TIẾN HÓA GEN
Bộ gen mới
Hội|Xác định giới tính Toàn bộ công việc giải trình tự và các dịch vụ tin sinh học một phần được cung cấp bởi Biomarker Techonology.
trừu tượng
“Kiểu hình mang tính biểu tượng của seadragons bao gồm các phần phụ giống như chiếc lá, miệng hình ống không có răng và việc mang thai con đực liên quan đến việc ấp trứng đã thụ tinh trên một “mảng bố mẹ” mở.Chúng tôi đã giải trình tự bộ gen đực và cái của loài rồng biển thông thường (Phyllopteryx taeniolatus) và các loài có liên quan chặt chẽ với nó, cá chìa vôi cá sấu (Syngnathoides biaculeatus).Hồ sơ phiên mã từ một điểm mới lạ về mặt tiến hóa, các phần phụ giống như chiếc lá, cho thấy rằng một bộ gen thường liên quan đến sự phát triển vây đã được đồng chọn cũng như làm phong phú thêm các tập lệnh phiên mã để sửa chữa mô tiềm năng và các gen bảo vệ miễn dịch.Các đột biến của cá ngựa vằn đối với scpp5, vốn bị mất ở tất cả các syngnathid, được phát hiện là thiếu hoặc có răng hầu bị biến dạng, ủng hộ giả thuyết rằng việc mất scpp5 đã góp phần làm mất răng ở các syngnathid.Một locus xác định giới tính giả định mã hóa gen amhr2y dành riêng cho con đực được chia sẻ bởi cá chìa vôi và cá sấu thông thường đã được xác định. ”
Nguyên liệu và phương pháp:
Nguyên vật liệu
Fseadragon chung của chúng ta (P. taeniolatus) và hai con cá chìa vôi (S. biaculeatus) mẫu vật.Hai cá thể rồng biển thông thường (một con đực và một con cái) và hai cá thể cá sấu (một con đực và một con cái) đã được sử dụng để giải trình tự toàn bộ bộ gen và hai cá thể rồng biển thông thường đực khác được sử dụng để sắp xếp lại bộ gen.
Chiến lược giải trình tự bộ gen
2Thư viện 70/350 bp (Hiseq 2500) + Pacbio 20Kb (Sequel) hoặc Nanopore 30 Kb (MinION)+ Hi-C (NovaSeq 6000).sequencing và hai cá thể rồng biển đực thông thường khác đã được sử dụng để sắp xếp lại bộ gen.
Trình tự phiên mã
Fhoặc cá rồng thông thường, não, mắt, mang, gan, tim, thận, mạc treo, ruột, cơ, vây, da, các phần phụ dạng lá, tinh hoàn và buồng trứng đều được thu thập.
Chiến lược lắp ráp bộ gen mới
Canu (Chỉnh sửa) + WTDBG2 (Hội) + Pilon(Ba Lan) + Lachesis (Hi-C).
Kêt quả chung cuộc
Hình 1. Các đặc điểm chính của cá rồng biển thông thường (P. taeniolatus) và cá chìa vôi cá sấu (S. biaculeatus) và vị trí phát sinh loài của chúng.
Hình 2. Hình thái và cấu trúc di truyền của các phần phụ dạng lá ở cá rồng biển thông thường (P. taeniolatus).
Hình 3. Gen xác định giới tính giả định ở cá rồng biển thông thường (P. taeniolatus) và cá chìa vôi cá sấu (S. biaculeatus).
Hình 4. Kiểu hình răng hầu ở cá ngựa vằn đột biến đồng hợp tử scpp5.
Thời gian đăng: Jan-08-2022