Issiqlik xaritasi
Matritsa ma'lumotlar fayli issiqlik xaritasini chizish uchun ishlatiladi, u matritsa ma'lumotlarini filtrlash, normallashtirish va klasterlash imkonini beradi.U asosan turli xil namunalar orasidagi gen ekspresyon darajasini klaster tahlil qilish uchun ishlatiladi.
Gen izohi
Gen funktsiyasini izohlash FASTA faylidagi ketma-ketlikni turli ma'lumotlar bazasiga solishtirish orqali amalga oshiriladi.
Gen izohi
Mahalliy hizalanishni qidirishning asosiy vositasi
CDS_UTR_ bashorat
Ushbu vosita ma'lum protein ma'lumotlar bazasi va ORF prognoziga qarshi portlatish asosida berilgan transkript ketma-ketliklarida kodlash mintaqalarini (CDS) va kodlanmagan hududlarni (UTR) bashorat qilish uchun mo'ljallangan.
Manhetten syujeti
Manxetten syujeti ko'p sonli ma'lumotlar nuqtalari bilan ma'lumotlarni ko'rsatishga imkon beradi.U keng tarqalgan genom assotsiatsiyasi tadqiqotlarida (GWAS) qo'llaniladi.
Circos
CIRCOS diagrammasi genomda SNP, InDeL, SV, CNV taqsimotlarini to'g'ridan-to'g'ri taqdim etish imkonini beradi.
GO_Boyitish
TopGO - funktsional boyitish uchun mo'ljallangan vosita.TopGO-Bioconductor to'plami differensial ifoda tahlili, GO boyitish tahlili va natijalarni vizualizatsiya qilishdan iborat.U topGO_BP, topGO_CC va topGO_MF uchun natijalarni o'z ichiga olgan "Grafik" deb nomlangan papkani yaratadi.
WGCNA
WGCNA - bu genlarning birgalikda ifodalash modullarini kashf qilish uchun keng qo'llaniladigan ma'lumotlarni qidirish usuli.U turli xil ifoda ma'lumotlar to'plamiga, jumladan mikroarray ma'lumotlariga va keyingi avlod sekvensiyasidan kelib chiqqan gen ifodasi ma'lumotlariga nisbatan qo'llaniladi.
InterProScan
InterPro oqsil ketma-ketligini tahlil qilish va tasniflash
GO_KEGG_Boyitish
Ushbu vosita taqdim etilgan genlar to'plami va tegishli izohlar asosida GO boyitish gistogrammasi, KEGG boyitish gistogrammasi va KEGG boyitish yo'lini yaratish uchun mo'ljallangan.