Các dạng đồng phân thay thế phức tạp và biến đổi trong sinh vật là cơ chế di truyền quan trọng để điều chỉnh biểu hiện gen và đa dạng protein.Việc xác định chính xác cấu trúc phiên mã là cơ sở để nghiên cứu chuyên sâu về các kiểu điều hòa biểu hiện gen.Nền tảng giải trình tự Nanopore đã đưa thành công nghiên cứu phiên mã lên cấp độ isoform.Nền tảng phân tích này được thiết kế để phân tích dữ liệu RNA-Seq được tạo trên nền tảng Nanopore dựa trên bộ gen tham chiếu, giúp đạt được các phân tích định tính và định lượng ở cả cấp độ gen và cấp độ phiên mã.