giải trình tự CircRNA-Illumina
Đặc trưng
● Sự cạn kiệt rRNA sau đó là chuẩn bị thư viện định hướng, cho phép sắp xếp dữ liệu theo chuỗi cụ thể.
● Quy trình công việc tin sinh học cho phép dự đoán và định lượng biểu hiện CircRNA
Ưu điểm dịch vụ
●Thư viện RNA toàn diện hơn:chúng tôi sử dụng sự suy giảm rRNA thay vì sự suy giảm RNA tuyến tính trong quá trình chuẩn bị trước thư viện, đảm bảo rằng dữ liệu giải trình tự không chỉ bao gồm CircRNA mà còn cả mRNA và lncRNA, cho phép phân tích chung trên các bộ dữ liệu này
●Phân tích tùy chọn mạng lưới RNA nội sinh cạnh tranh (ceRNA): cung cấp những hiểu biết sâu sắc hơn về cơ chế điều hòa tế bào
●Chuyên môn sâu rộng: với thành tích xử lý hơn 20.000 mẫu tại BMK, trải rộng trên nhiều loại mẫu và dự án lncRNA khác nhau, nhóm của chúng tôi mang đến nhiều kinh nghiệm cho mọi dự án.
●Kiểm soát chất lượng nghiêm ngặt: chúng tôi triển khai các điểm kiểm soát cốt lõi trong tất cả các giai đoạn, từ chuẩn bị mẫu và thư viện đến giải trình tự và tin sinh học.Việc giám sát tỉ mỉ này đảm bảo mang lại kết quả chất lượng cao nhất quán.
● Hỗ trợ sau bán hàng: Cam kết của chúng tôi còn vượt xa việc hoàn thành dự án với thời gian dịch vụ sau bán hàng 3 tháng.Trong thời gian này, chúng tôi cung cấp dịch vụ theo dõi dự án, hỗ trợ khắc phục sự cố và các phiên hỏi đáp để giải quyết mọi thắc mắc liên quan đến kết quả.
Yêu cầu mẫu và giao hàng
| Thư viện | Nền tảng | Dữ liệu được đề xuất | Kiểm soát dữ liệu |
| Poly A làm giàu | Chiếu sáng PE150 | 16-20 Gb | Q30 ≥85% |
Yêu cầu mẫu:
Nucleotide:
| Kết quả (ng/μl) | Số lượng (μg) | độ tinh khiết | Chính trực |
| ≥ 100 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Hạn chế hoặc không có ô nhiễm protein hoặc DNA hiển thị trên gel. | Đối với cây trồng: RIN ≥6,5; Đối với động vật: RIN ≥7,0; 5,0 ≥28S/18S ≥1,0; giới hạn hoặc không có độ cao cơ bản |
● Thực vật:
Rễ, thân hoặc cánh hoa: 450 mg
Lá hoặc hạt: 300 mg
Quả: 1,2 g
● Động vật:
Tim hoặc ruột: 450 mg
Nội tạng hoặc Não: 240 mg
Cơ bắp: 600 mg
Xương, Tóc hoặc Da: 1,5g
● Động vật chân đốt:
Côn trùng: 9g
Giáp xác: 450 mg
● Máu toàn phần:2 ống
● Tế bào: 106 tế bào
● Huyết thanh và huyết tương: 6mL
Đề xuất giao hàng mẫu
Bình chứa: Ống ly tâm 2 ml (Không nên dùng giấy thiếc)
Ghi nhãn mẫu: Nhóm+sao chép ví dụ A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Lô hàng:
1. Đá khô: Mẫu cần được đóng gói trong túi và chôn trong đá khô.
2. Ống ổn định RNA: Các mẫu RNA có thể được làm khô trong ống ổn định RNA (ví dụ RNAstable®) và vận chuyển ở nhiệt độ phòng.
Quy trình công việc dịch vụ
Thiết kế thí nghiệm
Phân phối mẫu
Chiết xuất RNA
Xây dựng thư viện
Trình tự
Phân tích dữ liệu
Dịch vụ sau bán hàng
Tin sinh học
dự đoán CircRNA: phân bố nhiễm sắc thể
CircRNA được biểu hiện khác biệt - Âm mưu núi lửa
CircRNA được biểu hiện khác biệt - phân cụm theo cấp bậc
Làm giàu chức năng của gen chủ của CircRNA
Khám phá những tiến bộ nghiên cứu được hỗ trợ bởi các dịch vụ giải trình tự CircRNA của BMKGene thông qua bộ sưu tập các ấn phẩm được tuyển chọn.
Wang, X. và cộng sự.(2021) 'CPSF4 điều chỉnh sự hình thành CircRNA và làm im lặng gen qua trung gian microRNA trong ung thư biểu mô tế bào gan', Oncogene 2021 40:25, 40(25), trang 4338–4351.doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.
Hạ, K. và cộng sự.(2023) 'Bản phiên mã phản ứng X oo cho thấy vai trò của RNA133 vòng trong khả năng kháng bệnh bằng cách điều chỉnh sự biểu hiện của OsARAB trên cây lúa', Nghiên cứu bệnh học thực vật, 5(1), trang 1–14.doi: 10.1186/S42483-023-00188-8/FIGURES/6.
Y, H. và cộng sự.(2023) 'CPSF3 điều chỉnh sự cân bằng của các bản phiên mã vòng và tuyến tính trong ung thư biểu mô tế bào gan'.doi: 10.21203/RS.3.RS-2418311/V1.
Zhang, Y. và cộng sự.(2023) 'Đánh giá toàn diện các CircRNA trong bệnh cơ tim xơ gan trước và sau ghép gan', International Immunopharmacology, 114, p.109495. doi: 10.1016/J.INTIMP.2022.109495.
