-
BSA
Nền tảng Phân tích phân tách hàng loạt bao gồm phân tích tiêu chuẩn một bước và phân tích nâng cao với cài đặt tham số tùy chỉnh.BSA là một kỹ thuật được sử dụng để nhanh chóng xác định các dấu hiệu di truyền liên quan đến kiểu hình.Quy trình làm việc chính của BSA bao gồm: 1. chọn hai nhóm cá thể có kiểu hình cực kỳ đối lập nhau;2. gộp DNA, RNA hoặc SLAF-seq(Được phát triển bởi Biomarker) của tất cả các cá nhân để tạo thành hai khối DNA;3. xác định các trình tự khác biệt so với bộ gen tham chiếu hoặc ở giữa, 4. dự đoán các vùng liên kết ứng cử viên bằng thuật toán chỉ số ED và SNP;5. Phân tích chức năng và làm phong phú các gen ở các vùng ứng cử viên, v.v. Khai thác dữ liệu nâng cao hơn bao gồm sàng lọc dấu hiệu di truyền và thiết kế mồi cũng có sẵn.
-
Khuếch đại (16S/18S/ITS)
Nền tảng Amplicon (16S/18S/ITS) được phát triển với nhiều năm kinh nghiệm trong phân tích dự án đa dạng vi sinh vật, bao gồm phân tích cơ bản được tiêu chuẩn hóa và phân tích được cá nhân hóa: phân tích cơ bản bao gồm nội dung phân tích chính thống của nghiên cứu vi sinh vật hiện tại, nội dung phân tích rất phong phú và toàn diện, và kết quả phân tích được trình bày dưới dạng báo cáo dự án;Nội dung phân tích được cá nhân hóa rất đa dạng.Các mẫu có thể được chọn và các tham số có thể được đặt linh hoạt theo báo cáo phân tích cơ bản và mục đích nghiên cứu để hiện thực hóa các yêu cầu được cá nhân hóa.Hệ điều hành Windows đơn giản và nhanh chóng.
-
Di truyền học tiến hóa
Di truyền học tiến hóa là một dịch vụ giải trình tự đóng gói được thiết kế để cung cấp giải thích toàn diện về thông tin tiến hóa của các vật liệu nhất định dựa trên các biến thể di truyền, bao gồm SNP, InDels, SV và CNV.Nó cung cấp tất cả các phân tích cơ bản cần thiết để mô tả những thay đổi tiến hóa và đặc điểm di truyền của quần thể, chẳng hạn như cấu trúc quần thể, đa dạng di truyền, mối quan hệ phát sinh gen, v.v. Nó cũng chứa các nghiên cứu về dòng gen, cho phép ước tính quy mô quần thể hiệu quả, thời gian phân kỳ.
-
Bộ gen so sánh
Bộ gen so sánh theo nghĩa đen có nghĩa là so sánh trình tự và cấu trúc bộ gen hoàn chỉnh của các loài khác nhau.Bộ môn này nhằm mục đích tiết lộ sự tiến hóa của loài, chức năng gen, cơ chế điều hòa gen ở cấp độ bộ gen bằng cách xác định cấu trúc trình tự và các yếu tố được bảo tồn hoặc phân biệt giữa các loài khác nhau.Nghiên cứu genomics so sánh điển hình bao gồm các phân tích về họ gen, sự phát triển tiến hóa, sao chép toàn bộ bộ gen, áp lực chọn lọc, v.v.
-
Di truyền học tiến hóa
Nền tảng phân tích di truyền tiến hóa và quần thể được thành lập dựa trên kinh nghiệm dày dặn được tích lũy trong đội ngũ R&D của BMK trong nhiều năm.Nó là một công cụ thân thiện với người dùng, đặc biệt dành cho các nhà nghiên cứu không chuyên về tin sinh học.Nền tảng này cho phép phân tích cơ bản liên quan đến di truyền tiến hóa bao gồm xây dựng cây phát sinh gen, phân tích mất cân bằng liên kết, đánh giá đa dạng di truyền, phân tích quét chọn lọc, phân tích mối quan hệ họ hàng, PCA, phân tích cấu trúc quần thể, v.v.
-
Bộ gen dựa trên Hi-C
Hi-C là phương pháp được thiết kế để nắm bắt cấu hình nhiễm sắc thể bằng cách kết hợp việc thăm dò các tương tác dựa trên vùng lân cận và giải trình tự thông lượng cao.Cường độ của những tương tác này được cho là có mối tương quan nghịch với khoảng cách vật lý trên nhiễm sắc thể.Do đó, dữ liệu Hi-C có thể hướng dẫn phân cụm, sắp xếp và định hướng các chuỗi được tập hợp trong bộ gen dự thảo và neo chúng vào một số lượng nhiễm sắc thể nhất định.Công nghệ này cho phép tập hợp bộ gen ở cấp độ nhiễm sắc thể khi không có bản đồ di truyền dựa trên quần thể.Mỗi bộ gen đều cần có Hi-C.
