Nền tảng | Kích thước thư viện | Năng suất dữ liệu lý thuyết (mỗi ô) | Độ chính xác cơ sở đơn | Các ứng dụng |
lỗ nano | 8Kb, 10kb, 20kb, Siêu dài, cDNA-PCR | 70-90Gb/Ô | 85-92% | Gọi SV, De novo, Giải trình tự độ dài đầy đủ, Iso-Seq, Chú thích gen, Phát hiện quá trình methyl hóa DNA |
● Hơn 5 năm kinh nghiệm trên nền tảng giải trình tự PacBio với hàng nghìn dự án khép kín với nhiều loài khác nhau.
● BMKGENE là đối tác chính thức của Oxford Nanopore, với chứng nhận RNA/DNA nền tảng kép.
● Có các mô hình máy giải trình tự phổ biến với thiết bị hoàn chỉnh và đủ công suất giải trình tự.
● Dựa trên nền tảng Nanopore, hơn 10 nghiên cứu về động vật và thực vật của Denovo đã được công bố trên các tạp chí nổi tiếng quốc tế.
Loại mẫu | Số lượng | Nồng độ(Qubit ®) | Âm lượng | độ tinh khiết | Người khác |
DNA bộ gen | Phụ thuộc vào yêu cầu dữ liệu | ≥20ng/μl | ≥15μl | OD260/280=1,7-2,2; OD260/230 ≥1.5; Đỉnh rõ ràng ở 260 nm, không có tạp chất | Nồng độ cần đo bằng Qubit và Qubit/Nanopore 2 |
Tổng số RNA | ≥1,2μg | ≥100μg/μl | ≥15μl | OD260/280=1,7-2,5; OD260/230=0,5-2,5;không nhiễm bẩn | Giá trị RIN ≥7,5 |
Đánh giá chất lượng dữ liệu của mẫu DNA
Bảng 1. Thống kê dữ liệu sạch.
BMKID | nguyênSeqNum | rawSumBase | sạchSeqNum | cleanSumBase | sạchN50Len | sạchN90Len | sạchÝ nghĩaLen | sạchMaxLen | sạchTrung bìnhChất lượng |
DNA_BMK01 | 1.218.239 | 26,37 | 1.121.736 | 25:90 | 28.014 | 15.764 | 23.090 | 143.181 | 9 |
Đánh giá chất lượng dữ liệu của mẫu RNA
Bảng 1. Thống kê dữ liệu sạch.
Tên tệp | ID khách hàng | ĐọcSố | Số cơ sở | N50 | Chiêu dai trung binh | Độ dài tối đa | Điểm Q trung bình |
RNA_BMK001 | C2 | 8.947.708 | 4.047.230.083 | 398 | 452 | 129.227 | Q12 |
Hình 1. Phân bố độ dài đọc
Hình 2. Phân bố điểm chất lượng của dữ liệu sạch
Hình 3. Phân bổ độ dài và điểm chất lượng của dữ liệu sạch