Việc phân lập hạt nhân đạt được nhờ 10× Genomics CromTM, bao gồm hệ thống vi lỏng tám kênh với các giao điểm kép.Trong hệ thống này, một hạt gel có mã vạch và mồi, enzyme và một nhân duy nhất được gói gọn trong giọt dầu có kích thước nanolit, tạo ra Gel Bead-in-Emulsion (GEM).Sau khi GEM được hình thành, quá trình ly giải tế bào và giải phóng mã vạch được thực hiện trong mỗi GEM.mRNA được phiên mã ngược thành các phân tử cDNA với mã vạch 10× và UMI, chúng còn phải tuân theo việc xây dựng thư viện giải trình tự tiêu chuẩn.
Tế bào / mô | Lý do |
Khăn giấy đông lạnh chưa tươi | Không thể có được các tổ chức mới hoặc đã lưu từ lâu |
Tế bào cơ, tế bào Megakaryocyte, chất béo… | Đường kính tế bào quá lớn để đưa vào thiết bị |
Gan… | Quá mong manh dễ vỡ, không thể phân biệt được các tế bào đơn lẻ |
Tế bào thần kinh, não… | Nhạy cảm hơn, dễ stress hơn, sẽ làm thay đổi kết quả giải trình tự |
Tuyến tụy, tuyến giáp… | Giàu enzyme nội sinh, ảnh hưởng đến việc sản xuất huyền phù tế bào đơn |
hạt nhân đơn | Đơn bào |
Đường kính tế bào không giới hạn | Đường kính tế bào: 10-40 μm |
Vật liệu có thể là mô đông lạnh | Chất liệu phải là khăn giấy tươi |
Căng thẳng thấp của tế bào đông lạnh | Xử lý bằng enzyme có thể gây ra phản ứng căng thẳng tế bào |
Không có tế bào hồng cầu cần phải loại bỏ | Các tế bào hồng cầu cần phải được loại bỏ |
Hạt nhân thể hiện thông tin sinh học | Toàn bộ tế bào biểu hiện thông tin sinh học |
Thư viện | Chiến lược tuần tự | Khối lượng dữ liệu | Yêu cầu mẫu | Mô |
Thư viện hạt nhân đơn 10× | Bộ gen 10x -Illumina PE150 | Khoảng 100.000 lượt đọc/ô100-200 Gb | Số ô: >2×105 tế bào conc.ở mức 700-1.200 tế bào/μL | ≥ 200 mg |
Để biết thêm chi tiết về hướng dẫn chuẩn bị mẫu và quy trình dịch vụ, vui lòng nói chuyện vớichuyên gia BMKGENE
1. Phân cụm điểm
2. Bản đồ nhiệt phân cụm biểu thức đánh dấu
3. Phân bố gen tạo thành các cụm khác nhau
4. Phân tích quỹ đạo tế bào/thời gian giả