GENOM
Xromosoma miqyosidagi yig'ish va biomassa hosilini tahlil qilish Miscanthus lutarioriparius genomi
Nanoporlarni tartiblash |Illumina |Hi-C |RNK ketma-ketligi |Filogeniya
Ushbu tadqiqotda Biomarker Technologies Nanopore sekvensiyasi, de novo genom yig'ilishi, Hi-C yordamida yig'ish va boshqalar bo'yicha texnik yordam ko'rsatdi.
Abstrakt
Miscanthus, ildizpoyali ko'p yillik o'simlik, yuqori biomassa va stressga chidamliligi uchun bioenergiya ishlab chiqarish uchun katta imkoniyatlarga ega.ning xromosoma miqyosidagi yig'ilishi haqida xabar beramizMiscanthus lutarioripariusOksford Nanopor sekvensiyasi va Hi-C texnologiyalarini birlashtirish orqali genom.2,07 Gb o'lchamli yig'ilish genomning 96,64 foizini qamrab oladi, N50 kontigi 1,71 Mb.Tsentromera va telomera ketma-ketligi mos ravishda barcha 19 xromosoma va 10-xromosoma uchun yig'iladi.M. lutarioripariusning allotetraploid kelib chiqishi sentromerik sun'iy yo'ldosh takrorlari yordamida tasdiqlangan.Tetraploid genom tuzilishi va jo'xori bilan bog'liq bir nechta xromosomalarning qayta tuzilishi aniq ko'rsatilgan.Tandem ikki nusxadagi genlarM. lutarioripariusUlar nafaqat stressga javob berish, balki hujayra devori biosintezi bilan bog'liq bo'lgan funktsional jihatdan boyitilgan.Kasallikka chidamlilik, hujayra devori biosintezi va metall ionlarini tashish bilan bog'liq genlar oilalari juda kengayib, rivojlangan.Ushbu oilalarning kengayishi ajoyib xususiyatlarni yaxshilash uchun muhim genomik asos bo'lishi mumkinM. lutarioriparius.
Genom yig'ilishining asosiy statistikasi
Rasm.M. lutarioriparius genom yig'ilishining umumiy ko'rinishi
Yangiliklar va muhim voqealar Biomarker Technologies bilan so'nggi muvaffaqiyatli ishlarni baham ko'rish, yangi ilmiy yutuqlar va tadqiqot davomida qo'llaniladigan mashhur texnikalarni qo'lga kiritishni maqsad qilgan.
Yuborilgan vaqt: 2022 yil 05-yanvar