được sử dụng để phân tích cụm mức độ biểu hiện gen giữa các mẫu khác nhau.
Gắn chức năng sinh học vào các trình tự trong file FASTA bằng cách căn chỉnh các trình tự vào cơ sở dữ liệu, bao gồm NR, KEGG, COG, SwissProt, TrEMBL, KOG, Pfam.
BLAST (Công cụ tìm kiếm căn chỉnh cục bộ cơ bản) là một thuật toán và chương trình để tìm các vùng có trình tự sinh học tương tự.Nó so sánh các chuỗi này với cơ sở dữ liệu chuỗi và tính toán ý nghĩa thống kê.BLAST bao gồm bốn loại công cụ dựa trên loại trình tự: blastn, Lastp, blastx và tblastn.