-
Giải trình tự kết tủa miễn dịch nhiễm sắc thể (ChIP-seq)
ChIP-Seq cung cấp cấu hình toàn bộ gen của các mục tiêu DNA để sửa đổi histone, các yếu tố phiên mã và các protein liên kết DNA khác.Nó kết hợp tính chọn lọc của kết tủa miễn dịch nhiễm sắc (ChIP) để phục hồi các phức hợp protein-DNA cụ thể, với sức mạnh của giải trình tự thế hệ tiếp theo (NGS) để giải trình tự thông lượng cao của DNA được phục hồi.Ngoài ra, vì phức hợp protein-DNA được phục hồi từ các tế bào sống, các vị trí liên kết có thể được so sánh trong các loại tế bào và mô khác nhau hoặc trong các điều kiện khác nhau.Các ứng dụng bao gồm từ quy định phiên mã đến các con đường phát triển đến các cơ chế bệnh tật và hơn thế nữa.
Nền tảng: Illumina NovaSeq 6000
-
Giải trình tự toàn bộ bộ gen
Sự methyl hóa DNA ở vị trí thứ năm trong cytosine (5-mC) có ảnh hưởng cơ bản đến sự biểu hiện gen và hoạt động của tế bào.Các mô hình methyl hóa bất thường có liên quan đến một số tình trạng và bệnh tật, chẳng hạn như ung thư.WGBS đã trở thành tiêu chuẩn vàng để nghiên cứu quá trình metyl hóa toàn bộ gen ở độ phân giải bazơ đơn.
Nền tảng: Illumina NovaSeq6000
-
Thử nghiệm cho chất nhiễm sắc có thể tiếp cận với Transposase với giải trình tự thông lượng cao (ATAC-seq)
ATAC-seq là một phương pháp giải trình tự thông lượng cao để phân tích khả năng tiếp cận của chất nhiễm sắc trên toàn bộ bộ gen, điều này rất quan trọng đối với việc kiểm soát biểu hiện gen trên toàn cầu.Các bộ tiếp hợp trình tự được đưa vào các vùng nhiễm sắc mở bởi transposase Tn5 hoạt động mạnh.Sau khi khuếch đại PCR, một thư viện giải trình tự được xây dựng.Tất cả các vùng nhiễm sắc mở có thể thu được trong một điều kiện không-thời gian cụ thể, không chỉ giới hạn ở các vị trí liên kết của một yếu tố phiên mã, hoặc một vùng biến đổi histone nhất định.
-
Trình tự phân tích Bisulfite giảm đại diện (RRBS)
Nghiên cứu methyl hóa DNA luôn là một chủ đề nóng trong nghiên cứu bệnh tật, và có liên quan mật thiết đến sự biểu hiện gen và các đặc điểm pheno-typic.RRBS là một phương pháp chính xác, hiệu quả và kinh tế để nghiên cứu quá trình methyl hóa DNA.Làm giàu vùng đảo promoter và CpG bằng cách phân cắt bằng enzym (Msp I), kết hợp với giải trình tự Bisulfite, cung cấp khả năng phát hiện methyl hóa DNA có độ phân giải cao.
Nền tảng: Illumina NovaSeq 6000
