● Mo'l-ko'l loyiha holatlari: 2009 yilda tashkil etilganidan beri BMKGENE GWAS populyatsiyasini o'rganish bo'yicha yuzlab turdagi loyihalarni yakunladi, tadqiqotchilarga 100 dan ortiq maqolalarni nashr etishga yordam berdi va jami ta'sir koeffitsienti 500 ga etdi.
● Professional tahlilchilar.
● Qisqa tahlil davri.
● Aniq ma'lumotlarni yig'ish.
Turi | Aholi miqyosi | Ketma-ketlik strategiyasi va chuqurligi |
SLAF-GWAS | Namuna raqami ≥200 | Genom hajmi < 400M, ref-genom bilan WGS tavsiya etiladi |
Genom hajmi ≤ 1G, 100K teglar va 10X | ||
1G ≤ Genom hajmi ≤ 2G, 200K teg va 10X | ||
Genom hajmi > 2G, 300K teglar va 10X | ||
WGS-GWAS | Namuna raqami ≥200 | Har bir namuna uchun 10X |
Turli xil navlar, kichik turlar, erlar / genbanklar / aralash oilalar / yovvoyi resurslar
Turli xil navlar, kichik turlar, erlar
Half-sib oila/to'liq-sib oila/yovvoyi resurslar
● Genom bo'yicha assotsiatsiya tahlili
● Muhim SNP tahlili va skriningi
● Nomzod genining funktsional annotatsiyasi
a.QC fenotipi
Chastotani taqsimlash gistogrammasi
Fenotip statistikasi
b.Assotsiatsiya tahlili (Model: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)
QQ uchastkasi
Manhetten syujeti
Yil | Jurnal | IF | Sarlavha |
2022 | NC | 17.69 | Paeonia ostii daraxtining giga-xromosomalari va giga-genomlarining genomik asoslari. |
2015 yil | NP | 7.43 | Uy izlari soya fasulyasida agrotexnik ahamiyatga ega bo'lgan genomik hududlarni bog'laydi |
2018 | MP | 9.32 | Butun dunyo bo'ylab kolza qo'shilishlari to'plamining butun genomini qayta sekvensiyasi ularning ekotiplari farqlanishining genetik asoslarini ochib beradi. |
2022 | HR | 7.29 | Genom bo'yicha assotsiatsiyalar tahlili tarvuz urug'i hajmining tabiiy o'zgarishi haqida molekulyar tushunchalarni beradi. |