Nền tảng：Nền tảng Illumina NovaSeq / DNBSEQ
-
Trình tự bộ gen De Novo của thực vật/động vật
De Novogiải trình tự đề cập đến việc xây dựng toàn bộ bộ gen của một loài bằng cách sử dụng các công nghệ giải trình tự, ví dụ như PacBio, Nanopore, NGS, v.v., khi không có bộ gen tham chiếu.Sự cải thiện đáng kể về độ dài đọc của các công nghệ giải trình tự thế hệ thứ ba đã mang lại cơ hội mới trong việc tập hợp các bộ gen phức tạp, chẳng hạn như các bộ gen có tỷ lệ dị hợp tử cao, tỷ lệ vùng lặp lại, đa bội cao, v.v. Với độ dài đọc ở mức hàng chục kilobase, các lần đọc trình tự này cho phép giải quyết các phần tử lặp đi lặp lại, các vùng có hàm lượng GC bất thường và các vùng có độ phức tạp cao khác.
Nền tảng: PacBio Sequel II /Nanopore PromethION P48/ Nền tảng Illumina NovaSeq
-
Giải trình tự toàn bộ exome của con người
Giải trình tự toàn bộ exome (WES) được coi là chiến lược giải trình tự hiệu quả về mặt chi phí để xác định các đột biến gây bệnh.Mặc dù exon chỉ chiếm khoảng 1,7% toàn bộ bộ gen, nhưng nó đại diện trực tiếp cho toàn bộ chức năng của protein.Trong bộ gen của con người, người ta đã báo cáo rằng hơn 85% đột biến liên quan đến bệnh tật xảy ra ở vùng mã hóa protein.
BMKGENE cung cấp các dịch vụ giải trình tự toàn bộ exome của con người một cách toàn diện và linh hoạt với các chiến lược thu thập exon khác nhau có sẵn để đáp ứng các mục tiêu nghiên cứu khác nhau.
Nền tảng: Nền tảng Illumina NovaSeq
-
Trình tự phân đoạn khuếch đại theo vị trí cụ thể (SLAF-Seq)
Kiểu gen thông lượng cao, đặc biệt là trên quần thể quy mô lớn, là một bước cơ bản trong nghiên cứu liên kết di truyền, cung cấp cơ sở di truyền cho việc khám phá gen chức năng, phân tích tiến hóa, v.v. Thay vì sắp xếp lại toàn bộ bộ gen, giảm trình tự bộ gen đại diện (RRGS) ) được giới thiệu để giảm thiểu chi phí giải trình tự trên mỗi mẫu, đồng thời duy trì hiệu quả hợp lý trong việc phát hiện dấu hiệu di truyền.Điều này thường đạt được bằng cách trích xuất đoạn hạn chế trong phạm vi kích thước nhất định, được đặt tên là thư viện biểu diễn rút gọn (RRL).Giải trình tự đoạn khuếch đại locus cụ thể (SLAF-Seq) là một chiến lược tự phát triển để xác định kiểu gen SNP có hoặc không có bộ gen tham chiếu.
Nền tảng: Nền tảng Illumina NovaSeq -
Illumina và BGI
Công nghệ giải trình tự Illumina, dựa trên Giải trình tự tổng hợp (SBS), là một cải tiến NGS được áp dụng trên toàn cầu, chịu trách nhiệm tạo ra hơn 90% dữ liệu giải trình tự của thế giới.Nguyên lý của SBS liên quan đến việc chụp ảnh các đầu cuối có thể đảo ngược được đánh dấu bằng huỳnh quang khi mỗi dNTP được thêm vào và sau đó được phân cắt để cho phép kết hợp với cơ sở tiếp theo.Với tất cả bốn dNTP liên kết với đầu cuối có thể đảo ngược có mặt trong mỗi chu kỳ giải trình tự, cạnh tranh tự nhiên sẽ giảm thiểu sai lệch kết hợp.Công nghệ linh hoạt này hỗ trợ cả thư viện đọc đơn và thư viện đọc đôi, phục vụ cho nhiều ứng dụng về gen.Khả năng thông lượng cao và độ chính xác của trình tự Illumina đã đặt nó làm nền tảng trong nghiên cứu bộ gen, trao quyền cho các nhà khoa học làm sáng tỏ sự phức tạp của bộ gen với độ chi tiết và hiệu quả chưa từng có.
DNBSEQ, do BGI phát triển, là một công nghệ NGS cải tiến khác đã giúp giảm hơn nữa chi phí giải trình tự và tăng thông lượng.Việc chuẩn bị các thư viện DNBSEQ bao gồm phân mảnh DNA, chuẩn bị ssDNA và khuếch đại vòng tròn lăn để thu được các quả cầu nano DNA (DNB).Sau đó, chúng được tải lên một bề mặt rắn và sau đó được sắp xếp theo trình tự bằng Tổng hợp đầu dò-neo tổ hợp (cPAS).
Dịch vụ giải trình tự thư viện được tạo sẵn của chúng tôi tạo điều kiện cho khách hàng chuẩn bị thư viện giải trình tự từ nhiều nguồn khác nhau (mRNA, toàn bộ bộ gen, khuếch đại, v.v.).Sau đó, các thư viện này có thể được chuyển đến các trung tâm giải trình tự của chúng tôi để kiểm soát chất lượng và giải trình tự trên nền tảng Illumina hoặc BGI.
