Kichik RNK ketma-ketligi - Illumina
Xususiyatlari
● Kutubxonani tayyorlashdan oldin RNK hajmini tanlash
● miRNKni bashorat qilish va ularning maqsadlariga qaratilgan bioinformatik tahlil
Xizmat afzalliklari
●Keng qamrovli bioinformatika tahlili:ham ma'lum, ham yangi miRNKlarni identifikatsiya qilish, miRNK maqsadlarini aniqlash va mos keladigan funktsional izohlar va bir nechta ma'lumotlar bazalari (KEGG, GO) bilan boyitish imkonini beradi.
●Qattiq sifat nazorati: biz namuna va kutubxonani tayyorlashdan tortib, ketma-ketlik va bioinformatikagacha bo'lgan barcha bosqichlarda asosiy nazorat nuqtalarini amalga oshiramiz.Ushbu sinchkovlik bilan monitoring doimiy ravishda yuqori sifatli natijalarni taqdim etishni ta'minlaydi.
●Sotishdan keyingi yordam: Bizning majburiyatimiz sotuvdan keyingi 3 oylik xizmat muddati bilan loyihani yakunlashdan tashqariga chiqadi.Shu vaqt ichida biz natijalar bilan bog'liq har qanday so'rovlarni hal qilish uchun loyihani kuzatish, muammolarni bartaraf etish bo'yicha yordam va savol-javob seanslarini taklif qilamiz.
●Keng ekspertiza: turli tadqiqot sohalarida 100 dan ortiq turlarni qamrab olgan bir nechta sRNK loyihalarini muvaffaqiyatli yakunlash tajribasi bilan bizning jamoamiz har bir loyihaga boy tajriba olib keladi.
Namuna talablari va yetkazib berish
| Kutubxona | Platforma | Tavsiya etilgan maʼlumotlar | Ma'lumotlar QC |
| Hajmi tanlangan | Illumina SE50 | 10-20 million o'qish | Q30≥85% |
Namuna talablari:
Nukleotidlar:
| Kons.(ng/ml) | Miqdori (mkg) | Tozalik | Butunlik |
| ≥ 80 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Jelda ko'rsatilgan protein yoki DNK ifloslanishi cheklangan yoki yo'q. | RIN≥6,5; 5,0≥28S/18S≥1,0; cheklangan yoki asosiy balandlikning yo'qligi |
● O‘simliklar:
Ildiz, poya yoki gulbarg: 450 mg
Barg yoki urug': 300 mg
Meva: 1,2 g
● Hayvon:
Yurak yoki ichak: 450 mg
Ichki organlar yoki miya: 240 mg
Mushaklar: 600 mg
Suyaklar, soch yoki teri: 1,5 g
● Artropodlar:
Hasharotlar: 9 g
Qisqichbaqasimonlar: 450 mg
● To'liq qon: 2 ta naycha
● Hujayralar: 106 hujayralar
● Sarum va plazma:6 ml
Tavsiya etilgan namuna yetkazib berish
Idish:
2 ml santrifüj naychasi (qalay folga tavsiya etilmaydi)
Namuna belgilari: Guruh+takrorlash, masalan, A1, A2, A3;B1, B2, B3 ......
Yuk tashish:
1.Quruq muz: namunalar qoplarga solib, quruq muzga ko'milishi kerak.
2.RNK barqaror naychalar: RNK namunalari RNK stabilizatsiya trubkasida (masalan, RNAstable®) quritilishi va xona haroratida yuborilishi mumkin.
Xizmat ish oqimi
Tajriba dizayni
Namuna yetkazib berish
RNK ekstraktsiyasi
Kutubxona qurilishi
Ketma-ketlik
Ma'lumotlarni tahlil qilish
Sotishdan keyingi xizmatlar
Bioinformatika
MiRNKni aniqlash: tuzilishi va chuqurligi
MiRNKning differentsial ifodasi - iearxik klasterlash
Differensial ifodalangan miRNKlarning maqsadining funktsional izohi
Nashrlar to'plami orqali BMKGene sRNK ketma-ketligi xizmatlari tomonidan taqdim etilgan tadqiqot yutuqlarini o'rganing.
Chen, H. va boshqalar.(2023) "Virusli infektsiyalar Panax notoginsengda saponin biosintezi va fotosintezini inhibe qiladi", O'simlik fiziologiyasi va biokimyosi, 203, p.108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. va boshqalar.(2023) "FYVE domenini o'z ichiga olgan protein FREE1 o'simlik miRNK biogenezini bostirish uchun mikroprotsessor komponentlari bilan bog'lanadi", EMBO hisobotlari, 24(1).doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. va boshqalar.(2023) "MikroRNK Ame-Bantam-3p asalarilar, Apis melliferadagi ko'p epidermal o'sish omiliga o'xshash 8-gen (megf8) domenlarini maqsad qilib, lichinka pupa rivojlanishini boshqaradi, Apis mellifera", Xalqaro molekulyar fanlar jurnali, 24(6), p. .5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. va boshqalar.(2018) 'MiRNK va go'sht sifati bilan bog'liq genlarning integratsiyalashgan tahlili Gga-MiR-140-5p tovuqlarda mushak ichiga yog 'birikishiga ta'sir qilishini aniqlaydi', Hujayra fiziologiyasi va biokimyosi, 46(6), 2421-2433-betlar.doi: 10.1159/000489649.
