BMKCloud Log in
条形بینر-03

مصنوعات

Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF-Seq)

ہائی تھرو پٹ جین ٹائپنگ، خاص طور پر بڑے پیمانے پر آبادی پر، جینیاتی ایسوسی ایشن اسٹڈیز میں ایک بنیادی قدم ہے، جو فعال جین کی دریافت، ارتقائی تجزیہ وغیرہ کے لیے جینیاتی بنیاد فراہم کرتا ہے۔ ) کو فی نمونہ ترتیب دینے کی لاگت کو کم کرنے کے لیے متعارف کرایا گیا ہے، جبکہ جینیاتی مارکر کی دریافت پر معقول کارکردگی کو برقرار رکھا گیا ہے۔یہ عام طور پر دی گئی سائز کی حد کے اندر پابندی کے ٹکڑے کو نکال کر حاصل کیا جاتا ہے، جسے کم نمائیندگی لائبریری (RRL) کا نام دیا گیا ہے۔مخصوص-لوکس ایمپلیفائیڈ فریگمنٹ سیکوینسنگ (SLAF-Seq) حوالہ جینوم کے ساتھ یا اس کے بغیر SNP جین ٹائپنگ کے لیے خود تیار کردہ حکمت عملی ہے۔
پلیٹ فارم: Illumina NovaSeq پلیٹ فارم


سروس کی تفصیلات

ڈیمو کے نتائج

نمایاں پبلیکیشنز

سروس کی تفصیلات

تکنیکی اسکیم

111

کام کا بہاؤ

流程图

سروس کے فوائد

اعلی مارکر دریافت کی کارکردگی- ہائی تھرو پٹ سیکوینسنگ ٹیکنالوجی SLAF-Seq کو پورے جینوم کے اندر سیکڑوں ہزاروں ٹیگز دریافت کرنے میں مدد کرتی ہے۔

جینوم پر کم انحصار- یہ حوالہ جینوم کے ساتھ یا اس کے بغیر پرجاتیوں پر لاگو کیا جاسکتا ہے۔

لچکدار اسکیم ڈیزائن- سنگل انزائم، ڈوئل انزائم، ملٹی انزائم ہاضمہ اور مختلف قسم کے انزائمز، سبھی کو مختلف تحقیقی مقصد یا پرجاتیوں کو پورا کرنے کے لیے منتخب کیا جا سکتا ہے۔سلیکو میں پہلے سے تشخیص کا استعمال ایک بہترین انزائم ڈیزائن کو یقینی بنانے کے لیے کیا جاتا ہے۔

موثر انزیمیٹک عمل انہضام- پہلے سے تجربہ حالات کو بہتر بنانے کے لیے کیا گیا تھا، جو رسمی تجربہ کو مستحکم اور قابل اعتماد بناتا ہے۔ٹکڑے جمع کرنے کی کارکردگی 95 فیصد سے زیادہ حاصل کر سکتی ہے۔

یکساں طور پر تقسیم شدہ SLAF ٹیگز- SLAF ٹیگز سب سے زیادہ حد تک تمام کروموسوم میں یکساں طور پر تقسیم کیے جاتے ہیں، اوسطاً 1 SLAF فی 4 kb حاصل کرتے ہیں۔

تکرار سے مؤثر اجتناب- SLAF-Seq ڈیٹا میں دہرائی جانے والی ترتیب کو 5% سے کم کر دیا گیا ہے، خاص طور پر ان پرجاتیوں میں جن میں اعلیٰ سطح پر تکرار ہوتی ہے، جیسے کہ گندم، مکئی وغیرہ۔

وسیع تجربہ- پودوں، ستنداریوں، پرندوں، کیڑے مکوڑوں، آبی حیاتیات وغیرہ پر مشتمل سینکڑوں انواع پر 2000 سے زائد بند SLAF-Seq پروجیکٹس۔

خود تیار شدہ بایو انفارمیٹک ورک فلو- SLAF-Seq کے لیے ایک مربوط بایو انفارمیٹک ورک فلو BMKGENE نے تیار کیا تھا تاکہ حتمی آؤٹ پٹ کی وشوسنییتا اور درستگی کو یقینی بنایا جا سکے۔

 

سروس کی تفصیلات

 

پلیٹ فارم

Conc.(ng/gl)

کل (ug)

OD260/280

Illumina NovaSeq

>35

>1.6(جلد>15μl)

1.6-2.5

نوٹ: تین نمونے، جن میں سے ہر ایک تین انزائم سکیموں کے ساتھ، پہلے سے تجربہ کے لیے کیے جائیں گے۔

