BMKGENE đã cung cấp dịch vụ giải trình tự phiên mã không gian cho nghiên cứu “Thép cho phép phân định dữ liệu phiên mã không gian theo thời gian với độ phân giải cao”, được xuất bản trên Briefings in Bioinformatics.
Nghiên cứu này đề xuất một thuật toán dựa trên học tập không giám sát và đa dạng, phân cụm cEll typeE (STEEL), xác định các miền từ bản phiên mã không gian bằng cách phân cụm các hạt biểu hiện cả cấu hình biểu hiện gen rất giống nhau và khoảng cách không gian gần theo cách biểu đồ.
Đánh giá toàn diện về STEEL trên các bộ dữ liệu phiên mã không gian từ nền tảng 10X Visium chứng minh rằng nó không chỉ đạt được độ phân giải cao để mô tả các cấu trúc tinh tế của não chuột mà còn cho phép tích hợp nhiều slide mô được phân tích riêng lẻ thành một slide lớn hơn.
Với sự tiến bộ của công nghệ phiên mã không gian, phương pháp của chúng tôi sẽ có khả năng ứng dụng lớn trong việc xác định miền và tái tạo bản đồ biểu hiện gen.
Nhấp chuộtđâyđể tìm hiểu thêm về nghiên cứu này.
Thời gian đăng: Oct-20-2023