پلیٹ فارم: NovaSeq پلیٹ فارم، PE150
لائبریری کی قسم: 200-400bp بیسلفائٹ سے علاج شدہ ڈی این اے لائبریری داخل کریں
ترتیب سازی کی حکمت عملی: پیئرڈ اینڈ 150 bp
ڈیٹا آؤٹ پٹ کی تجویز کریں: 10 جی بی خام ڈیٹا/نمونہ
DNA کی مقدار: ≥ 2ug
DNA ارتکاز: ≥ 20ng/μl۔
طہارت: OD260/280 = 1.8 سے 2.0 انحطاط یا RNA آلودگی کے بغیر
a.حوالہ جینوم سیدھ کے اعدادوشمار
میپنگ کے اعدادوشمار پڑھتے ہیں۔
Sسی سائٹ کی ترتیب کی گہرائی اور کوریج کے اعدادوشمار
Aجمع شدہ کوریج
Dہر نمونے کی انہضام کی کارکردگی
b.میتھیلیشن سائٹ کا پتہ لگانا
سی سائٹ پر میتھیلیشن لیولز کی فہرست
Bایس کی تبدیلی
c.میتھیلیشن کا نقشہ
Genome عنصر
d.نمونوں کے درمیان میتھیلیشن کی سطح کا موازنہ
Pسی جی میتھیلیشن کا ہوا سے متعلق ارتباط
d.متفرق میتھیلیشن تجزیہ
SDMR کے اعدادوشمار