Nghiên cứu kết hợp trên toàn bộ gen (GWAS) nhằm mục đích xác định các biến thể di truyền (kiểu gen) liên quan đến các đặc điểm cụ thể (kiểu hình).Các nghiên cứu của GWA điều tra các dấu hiệu di truyền trên toàn bộ bộ gen của một số lượng lớn cá thể và dự đoán mối liên hệ kiểu hình-kiểu gen bằng phân tích thống kê ở cấp độ quần thể.Việc sắp xếp lại toàn bộ bộ gen có thể phát hiện ra tất cả các biến thể di truyền.Kết hợp với dữ liệu kiểu hình, GWAS có thể được xử lý để xác định SNP, QTL và các gen ứng cử viên liên quan đến kiểu hình, hỗ trợ mạnh mẽ cho việc nhân giống động vật/thực vật hiện đại.SLAF là một chiến lược giải trình tự bộ gen đơn giản hóa do tự phát triển, giúp phát hiện ra các dấu hiệu phân bố trên toàn bộ bộ gen, SNP.Những SNP này, như các dấu hiệu di truyền phân tử, có thể được xử lý cho các nghiên cứu liên kết với các đặc điểm mục tiêu.Đây là một chiến lược tiết kiệm chi phí trong việc xác định các đặc điểm phức tạp liên quan đến các biến thể di truyền.
