Lấy dữ liệu giải trình tự Isoform của Pacific Biosciences (PacBio) làm đầu vào, Ứng dụng này có thể xác định các chuỗi bản ghi có độ dài đầy đủ (không cần lắp ráp).Bằng cách ánh xạ các chuỗi có độ dài đầy đủ dựa trên bộ gen tham chiếu, bản phiên mã có thể được tối ưu hóa bởi các gen, bản phiên mã, vùng mã hóa đã biết, v.v. Trong trường hợp này, có thể đạt được việc xác định chính xác hơn các cấu trúc mRNA, chẳng hạn như ghép nối thay thế, v.v..Phân tích chung với dữ liệu giải trình tự phiên mã NGS cho phép chú thích toàn diện hơn và định lượng chính xác hơn trong biểu thức ở cấp độ phiên mã, điều này phần lớn mang lại lợi ích cho phân tích chức năng và biểu thức vi phân ở hạ nguồn.