چھوٹے RNAs مختصر نان کوڈنگ RNA کی قسم ہیں جن کی اوسط لمبائی 18-30 nt ہے، بشمول miRNA، siRNA اور piRNA۔یہ چھوٹے RNAs کے بڑے پیمانے پر مختلف حیاتیاتی عمل میں ملوث ہونے کی اطلاع ملی ہے جیسے mRNA انحطاط، ترجمہ کی روک تھام، heterochromatin کی تشکیل وغیرہ۔ SmallRNA کی ترتیب کا تجزیہ جانوروں/پودے کی نشوونما، بیماری، وائرس وغیرہ کے مطالعے میں بڑے پیمانے پر لاگو کیا گیا ہے۔ ترتیب تجزیہ پلیٹ فارم معیاری تجزیہ اور جدید ڈیٹا مائننگ پر مشتمل ہے۔RNA-seq ڈیٹا کی بنیاد پر، معیاری تجزیہ miRNA کی شناخت اور پیشین گوئی، miRNA ہدف جین کی پیشن گوئی، تشریح اور اظہار تجزیہ حاصل کر سکتا ہے۔جدید تجزیہ اپنی مرضی کے مطابق miRNA تلاش اور نکالنے، وین ڈایاگرام جنریشن، miRNA اور ٹارگٹ جین نیٹ ورک کی تعمیر کو قابل بناتا ہے۔