BMKGENE mijozlaridan olingan muhim misol misolida keltirilgan yovvoyi xilma-xil tadqiqot turlarini o'rganish imkoniyatlarini o'rganing.Yaqinda O'simlik biotexnologiyasi jurnalining bu yilgi sonida chop etilgan "Xromosoma darajasidagi yovvoyi Hevea brasiliensis genomi: genomik yordamli naslchilikni kuchaytirish va yuqori kauchuk hosildorligi uchun muhim joylarni ochish" sarlavhali maqola qimmatli ma'lumotnoma bo'lib xizmat qiladi.
Braziliya kauchuk daraxti (Hevea brasiliensis) asosiy tabiiy kauchuk manbai sifatida baland.O'tgan asr davomida an'anaviy naslchilik metodologiyalari kauchuk ishlab chiqarishning olti baravar o'sishiga olib keldi.Shunga qaramay, kauchukning potentsial hosildorligini oshirish uchun mas'ul bo'lgan asosiy genetik asos sirli bo'lib qolmoqda.
Ushbu tadqiqot Nanopore uzoq o'qiladigan sekvensiya, Illumina NGS sekvensiyasi va Hi-C texnologiyasining sinergiyasidan foydalangan holda yovvoyi kauchuk daraxti uchun xromosoma darajasidagi genomni yaratishga kirishdi.
Bunga parallel ravishda, Illumina platformasidan foydalangan holda genomlarni to'liq qayta sekvensiyalash (WGS) uchun yuqori mahsuldor o'zgarishlar, yovvoyi shtammlar va tegishli turlarni o'z ichiga olgan 147 ta germplazma resurslari yig'ildi.Keyingi ketma-ketlik ma'lumotlari populyatsiyalar genetikasining qat'iy tahlilidan o'tkazildi, bu populyatsiya tuzilishini, xilma-xilligini va bog'lanish muvozanatini ajratish imkonini berdi.Ushbu tahlil populyatsiyalar bo'yicha xonakilashtirish o'zgarishlarini yoritib beradi.
Keyingi tadqiqotlar Fst, p, Tajima's D va LD ni o'z ichiga olgan tahlillarni o'z ichiga olgan bo'lib, yaxshilangan lateks rentabelligidan kelib chiqadigan tanlov signallarini ochishga qaratilgan, xususan, Wickham klonlariga e'tibor qaratgan.
Genom bo'yicha assotsiatsiya tahlilida (GWAS) yakuniga ko'ra, hosil belgilari va keyinchalik hosil bilan bog'liq genlar bilan bog'liq markerlar aniqlandi.Dastlabki tekshirish ikkita ERF genlari uchun turli xil mutantlar bo'ylab o'ziga xos transkripsiya faolligini ochib berdi, bu ularning funktsional ahamiyatiga dastlabki ko'rinish beradi.Kelgusi tadqiqotlar doirasida keyingi tasdiqlash rejalashtirilgan.
BMKGENE bioinformatika tahlilida muhim rol o'ynash bilan birga ushbu katta populyatsiyaning genomlarini keng qamrovli qayta sekvensiyasiga hissa qo'shganidan faxrlanadi.Bizning katta tajribamiz NGS/TGS sekvensiyasi va multiomik bioinformatika tahlilini 1000 dan ortiq turlar qatorida o'z ichiga oladi.Kelgusi loyihalaringizda siz bilan hamkorlik qilish istiqbolini intiqlik bilan kutamiz.
Bu yerga bosingushbu tadqiqot haqida ko'proq bilib oling
Yuborilgan vaqt: 29-avgust 2023-yil