-
بی ایس اے
بلکڈ سیگریگینٹ تجزیہ پلیٹ فارم ایک قدمی معیاری تجزیہ اور حسب ضرورت پیرامیٹر ترتیب کے ساتھ جدید تجزیہ پر مشتمل ہے۔BSA ایک تکنیک ہے جو فینو ٹائپ سے وابستہ جینیاتی مارکروں کی فوری شناخت کے لیے استعمال کی جاتی ہے۔BSA کے مرکزی ورک فلو پر مشتمل ہے: 1. انتہائی مخالف فینوٹائپس والے افراد کے دو گروہوں کا انتخاب؛2. تمام افراد کے DNA، RNA یا SLAF-seq (بائیو مارکر کے ذریعے تیار کردہ) کو جمع کرنا تاکہ DNA کا دو بڑا حصہ بن سکے۔3. حوالہ جینوم کے خلاف یا اس کے درمیان فرق کی ترتیب کی نشاندہی کرنا، 4. ED اور SNP-index الگورتھم کے ذریعے امیدواروں سے منسلک علاقوں کی پیش گوئی کرنا؛5. امیدواروں کے علاقوں میں جینز پر فنکشنل تجزیہ اور افزودگی وغیرہ۔ ڈیٹا میں مزید جدید کان کنی بشمول جینیاتی مارکر اسکریننگ اور پرائمر ڈیزائن بھی دستیاب ہیں۔
-
Amplicon (16S/18S/ITS)
Amplicon (16S/18S/ITS) پلیٹ فارم مائکروبیل ڈائیورسٹی پروجیکٹ کے تجزیہ میں سالوں کے تجربے کے ساتھ تیار کیا گیا ہے، جس میں معیاری بنیادی تجزیہ اور ذاتی تجزیہ شامل ہے: بنیادی تجزیہ موجودہ مائکروبیل تحقیق کے مرکزی دھارے کے تجزیہ کے مواد کا احاطہ کرتا ہے، تجزیہ کا مواد بھرپور اور جامع ہے، اور تجزیہ کے نتائج پروجیکٹ رپورٹس کی شکل میں پیش کیے جاتے ہیں۔ذاتی تجزیہ کا مواد متنوع ہے۔نمونے منتخب کیے جا سکتے ہیں اور بنیادی تجزیہ رپورٹ اور تحقیقی مقصد کے مطابق پیرامیٹرز کو لچکدار طریقے سے ترتیب دیا جا سکتا ہے، تاکہ ذاتی ضروریات کو پورا کیا جا سکے۔ونڈوز آپریٹنگ سسٹم، سادہ اور تیز۔
-
ارتقائی جینیات
ارتقائی جینیات ایک پیک ترتیب دینے والی خدمت ہے جو جینیاتی تغیرات، بشمول SNPs، InDels، SVs اور CNVs کی بنیاد پر دیے گئے مواد کی ارتقائی معلومات کی جامع تشریح فراہم کرنے کے لیے بنائی گئی ہے۔یہ ارتقائی تبدیلیوں اور آبادی کی جینیاتی خصوصیات، جیسے کہ آبادی کی ساخت، جینیاتی تنوع، فائیلوجنی تعلقات، وغیرہ کو بیان کرنے کے لیے درکار تمام بنیادی تجزیہ فراہم کرتا ہے۔ اس میں جین کے بہاؤ پر مطالعہ بھی ہوتا ہے، جو آبادی کے موثر سائز، انحراف کے وقت کے تخمینے کو تقویت دیتا ہے۔
-
تقابلی جینومکس
تقابلی جینومکس کا لفظی مطلب ہے مختلف انواع کے مکمل جینوم کی ترتیب اور ساخت کا موازنہ کرنا۔اس نظم و ضبط کا مقصد انواع کے ارتقاء، جین کے فنکشن، جینوم کی سطح پر جین ریگولیٹری میکانزم کو ظاہر کرنا ہے تاکہ ترتیب کے ڈھانچے اور عناصر کی نشاندہی کی جائے جو مختلف پرجاتیوں میں محفوظ یا مختلف ہیں۔عام تقابلی جینومکس کے مطالعے میں جین فیملی کے تجزیے، ارتقائی ترقی، مکمل جینوم کی نقل، سلیکٹیو پریشر وغیرہ شامل ہیں۔
-
ارتقائی جینیات
