-
BSA
Ommaviy Segregant tahlil platformasi bir bosqichli standart tahlil va moslashtirilgan parametr sozlamalari bilan rivojlangan tahlildan iborat.BSA - bu fenotip bilan bog'liq genetik belgilarni tezda aniqlash uchun qo'llaniladigan usul.BSA ning asosiy ish jarayoni quyidagilarni o'z ichiga oladi: 1. o'ta qarama-qarshi fenotipli shaxslarning ikki guruhini tanlash;2. DNKning ikkita asosiy qismini hosil qilish uchun barcha shaxslarning DNK, RNK yoki SLAF-seqsini (Biomarker tomonidan ishlab chiqilgan) birlashtirish;3. mos yozuvlar genomiga yoki ularning orasidagi differensial ketma-ketlikni aniqlash, 4. ED va SNP indeksi algoritmi bo'yicha nomzod bilan bog'langan hududlarni bashorat qilish;5. Nomzod hududlarda genlarni funktsional tahlil qilish va boyitish va boshqalar. Shuningdek, genetik marker skriningi va primer dizaynini o'z ichiga olgan ma'lumotlarda ilg'or konchilik ham mavjud.
-
Amplikon (16S/18S/ITS)
Amplicon (16S/18S/ITS) platformasi mikrobial xilma-xillik loyihasini tahlil qilish boʻyicha koʻp yillik tajribaga ega boʻlib ishlab chiqilgan boʻlib, unda standartlashtirilgan asosiy tahlil va shaxsiylashtirilgan tahlil mavjud: asosiy tahlil joriy mikrobiologik tadqiqotlarning asosiy tahlil mazmunini qamrab oladi, tahlil mazmuni boy va keng qamrovli, va tahlil natijalari loyiha hisobotlari shaklida taqdim etiladi;Shaxsiylashtirilgan tahlilning mazmuni xilma-xildir.Namunalar tanlanishi mumkin va parametrlar shaxsiylashtirilgan talablarni amalga oshirish uchun asosiy tahlil hisoboti va tadqiqot maqsadiga muvofiq moslashuvchan tarzda o'rnatilishi mumkin.Windows operatsion tizimi, oddiy va tez.
-
Evolyutsion genetika
Evolyutsion genetika - bu SNP, InDels, SV va CNVlarni o'z ichiga olgan genetik o'zgarishlarga asoslangan berilgan materiallarning evolyutsion ma'lumotlarini keng qamrovli talqin qilish uchun mo'ljallangan to'plangan ketma-ketlik xizmati.Unda populyatsiyalar tuzilishi, genetik xilma-xillik, filogenez munosabatlari va boshqalar kabi evolyutsion oʻzgarishlar va irsiy xususiyatlarni tavsiflash uchun zarur boʻlgan barcha fundamental tahlillar mavjud. Shuningdek, u populyatsiyaning samarali hajmini, divergentsiya vaqtini baholash imkonini beruvchi genlar oqimi boʻyicha tadqiqotlarni oʻz ichiga oladi.
-
Qiyosiy genomika
Qiyosiy genomika tom ma'noda turli turlarning to'liq genom ketma-ketligi va tuzilmalarini solishtirishni anglatadi.Ushbu intizom turli turlarda saqlanib qolgan yoki farqlanadigan ketma-ketlik tuzilmalari va elementlarni aniqlash orqali genom darajasida turlar evolyutsiyasini, gen funktsiyasini, genlarni tartibga solish mexanizmini ochib berishga qaratilgan.Odatda qiyosiy genomik tadqiqot genlar oilasi, evolyutsion rivojlanish, butun genomning ko'payishi, selektiv bosim va boshqalardagi tahlillarni o'z ichiga oladi.
-
Evolyutsion genetika
Populyatsiya va evolyutsion genetik tahlil platformasi BMK ilmiy-tadqiqot guruhida yillar davomida to'plangan katta tajriba asosida yaratilgan.Bu, ayniqsa, bioinformatika bo'yicha mutaxassis bo'lmagan tadqiqotchilar uchun qulay vositadir.Ushbu platforma evolyutsion genetika bilan bog'liq asosiy tahlillarni, shu jumladan filogenetik daraxt qurilishi, bog'lanish muvozanatini tahlil qilish, genetik xilma-xillikni baholash, selektiv tahlil qilish, qarindoshlik tahlili, PCA, populyatsiya tuzilishi tahlili va boshqalarni o'z ichiga oladi.
-
Hi-C asosidagi Genom Assambleyasi
Hi-C - yaqinlikka asoslangan o'zaro ta'sirlarni tekshirish va yuqori o'tkazuvchanlik ketma-ketligini birlashtirish orqali xromosoma konfiguratsiyasini olish uchun mo'ljallangan usul.Ushbu o'zaro ta'sirlarning intensivligi xromosomalardagi jismoniy masofa bilan salbiy bog'liq deb ishoniladi.Shuning uchun, Hi-C ma'lumotlari qoralama genomda yig'ilgan ketma-ketliklarni klasterlash, tartibga solish va yo'naltirish va ularni ma'lum miqdordagi xromosomalarga bog'lashda yordam berishi mumkin.Ushbu texnologiya populyatsiyaga asoslangan genetik xarita yo'qligida xromosoma darajasidagi genom yig'ilishini kuchaytiradi.Har bir genomga Hi-C kerak.
Platforma: Illumina NovaSeq platformasi / DNBSEQ
-
O'simlik/Hayvon De Novo genomlari ketma-ketligi
De Novosekvensiya deganda sekvensiya texnologiyalaridan foydalangan holda turning butun genomini qurish tushuniladi, masalan, PacBio, Nanopore, NGS va boshqalar, referent genom bo'lmasa.Uchinchi avlod sekvensiyasi texnologiyalarining o'qish uzunligining sezilarli yaxshilanishi murakkab genomlarni yig'ishda yangi imkoniyatlarni olib keldi, masalan, yuqori heterozigotlik, takrorlanuvchi hududlarning yuqori nisbati, poliploidlar va boshqalar. O'qish uzunligi o'nlab kilobazalar darajasida, bu ketma-ketlik o'qishlari takrorlanuvchi elementlarni, g'ayritabiiy GC tarkibiga ega bo'lgan hududlarni va boshqa juda murakkab hududlarni hal qilish.
Platforma: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Illumina NovaSeq platformasi
-
Insonning butun ekzoma ketma-ketligi
Butun ekzoma sekvensiyasi (WES) kasallikni keltirib chiqaruvchi mutatsiyalarni aniqlash uchun tejamkor sekvensiya strategiyasi sifatida qaraladi.Garchi ekzonlar butun genomning atigi 1,7% ni egallasa ham, u to'g'ridan-to'g'ri umumiy protein funktsiyalarining profilini ifodalaydi.Inson genomida kasallik bilan bog'liq mutatsiyalarning 85% dan ortig'i protein kodlash mintaqasida sodir bo'lishi haqida xabar berilgan.
BMKGENE turli tadqiqot maqsadlariga erishish uchun mavjud bo'lgan turli xil eksonlarni ushlash strategiyalariga ega bo'lgan keng qamrovli va moslashuvchan insonning butun ekzoma ketma-ketligi xizmatlarini taklif qiladi.
Platforma: Illumina NovaSeq platformasi
-
Maxsus joylashuv kuchaytirilgan fragmentlar ketma-ketligi (SLAF-seq)
Yuqori o'tkazuvchanlik genotiplash, ayniqsa katta populyatsiyada, genetik assotsiatsiyani o'rganishda fundamental qadam bo'lib, u funktsional genlarni kashf qilish, evolyutsion tahlil va hokazolar uchun genetik asosni ta'minlaydi. Butun genomni chuqur qayta sekvensiyalash o'rniga, genomlar ketma-ketligini qisqartirish (RRGS) ) har bir namunadagi ketma-ketlik xarajatlarini minimallashtirish, shu bilan birga genetik markerni topishda oqilona samaradorlikni saqlash uchun joriy etilgan.Bunga odatda cheklangan vakillik kutubxonasi (RRL) deb ataladigan berilgan o'lcham oralig'ida cheklash fragmentini ajratib olish orqali erishiladi.Spesifik-lokusli kuchaytirilgan fragmentlar ketma-ketligi (SLAF-Seq) - mos yozuvlar genomi bo'lgan yoki bo'lmagan holda SNP genotiplash uchun o'z-o'zidan ishlab chiqilgan strategiya.
Platforma: Illumina NovaSeq platformasi -
Illumina va BGI
Sintez bo‘yicha ketma-ketlik (SBS) asosidagi Illumina sekvensiyasi texnologiyasi global miqyosda qo‘llanilgan NGS innovatsiyasi bo‘lib, dunyodagi ketma-ketlik ma’lumotlarining 90% dan ortig‘ini yaratish uchun javobgardir.SBS printsipi har bir dNTP qo'shilganda floresan yorliqli teskari terminatorlarni tasvirlashni o'z ichiga oladi va keyinchalik keyingi bazani birlashtirishga imkon berish uchun parchalanadi.Har bir ketma-ketlik siklida mavjud bo'lgan to'rtta qayta tiklanadigan terminator bilan bog'langan dNTPlar bilan, tabiiy raqobat inkorporatsiyaning noto'g'riligini kamaytiradi.Ushbu ko'p qirrali texnologiya bir qator genomik ilovalarga javob beradigan bitta o'qiladigan va juftlashtirilgan kutubxonalarni qo'llab-quvvatlaydi.Illumina sekvensiyasining yuqori o'tkazuvchanlik qobiliyati va aniqligi uni genomik tadqiqotlarda asos bo'lib qo'yadi va olimlarga genomlarning nozik tomonlarini tengsiz tafsilot va samaradorlik bilan ochish imkonini beradi.
BGI tomonidan ishlab chiqilgan DNBSEQ yana bir innovatsion NGS texnologiyasi bo'lib, u ketma-ketlik xarajatlarini yanada pasaytirishga va o'tkazish qobiliyatini oshirishga muvaffaq bo'ldi.DNBSEQ kutubxonalarini tayyorlash DNKning parchalanishini, ssDNKni tayyorlashni va DNK nanoballs (DNB) olish uchun aylanma doirani kuchaytirishni o'z ichiga oladi.Keyin ular qattiq sirtga yuklanadi va keyinchalik kombinatsion prob-anchor sintezi (cPAS) orqali ketma-ketlashtiriladi.
Bizning oldindan tayyorlangan kutubxona tartiblash xizmatimiz mijozlarga turli manbalardan (mRNK, butun genom, amplikon va boshqalar) sekvensiya kutubxonalarini tayyorlashda yordam beradi.Keyinchalik, ushbu kutubxonalar Illumina yoki BGI platformalarida sifat nazorati va ketma-ketlik uchun bizning ketma-ketlik markazlarimizga yuborilishi mumkin.
