اعلی مارکر دریافت کی کارکردگی- ہائی تھرو پٹ سیکوینسنگ ٹیکنالوجی SLAF-Seq کو پورے جینوم کے اندر سیکڑوں ہزاروں ٹیگز دریافت کرنے میں مدد کرتی ہے۔
جینوم پر کم انحصار- یہ حوالہ جینوم کے ساتھ یا اس کے بغیر پرجاتیوں پر لاگو کیا جاسکتا ہے۔
لچکدار اسکیم ڈیزائن- سنگل انزائم، ڈوئل انزائم، ملٹی انزائم ہاضمہ اور مختلف قسم کے انزائمز، سبھی کو مختلف تحقیقی مقصد یا پرجاتیوں کو پورا کرنے کے لیے منتخب کیا جا سکتا ہے۔سلیکو میں پہلے سے تشخیص کا استعمال ایک بہترین انزائم ڈیزائن کو یقینی بنانے کے لیے کیا جاتا ہے۔
موثر انزیمیٹک عمل انہضام- پہلے سے تجربہ حالات کو بہتر بنانے کے لیے کیا گیا تھا، جو رسمی تجربہ کو مستحکم اور قابل اعتماد بناتا ہے۔ٹکڑے جمع کرنے کی کارکردگی 95 فیصد سے زیادہ حاصل کر سکتی ہے۔
یکساں طور پر تقسیم شدہ SLAF ٹیگز- SLAF ٹیگز سب سے زیادہ حد تک تمام کروموسوم میں یکساں طور پر تقسیم کیے جاتے ہیں، اوسطاً 1 SLAF فی 4 kb حاصل کرتے ہیں۔
تکرار سے مؤثر اجتناب- SLAF-Seq ڈیٹا میں دہرائی جانے والی ترتیب کو 5% سے کم کر دیا گیا ہے، خاص طور پر ان پرجاتیوں میں جن میں اعلیٰ سطح پر تکرار ہوتی ہے، جیسے کہ گندم، مکئی وغیرہ۔
وسیع تجربہ- پودوں، ستنداریوں، پرندوں، کیڑے مکوڑوں، آبی حیاتیات وغیرہ پر مشتمل سینکڑوں انواع پر 2000 سے زائد بند SLAF-Seq پروجیکٹس۔
خود تیار شدہ بایو انفارمیٹک ورک فلو- SLAF-Seq کے لیے ایک مربوط بایو انفارمیٹک ورک فلو BMKGENE نے تیار کیا تھا تاکہ حتمی آؤٹ پٹ کی وشوسنییتا اور درستگی کو یقینی بنایا جا سکے۔
پلیٹ فارم | Conc.(ng/gl) | کل (ug) | OD260/280 |
Illumina NovaSeq | >35 | >1.6(جلد>15μl) | 1.6-2.5 |
ترتیب کی گہرائی: 10X/ٹیگ
جینوم سائز | تجویز کردہ SLAF ٹیگز |
<500 Mb | 100K یا WGS |
500 Mb- 1 Gb | 100 K |
1 جی بی -2 جی بی | 200 K |
وشال یا پیچیدہ جینوم | 300 - 400K |
ایپلی کیشنز
| تجویز کردہ آبادی کا پیمانہ
| ترتیب کی حکمت عملی اور گہرائی
| |
گہرائی
| ٹیگ نمبر
| ||
جی ڈبلیو اے ایس
| نمونہ نمبر ≥ 200
| 10 ایکس
|
کے مطابق جینوم کا سائز
|
جینیاتی ارتقاء
| ہر ایک کے افراد ذیلی گروپ ≥ 10؛ کل نمونے ≥ 30
| 10 ایکس
|
کنٹینر: 2 ملی لیٹر سینٹرفیوج ٹیوب
زیادہ تر نمونوں کے لیے، ہم تجویز کرتے ہیں کہ ایتھنول میں محفوظ نہ کریں۔
نمونہ لیبلنگ: نمونے کو واضح طور پر لیبل لگا ہوا ہونا ضروری ہے اور جمع کرائے گئے نمونے کی معلومات کے فارم سے یکساں ہونا ضروری ہے۔
کھیپ: خشک برف: نمونوں کو پہلے تھیلے میں پیک کرنے اور خشک برف میں دفن کرنے کی ضرورت ہے۔
1. نقشہ کے نتائج کے اعدادوشمار
2. SLAF مارکر کی ترقی
3. تغیر تشریح
سال | جرنل | IF | عنوان | ایپلی کیشنز |
2022 | فطرت مواصلات | 17.694 | ٹری پیونی کے گیگا کروموسوم اور گیگا جینوم کی جینومک بنیاد پیونیا اوسٹی | SLAF-GWAS |
2015 | نیا Phytologist | 7.433 | میں زرعی اہمیت کے حامل جینومک علاقوں میں گھریلو قدموں کے نشانات سویابین | SLAF-GWAS |
2022 | جرنل آف ایڈوانسڈ ریسرچ | 12.822 | G. hirsutum میں Gossypium barbadense کی جینوم وسیع مصنوعی مداخلت کپاس کے ریشے کے معیار اور پیداوار میں بیک وقت بہتری کے لیے اعلیٰ مقام ظاہر کریں۔ خصلتیں | SLAF- ارتقائی جینیات |
2019 | مالیکیولر پلانٹ | 10.81 | آبادی کا جینومک تجزیہ اور ڈی نوو اسمبلی ویڈی کی اصلیت کو ظاہر کرتی ہے۔ ایک ارتقائی کھیل کے طور پر چاول | SLAF- ارتقائی جینیات |
2019 | نیچر جینیٹکس | 31.616 | عام کارپ، سائپرنس کارپیو کی جینوم کی ترتیب اور جینیاتی تنوع | SLAF-لنکیج کا نقشہ |
2014 | نیچر جینیٹکس | 25.455 | کاشت شدہ مونگ پھلی کا جینوم پھلی کیریوٹائپس، پولی پلائیڈ کے بارے میں بصیرت فراہم کرتا ہے ارتقاء اور فصل پالنے. | SLAF-لنکیج کا نقشہ |
2022 | پلانٹ بائیو ٹیکنالوجی جرنل | 9.803 | ST1 کی شناخت سے ایک انتخاب کا پتہ چلتا ہے جس میں بیجوں کی شکل میں تبدیلی شامل ہے۔ اور سویا بین پالنے کے دوران تیل کا مواد | SLAF-مارکر کی ترقی |
2022 | بین الاقوامی جرنل آف مالیکیولر سائنسز | 6.208 | گندم-Leymus mollis 2Ns (2D) کے لیے شناخت اور ڈی این اے مارکر کی ترقی ڈسوومک کروموسوم متبادل | SLAF-مارکر کی ترقی |