● rRNKning kamayishi, so'ngra yo'nalishli kutubxonani tayyorlash, bu tarmoqqa xos bo'lgan ma'lumotlarni ketma-ketlashtirish imkonini beradi.
● Bioinformatik ish oqimi circRNKni bashorat qilish va ifoda miqdorini aniqlash imkonini beradi
●Kengroq RNK kutubxonalari:Biz kutubxonadan oldingi tayyorgarlikda chiziqli RNK yo'qolishi o'rniga rRNKning kamayishidan foydalanamiz, bu ketma-ketlik ma'lumotlari nafaqat circRNA, balki mRNK va lncRNKni ham o'z ichiga olishini ta'minlab, ushbu ma'lumotlar to'plamlarida birgalikda tahlil qilish imkonini beradi.
●Raqobatbardosh endogen RNK (ceRNA) tarmoqlarini ixtiyoriy tahlil qilish: uyali tartibga solish mexanizmlari haqida chuqurroq tushuncha berish
●Keng ekspertiza: BMKda 20 000 dan ortiq namunalarni qayta ishlash bo'yicha tajribaga ega bo'lib, turli xil namunalar va lncRNA loyihalarini qamrab olgan holda, bizning jamoamiz har bir loyihaga boy tajriba olib keladi.
●Qattiq sifat nazorati: biz namuna va kutubxonani tayyorlashdan tortib, ketma-ketlik va bioinformatikagacha bo'lgan barcha bosqichlarda asosiy nazorat nuqtalarini amalga oshiramiz.Ushbu sinchkovlik bilan monitoring doimiy ravishda yuqori sifatli natijalarni taqdim etishni ta'minlaydi.
● Sotishdan keyingi yordam: Bizning majburiyatimiz sotuvdan keyingi 3 oylik xizmat muddati bilan loyihani yakunlashdan tashqariga chiqadi.Shu vaqt ichida biz natijalar bilan bog'liq har qanday so'rovlarni hal qilish uchun loyihani kuzatish, muammolarni bartaraf etish bo'yicha yordam va savol-javob seanslarini taklif qilamiz.
Kutubxona | Platforma | Tavsiya etilgan maʼlumotlar | Ma'lumotlar QC |
Poli A boyitilgan | Illumina PE150 | 16-20 Gb | Q30≥85% |
Kons.(ng/ml) | Miqdori (mkg) | Tozalik | Butunlik |
≥ 100 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Jelda ko'rsatilgan protein yoki DNK ifloslanishi cheklangan yoki yo'q. | O'simliklar uchun: RIN≥6,5; Hayvonlar uchun: RIN≥7,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; cheklangan yoki asosiy balandlikning yo'qligi |
● O‘simliklar:
Ildiz, poya yoki gulbarg: 450 mg
Barg yoki urug': 300 mg
Meva: 1,2 g
● Hayvon:
Yurak yoki ichak: 450 mg
Ichki organlar yoki miya: 240 mg
Mushaklar: 600 mg
Suyaklar, soch yoki teri: 1,5 g
● Artropodlar:
Hasharotlar: 9 g
Qisqichbaqasimonlar: 450 mg
● To'liq qon:2 naycha
● Hujayralar: 106 hujayralar
● Sarum va plazma: 6 ml
Idish: 2 ml santrifüj naychasi (qalay folga tavsiya etilmaydi)
Namuna belgilari: Guruh+takrorlash, masalan, A1, A2, A3;B1, B2, B3 ......
Yuk tashish:
1. Quruq muz: namunalar qoplarga solib, quruq muzga ko'milishi kerak.
2. RNK barqaror naychalar: RNK namunalari RNK stabilizatsiya trubkasida (masalan, RNAstable®) quritilishi va xona haroratida yuborilishi mumkin.
Bioinformatika
circRNK prognozi: xromosoma taqsimoti
Differentsial ifodalangan circRNKlar - Vulkan syujeti
Differentsial ifodalangan circRNKlar - ierarxik klasterlash
circRNA xost genlarini funksional boyitish
BMKGene circRNA sekvensiyasi xizmatlari tomonidan yaratilgan tadqiqot yutuqlarini saralangan nashrlar to'plami orqali o'rganing.
Vang, X. va boshqalar.(2021) 'CPSF4 gepatotsellyulyar karsinomada circRNK hosil bo'lishini va mikroRNK vositachiligida genlarning o'chirilishini tartibga soladi', Onkogen 2021 40:25, 40(25), 4338–4351-betlar.doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.
Xia, K. va boshqalar.(2023) "X oo-javob beruvchi transkriptom guruchda OsARAB ifodasini tartibga solish orqali kasalliklarga chidamlilikdagi dumaloq RNA133 rolini ochib beradi", Fitopatologiya tadqiqoti, 5(1), 1-14-betlar.doi: 10.1186/S42483-023-00188-8/FIGURES/6.
Y, H. va boshqalar.(2023) "CPSF3 gepatotsellyulyar karsinomada dumaloq va chiziqli transkriptlar muvozanatini modulyatsiya qiladi".doi: 10.21203/RS.3.RS-2418311/V1.
Zhang, Y. va boshqalar.(2023) "Jigar transplantatsiyasidan oldin va keyin sirrozli kardiyomiyopatiyada circRNAlarni har tomonlama baholash", Xalqaro Immunofarmakologiya, 114, p.109495. doi: 10.1016/J.INTIMP.2022.109495.