آبادی اور ارتقائی جینیاتی تجزیہ کا پلیٹ فارم BMK R&D ٹیم کے اندر برسوں سے جمع کیے گئے بڑے تجربے کی بنیاد پر قائم کیا گیا ہے۔یہ ایک صارف دوست ٹول ہے خاص طور پر ان محققین کے لیے جو بائیو انفارمیٹکس میں اہم نہیں ہیں۔یہ پلیٹ فارم ارتقائی جینیات سے متعلق بنیادی تجزیہ کو قابل بناتا ہے جس میں فائیلوجنیٹک درخت کی تعمیر، ربط کی عدم توازن کا تجزیہ، جینیاتی تنوع کا جائزہ، سلیکٹیو سویپ تجزیہ، رشتہ داری کا تجزیہ، پی سی اے، آبادی کی ساخت کا تجزیہ وغیرہ شامل ہیں۔
-
Hi-C پر مبنی جینوم اسمبلی
ہائی-سی ایک ایسا طریقہ ہے جو کروموسوم کنفیگریشن کو حاصل کرنے کے لیے ڈیزائن کیا گیا ہے جس میں قربت پر مبنی تعاملات اور ہائی تھرو پٹ سیکوینسنگ کو ملا کر۔خیال کیا جاتا ہے کہ ان تعاملات کی شدت کروموسوم پر جسمانی فاصلے کے ساتھ منفی طور پر منسلک ہے۔لہذا، ہائی-سی ڈیٹا ڈرافٹ جینوم میں جمع شدہ ترتیبوں کی کلسٹرنگ، ترتیب اور سمت بندی اور ان کو کروموسوم کی ایک مخصوص تعداد پر لنگر انداز کرنے میں رہنمائی کر سکتا ہے۔یہ ٹیکنالوجی آبادی پر مبنی جینیاتی نقشے کی عدم موجودگی میں کروموسوم کی سطح کے جینوم اسمبلی کو بااختیار بناتی ہے۔ہر ایک جینوم کو ہائی-سی کی ضرورت ہوتی ہے۔
پلیٹ فارم: Illumina NovaSeq پلیٹ فارم / DNBSEQ
-
پلانٹ/جانور ڈی نوو جینوم کی ترتیب
ڈی نووتسلسل سے مراد کسی حوالہ جینوم کی عدم موجودگی میں سیکوینسنگ ٹیکنالوجیز، جیسے PacBio، Nanopore، NGS، وغیرہ کا استعمال کرتے ہوئے ایک نوع کے پورے جینوم کی تعمیر ہے۔تیسری نسل کی ترتیب سازی کی ٹیکنالوجیز کی پڑھنے کی لمبائی میں نمایاں بہتری نے پیچیدہ جینوموں کو جمع کرنے کے نئے مواقع فراہم کیے ہیں، جیسے کہ زیادہ ہیٹروزائگوسٹی، دہرائے جانے والے خطوں کا زیادہ تناسب، پولی پلائیڈز وغیرہ۔ دسیوں کلو بیس کی سطح پر پڑھنے کی لمبائی کے ساتھ، یہ ترتیب پڑھنے کو قابل بناتی ہے۔ دہرائے جانے والے عناصر، غیر معمولی GC مواد والے خطوں اور دیگر انتہائی پیچیدہ خطوں کا حل۔
پلیٹ فارم: PacBio سیکوئل II / نانوپور پرومیتھیون P48 / Illumina NovaSeq پلیٹ فارم
-
ہیومن ہول ایکسوم سیکوینسنگ
مکمل ایکسوم سیکوینسنگ (WES) کو بیماری پیدا کرنے والے اتپریورتنوں کی شناخت کے لیے ایک سرمایہ کاری مؤثر ترتیب کی حکمت عملی کے طور پر شمار کیا جاتا ہے۔اگرچہ ایکسون پورے جینوم کا تقریباً 1.7 فیصد حصہ لیتے ہیں، لیکن یہ کل پروٹین کے افعال کی براہ راست نمائندگی کرتا ہے۔انسانی جینوم میں، یہ بتایا گیا ہے کہ بیماری سے متعلق 85 فیصد سے زیادہ تغیرات پروٹین کوڈنگ والے علاقے میں ہوتے ہیں۔
BMKGENE مختلف تحقیقی اہداف کو پورا کرنے کے لیے دستیاب مختلف exon کیپچرنگ حکمت عملیوں کے ساتھ جامع اور لچکدار انسانی مکمل exome sequencing خدمات پیش کرتا ہے۔
پلیٹ فارم: Illumina NovaSeq پلیٹ فارم
-
Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF-Seq)
ہائی تھرو پٹ جین ٹائپنگ، خاص طور پر بڑے پیمانے پر آبادی پر، جینیاتی ایسوسی ایشن اسٹڈیز میں ایک بنیادی قدم ہے، جو فعال جین کی دریافت، ارتقائی تجزیہ وغیرہ کے لیے جینیاتی بنیاد فراہم کرتا ہے۔ ) کو فی نمونہ ترتیب دینے کی لاگت کو کم کرنے کے لیے متعارف کرایا گیا ہے، جبکہ جینیاتی مارکر کی دریافت پر معقول کارکردگی کو برقرار رکھا گیا ہے۔یہ عام طور پر دی گئی سائز کی حد کے اندر پابندی کے ٹکڑے کو نکال کر حاصل کیا جاتا ہے، جسے کم نمائیندگی لائبریری (RRL) کا نام دیا گیا ہے۔مخصوص-لوکس ایمپلیفائیڈ فریگمنٹ سیکوینسنگ (SLAF-Seq) حوالہ جینوم کے ساتھ یا اس کے بغیر SNP جین ٹائپنگ کے لیے خود تیار کردہ حکمت عملی ہے۔
پلیٹ فارم: Illumina NovaSeq پلیٹ فارم -
ایلومینا اور بی جی آئی
Illumina سیکوینسنگ ٹیکنالوجی، Sequence by Synthesis (SBS) پر مبنی، ایک عالمی سطح پر قبول کی جانے والی NGS اختراع ہے، جو دنیا کے 90% سے زیادہ سیکوینسنگ ڈیٹا تیار کرنے کے لیے ذمہ دار ہے۔SBS کے اصول میں امیجنگ فلوروسینٹلی لیبل لگا ہوا ریورس ایبل ٹرمینیٹرز شامل ہوتا ہے کیونکہ ہر ڈی این ٹی پی کو شامل کیا جاتا ہے، اور بعد میں اگلے بیس کو شامل کرنے کی اجازت دینے کے لیے کلیو کیا جاتا ہے۔ہر ترتیب کے چکر میں چاروں ریورس ایبل ٹرمینیٹر باؤنڈ dNTPs کے ساتھ، فطری مسابقت کارپوریشن تعصب کو کم کرتی ہے۔یہ ورسٹائل ٹیکنالوجی جینومک ایپلی کیشنز کی ایک رینج کو پورا کرتے ہوئے سنگل ریڈ اور پیئر اینڈ لائبریری دونوں کو سپورٹ کرتی ہے۔ایلومینا سیکوینسنگ کی اعلی تھرو پٹ صلاحیتیں اور درستگی اسے جینومکس ریسرچ میں ایک سنگ بنیاد کے طور پر رکھتی ہے، جو سائنسدانوں کو بے مثال تفصیل اور کارکردگی کے ساتھ جینوم کی پیچیدگیوں کو کھولنے کے لیے بااختیار بناتی ہے۔
DNBSEQ، BGI کے ذریعے تیار کیا گیا، ایک اور اختراعی NGS ٹیکنالوجی ہے جو ترتیب کے اخراجات کو مزید کم کرنے اور تھرو پٹ بڑھانے میں کامیاب رہی ہے۔ڈی این بی ایس ای کیو لائبریریوں کی تیاری میں ڈی این اے فریگمنٹیشن، ایس ایس ڈی این اے کی تیاری اور ڈی این اے نینو بالز (ڈی این بی) حاصل کرنے کے لیے سرکل پروردن شامل ہیں۔اس کے بعد یہ ایک ٹھوس سطح پر لوڈ کیے جاتے ہیں اور بعد ازاں کومبنیٹریل پروب-اینکر سنتھیسس (cPAS) کے ذریعے ترتیب دی جاتی ہے۔
ہماری پہلے سے تیار کردہ لائبریری کی ترتیب کی خدمت صارفین کو متنوع ذرائع (mRNA، پورے جینوم، ایمپلی کون، دیگر کے درمیان) سے ان کی ترتیب والی لائبریریوں کو تیار کرنے میں سہولت فراہم کرتی ہے۔اس کے بعد، ان لائبریریوں کو ایلومینا یا BGI پلیٹ فارمز میں کوالٹی کنٹرول اور سیکوینسنگ کے لیے ہمارے ترتیب سازی کے مراکز میں بھیجا جا سکتا ہے۔
