Nanoporga asoslangan to'liq uzunlikdagi transkriptomlar ketma-ketligi
Nanopor sekvensiyasi o'zini boshqa ketma-ketlik platformalaridan ajratib turadi, chunki nukleotidlar to'g'ridan-to'g'ri DNK sintezisiz o'qiladi va o'nlab kilobazalarda uzoq o'qishlar hosil qiladi.Bu to'liq metrajli transkriptlarni to'g'ridan-to'g'ri o'qish va transkriptomik tadqiqotlardagi muammolarni hal qilish imkonini beradi.
√ Pastki ketma-ketlikka xos moyillik
√ Gen tuzilishini o'rganish uchun cDNKning to'liq uzunlikdagi o'qilishi
√ Bir xil miqdordagi transkriptlarni qoplash uchun kamroq ma'lumot talab qilinadi
√ Har bir gen uchun bir nechta izoformlarni aniqlash
√ Izoform darajasida ifoda miqdorini aniqlash
Oddiy bioinformatika quvur liniyasi
Biomarker texnologiyalari bilan eng so'nggi muvaffaqiyatli holatlar
1. To‘liq uzunlikdagi transkriptomlarning qiyosiy tahlillari Gnetum luofuense poyasining rivojlanish dinamikasini aniqlaydi.
Jurnal: Genetikadagi chegaralar
Nashr qilingan: 2021 yil mart
Kalit so'zlar: MinION |Muqobil birlashma |APA |lncRNA |Differensial ifodalangan transkriptlar
To'liq matnni o'qing
2. Turlararo geterotransplantlarda mayda RNKlarning kurtaklardan ildizlarga bir tomonlama harakatlanishi.
Jurnal: Tabiat o'simliklari
Nashr qilingan: 2021 yil yanvar
Kalit so'zlar: Nanopor |Illumina |to'liq uzunlikdagi mobil mRNKni aniqlash
3. Qushqo'nmas ildizlarining to'liq metrajli transkriptom tahlili arbuskulyar mikorizali zamburug'lar tomonidan qo'zg'atilgan tuzga chidamlilikning molekulyar mexanizmini ochib beradi.
Jurnal: Atrof-muhit va eksperimental botanika
Nashr qilingan: 2021 yil yanvar
Kalit so'zlar: MinION |Differensial ifodalangan transkriptlar |Transkripsiya omillari |Muqobil biriktirish
4. Qurg'oqchilik stressiga javoban atirgul (Rosa chinensis) ildizlari va barglarining fiziologik xarakteristik o'zgarishlari va to'liq uzunlikdagi transkriptomasi.
Jurnal: O'simlik va hujayra fiziologiyasi
Nashr qilingan: 2020 yil oktyabr
Kalit so'zlar: PromethION |Differensial ifodalangan transkriptlar |Funktsional bashorat |Birlashtirilgan izoformlar |TF va lncRNA
5. PacBio va Arabidopsis transkriptomining nanopora asosidagi RNK ketma-ketligini tahlil qilish va har tomonlama taqqoslash.
Jurnal: O'simlik usuli
Nashr qilingan: 2020 yil aprel
Kalit so'zlar: GridION |PromethION |PacBio davomi |Illumina NovaSeq |Genom moslashuvi |Transkriptni aniqlash |Muqobil birlashma |SSR |LncRNA |Izoformani aniqlash
Yangiliklar va muhim voqealar Biomarker Technologies bilan so'nggi muvaffaqiyatli ishlarni baham ko'rish, yangi ilmiy yutuqlar va tadqiqot davomida qo'llaniladigan mashhur texnikalarni qo'lga kiritishni maqsad qilgan.
Yuborilgan vaqt: 2022 yil 08-yanvar