-
Trình tự giảm miễn dịch nhiễm sắc thể (ChIP-seq)
ChIP-Seq cung cấp hồ sơ DNA mục tiêu trên toàn bộ bộ gen để sửa đổi histone, các yếu tố phiên mã và các protein liên quan đến DNA khác.Nó kết hợp tính chọn lọc của quá trình kết tủa miễn dịch nhiễm sắc (ChIP) để phục hồi các phức hợp protein-DNA cụ thể, với sức mạnh của giải trình tự thế hệ tiếp theo (NGS) để giải trình tự thông lượng cao của DNA đã phục hồi.Ngoài ra, do phức hợp protein-DNA được thu hồi từ các tế bào sống nên các vị trí gắn kết có thể được so sánh ở các loại tế bào và mô khác nhau hoặc trong các điều kiện khác nhau.Các ứng dụng bao gồm từ điều hòa phiên mã đến con đường phát triển đến cơ chế gây bệnh và hơn thế nữa.
Nền tảng: Nền tảng Illumina NovaSeq
-
Giải trình tự bisulfit toàn bộ bộ gen
Quá trình methyl hóa DNA ở vị trí thứ năm trong cytosine (5-mC) có ảnh hưởng cơ bản đến sự biểu hiện gen và hoạt động của tế bào.Các kiểu methyl hóa bất thường có liên quan đến một số tình trạng và bệnh tật, chẳng hạn như ung thư.WGBS đã trở thành tiêu chuẩn vàng để nghiên cứu quá trình methyl hóa toàn bộ gen ở độ phân giải cơ sở duy nhất.
Nền tảng: Nền tảng Illumina NovaSeq
-
Xét nghiệm chất nhiễm sắc có thể truy cập bằng Transposease với trình tự thông lượng cao (ATAC-seq)
ATAC-seq là một phương pháp giải trình tự thông lượng cao để phân tích khả năng tiếp cận nhiễm sắc thể trên toàn bộ gen, điều này rất quan trọng để kiểm soát biểu hiện gen toàn cầu.Bộ điều hợp trình tự được chèn vào các vùng nhiễm sắc mở bằng transposease Tn5 siêu hoạt động.Sau khi khuếch đại PCR, một thư viện giải trình tự sẽ được xây dựng.Tất cả các vùng nhiễm sắc mở có thể thu được trong một điều kiện không-thời gian cụ thể, không chỉ giới hạn ở các vị trí liên kết của yếu tố phiên mã hoặc một vùng biến đổi histone nhất định.
-
Giảm trình tự bisulfite đại diện (RRBS)
Nghiên cứu methyl hóa DNA luôn là chủ đề nóng trong nghiên cứu bệnh tật và liên quan chặt chẽ đến biểu hiện gen và đặc điểm kiểu hình.RRBS là một phương pháp chính xác, hiệu quả và tiết kiệm cho nghiên cứu methyl hóa DNA.Làm giàu vùng khởi động và vùng đảo CpG bằng cách phân tách enzyme (Msp I), kết hợp với giải trình tự Bisulfite, cung cấp khả năng phát hiện quá trình methyl hóa DNA có độ phân giải cao.
Nền tảng: Nền tảng Illumina NovaSeq
