●Platformalar:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten va BGI-DNB-T7
●Tartiblash rejimlari:PE50, PE100, PE150, PE250
●Ketma-ketlashdan oldin kutubxonalar sifatini nazorat qilish
●Ma'lumotlarni yetkazib berish va QC ketma-ketligi:Q30 o'qishlarini demultiplekslash va filtrlashdan so'ng QC hisoboti va xom ma'lumotlarni fastq formatida yetkazib berish.
●Sequencing xizmatlarining ko'p qirraliligi:mijoz qator, oqim xujayrasi yoki ma'lumotlar miqdori bo'yicha ketma-ketlikni tanlashi mumkin.
●Platformalarning ko'p qirraliligi:DNB kutubxonalari Illumina platformalariga o'tkazilishi mumkin
●Illumina sequencing platformasida katta tajriba:turli xil turlari bilan minglab yopiq loyihalar bilan.
●QC hisobotini ketma-ket etkazib berish:sifat ko'rsatkichlari, ma'lumotlarning aniqligi va ketma-ketlik loyihasining umumiy ishlashi bilan.
●Yetuk ketma-ketlik jarayoni:qisqa aylanish vaqti bilan.
●Qattiq sifat nazorati: Biz doimiy ravishda yuqori sifatli natijalarni yetkazib berishni kafolatlash uchun qat'iy QC talablarini qo'llaymiz.
Maʼlumot miqdori (X) | Konsentratsiya (qPCR/nM) | Ovoz balandligi |
X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 20 mkl |
50 Gb ≤ X < 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 20 mkl |
X ≥ 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 20 mkl |
Platforma | Konsentratsiya (qPCR/nM) | Ovoz balandligi |
HiSeq X Ten | ≥ 2 nM | ≥ 20 mkl |
NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 nM | ≥ 25 mkl |
NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 mkl |
NovaSeq X | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 mkl |
BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 mkl |
Konsentratsiya va umumiy miqdorga qo'shimcha ravishda, tegishli tepalik namunasi ham talab qilinadi.
Kutubxonaning sifati to'g'risida hisobot ketma-ketlikdan, kutubxona miqdorini baholashdan va parchalanishdan oldin taqdim etiladi.
Jadval 1. Ma'lumotlarni ketma-ketlashtirish bo'yicha statistik ma'lumotlar.
Namuna ID | BMKID | Raw o'qiydi | Xom maʼlumotlar (bp) | Toza o'qishlar (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
C_01 | BMK_01 | 22 870 120 | 6 861 036 000 | 96.48 | 99.14 | 94,85 | 36.67 |
C_02 | BMK_02 | 14 717 867 | 4 415 360 100 | 96.00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Shakl 1. Har bir namunadagi o'qishlar bo'yicha sifat taqsimoti
Shakl 2. Asosiy tarkibni taqsimlash
Shakl 3. Ma'lumotlarni ketma-ketlikda o'qish mazmunini taqsimlash