تجویز کردہ ترتیب کی حکمت عملی

ترتیب کی گہرائی: 10X/ٹیگ

جینوم سائز

تجویز کردہ SLAF ٹیگز

<500 Mb

100K یا WGS

500 Mb- 1 Gb

100 K

1 جی بی -2 جی بی

200 K

وشال یا پیچیدہ جینوم

300 - 400K

 

ایپلی کیشنز

 

تجویز کردہ

آبادی کا پیمانہ

 

ترتیب کی حکمت عملی اور گہرائی

 

گہرائی

 

ٹیگ نمبر

 

جی ڈبلیو اے ایس

 

نمونہ نمبر ≥ 200

 

10 ایکس

 

 

 

 

 

کے مطابق

جینوم کا سائز

 

جینیاتی ارتقاء

 

ہر ایک کے افراد

ذیلی گروپ ≥ 10؛

کل نمونے ≥ 30

 

10 ایکس

 

تجویز کردہ نمونے کی ترسیل

کنٹینر: 2 ملی لیٹر سینٹرفیوج ٹیوب

زیادہ تر نمونوں کے لیے، ہم تجویز کرتے ہیں کہ ایتھنول میں محفوظ نہ کریں۔

نمونہ لیبلنگ: نمونے کو واضح طور پر لیبل لگا ہوا ہونا ضروری ہے اور جمع کرائے گئے نمونے کی معلومات کے فارم سے یکساں ہونا ضروری ہے۔

کھیپ: خشک برف: نمونوں کو پہلے تھیلے میں پیک کرنے اور خشک برف میں دفن کرنے کی ضرورت ہے۔

سروس ورک فلو

نمونہ QC
پائلٹ تجربہ
SLAF تجربہ
لائبریری کی تیاری
ترتیب دینا
ڈیٹا کا تجزیہ
فروخت کے بعد خدمات

نمونہ QC

پائلٹ تجربہ

SLAF - تجربہ

لائبریری کی تیاری

ترتیب دینا

ڈیٹا تجزیہ

فروخت کے بعد کی خدمات


  • پچھلا:
  • اگلے:

  • 1. نقشہ کے نتائج کے اعدادوشمار

    image1

    A1

    2. SLAF مارکر کی ترقی

    A2

    3. تغیر تشریح

    A3

    سال

    جرنل

    IF

    عنوان

    ایپلی کیشنز

    2022

    فطرت مواصلات

    17.694

    ٹری پیونی کے گیگا کروموسوم اور گیگا جینوم کی جینومک بنیاد

    پیونیا اوسٹی

    SLAF-GWAS

    2015

    نیا Phytologist

    7.433

    میں زرعی اہمیت کے حامل جینومک علاقوں میں گھریلو قدموں کے نشانات

    سویابین

    SLAF-GWAS

    2022

    جرنل آف ایڈوانسڈ ریسرچ

    12.822

    G. hirsutum میں Gossypium barbadense کی جینوم وسیع مصنوعی مداخلت

    کپاس کے ریشے کے معیار اور پیداوار میں بیک وقت بہتری کے لیے اعلیٰ مقام ظاہر کریں۔

    خصلتیں

    SLAF- ارتقائی جینیات

    2019

    مالیکیولر پلانٹ

    10.81

    آبادی کا جینومک تجزیہ اور ڈی نوو اسمبلی ویڈی کی اصلیت کو ظاہر کرتی ہے۔

    ایک ارتقائی کھیل کے طور پر چاول

    SLAF- ارتقائی جینیات

    2019

    نیچر جینیٹکس

    31.616

    عام کارپ، سائپرنس کارپیو کی جینوم کی ترتیب اور جینیاتی تنوع

    SLAF-لنکیج کا نقشہ

    2014

    نیچر جینیٹکس

    25.455

    کاشت شدہ مونگ پھلی کا جینوم پھلی کیریوٹائپس، پولی پلائیڈ کے بارے میں بصیرت فراہم کرتا ہے

    ارتقاء اور فصل پالنے.

    SLAF-لنکیج کا نقشہ

    2022

    پلانٹ بائیو ٹیکنالوجی جرنل

    9.803

    ST1 کی شناخت سے ایک انتخاب کا پتہ چلتا ہے جس میں بیجوں کی شکل میں تبدیلی شامل ہے۔

    اور سویا بین پالنے کے دوران تیل کا مواد

    SLAF-مارکر کی ترقی

    2022

    بین الاقوامی جرنل آف مالیکیولر سائنسز

    6.208

    گندم-Leymus mollis 2Ns (2D) کے لیے شناخت اور ڈی این اے مارکر کی ترقی

    ڈسوومک کروموسوم متبادل

    SLAF-مارکر کی ترقی

    ایک اقتباس حاصل

    اپنا پیغام یہاں لکھیں اور ہمیں بھیجیں۔

    اپنا پیغام ہمیں بھیجیں: