Transcriptome là mối liên kết giữa thông tin di truyền của bộ gen và hệ protein của chức năng sinh học.Điều hòa mức độ phiên mã là chế độ điều hòa quan trọng nhất và được nghiên cứu rộng rãi nhất của sinh vật.Trình tự phiên mã có thể sắp xếp trình tự phiên mã tại bất kỳ thời điểm nào hoặc trong bất kỳ điều kiện nào, với độ phân giải chính xác đến từng nucleotide. Nó có thể phản ánh linh hoạt mức độ phiên mã gen, đồng thời xác định và định lượng các bản phiên mã hiếm và bình thường, đồng thời cung cấp thông tin cấu trúc của mẫu biên bản cụ thể.
Hiện nay, công nghệ giải trình tự phiên mã đã được sử dụng rộng rãi trong nông học, y học và các lĩnh vực nghiên cứu khác, bao gồm điều hòa phát triển động vật và thực vật, thích ứng với môi trường, tương tác miễn dịch, định vị gen, tiến hóa di truyền loài và phát hiện khối u và bệnh di truyền.
