● Maqsadli protein kodlash hududi: protein kodlash hududini qo'lga kiritish va tartiblash orqali hWES oqsil tuzilishi bilan bog'liq variantlarni aniqlash uchun ishlatiladi;
● Yuqori aniqlik: yuqori ketma-ketlik chuqurligi bilan hWES keng tarqalgan variantlarni va 1% dan past chastotali noyob variantlarni aniqlashni osonlashtiradi;
● Tejamkor iqtisodiy: hWES inson genomining 1% dan inson kasalliklari mutatsiyalarining taxminan 85% ni beradi;
● Q30>85% kafolatlangan butun jarayonni qamrab oluvchi beshta qattiq QC protsedurasi.
Platforma
| Kutubxona
| Exon Capture strategiyasi
| Ketma-ketlik strategiyasini tavsiya eting
|
Illumina NovaSeq platformasi
| PE150 | Agilent SureSelect Human All Exon V6 IDT xGen Exome Hyb Panel V2 | 5 Gb 10 Gb |
Namuna turi
| Miqdori(Qubit®)
| Ovoz balandligi
| Diqqat
| Soflik (NanoDrop™) |
Genomik DNK
| ≥ 300 ng | ≥ 15 mkl | ≥ 20 ng/mkl | OD260/280=1,8-2,0 buzilish, ifloslanish yo'q
|
Mendeliya kasalliklari / kam uchraydigan kasalliklar uchun: 50 × dan yuqori samarali ketma-ketlik chuqurligi
O'simta namunalari uchun: 100 × dan yuqori samarali ketma-ketlik chuqurligi
1. Hizalanish statistikasi
1-jadval Xarita natijalari statistikasi
2-jadval Ekzomni ushlash statistikasi
2.Variatsiyani aniqlash
1-rasm SNV va InDel statistikasi
3.Kengaytirilgan tahlil
Shakl 2 Genom bo'yicha zararli SNV va InDelning Circos syujeti
3-jadval Kasallikni keltirib chiqaruvchi genlarning skriningi