● Có sẵn nhiều chiến lược giải trình tự cho các mục tiêu nghiên cứu khác nhau
● Bộ gen hoàn chỉnh của vi khuẩn được đảm bảo bằng 0 Gap.
● Có nhiều kinh nghiệm trong việc tập hợp bộ gen vi khuẩn với hơn 10.000 bộ gen hoàn chỉnh được tập hợp.
● Đội ngũ hỗ trợ kỹ thuật sau bán hàng chuyên nghiệp đáp ứng các nhu cầu nghiên cứu cụ thể hơn.
Trình tựChiến lược | Thư viện | Đảm bảo chất lượng | Thời gian quay vòng ước tính |
Nanopore 100X + Illumina 50X | Nanopore 20K PE150 | 0 khoảng cách | 30 ngày |
PacBio HiFi 30X | PacBio 10K |
● Kiểm soát chất lượng dữ liệu thô
● Tập hợp bộ gen
● Phân tích thành phần bộ gen
● Chú thích chức năng gen
● Phân tích bộ gen so sánh
Vìchiết xuất DNA:
Loại mẫu | Số lượng | Sự tập trung | độ tinh khiết |
chiết xuất DNA | > 2 g | > 20 ng/μl | OD260/280= 1,6-2,5 |
Đối với mẫu mô:
Loại mẫu | Xử lý mẫu đề xuất | Bảo quản và vận chuyển mẫu |
Vi khuẩn | Quan sát vi khuẩn dưới kính hiển vi và thu thập vi khuẩn ở giai đoạn hàm mũ của chúng Chuyển vi khuẩn cấy (chứa khoảng 3-4,5e9 tế bào) vào eppendorf 1,5 hoặc 2 ml.(Giữ trên băng) Ly tâm ống trong 1 phút ở 14000 g để thu thập vi khuẩn và loại bỏ phần nổi phía trên một cách cẩn thận Đậy kín ống và đông lạnh vi khuẩn trong nitơ lỏng ít nhất 30 phút.Bảo quản ống trong tủ lạnh -80oC. | Làm đông lạnh mẫu trong nitơ lỏng trong 3-4 giờ và bảo quản trong nitơ lỏng hoặc -80 độ để bảo quản lâu dài.Cần vận chuyển mẫu bằng đá khô. |
1.Circos bộ gen của vi khuẩn
2.Mã hóa dự đoán gen
3. Phân tích bộ gen so sánh: cây phát sinh gen