RNA nhỏ là loại RNA không mã hóa ngắn, có chiều dài trung bình từ 18-30 nt, bao gồm miRNA, siRNA và piRNA.Những RNA nhỏ này đã được báo cáo rộng rãi là có liên quan đến nhiều quá trình sinh học khác nhau như suy thoái mRNA, ức chế dịch mã, hình thành chất dị nhiễm sắc, v.v. Phân tích trình tự RNA nhỏ đã được áp dụng rộng rãi trong các nghiên cứu về sự phát triển của động vật/thực vật, bệnh tật, virus, v.v. nền tảng phân tích trình tự bao gồm phân tích tiêu chuẩn và khai thác dữ liệu nâng cao.Trên cơ sở dữ liệu RNA-seq, phân tích tiêu chuẩn có thể đạt được nhận dạng và dự đoán miRNA, dự đoán, chú thích và phân tích biểu hiện gen mục tiêu miRNA.Phân tích nâng cao cho phép tìm kiếm và trích xuất miRNA tùy chỉnh, tạo sơ đồ Venn, miRNA và xây dựng mạng lưới gen mục tiêu.
