خبریں

ٹرانسپوز ایبل عنصر (TE) پروردن کو جینوم کے سائز کی توسیع اور ارتقاء میں ثالثی کرنے والی ایک محرک قوت کے طور پر تسلیم کیا گیا ہے، لیکن 3D جینومک فن تعمیر کی تشکیل کے نتائج پودوں میں زیادہ تر نامعلوم ہیں۔یہاں، ہم روئی کی تین اقسام کے لیے حوالہ درجے کی جینوم اسمبلیوں کی اطلاع دیتے ہیں جن کا سائز تین گنا ہوتا ہے، یعنیگوسیپیئم روٹنڈیفولیئم(K2)،جی آربوریم(A2)، اورجی ریمونڈی(D5)، Oxford Nanopore Technologies کا استعمال کرتے ہوئےتقابلی جینوم کا تجزیہ نسب سے متعلق مخصوص TE امپلیفیکیشن کی تفصیلات کو دستاویز کرتا ہے جو جینوم کے سائز کے بڑے فرق (K2, 2.44 Gb; A2, 1.62 Gb; D5, 750.19 Mb) میں حصہ ڈالتا ہے، اور جینوم کے درمیان نسبتاً محفوظ جین مواد اور ہم آہنگی کے تعلقات کی نشاندہی کرتا ہے۔ہم نے پایا کہ تقریباً 17% syntenic جین فعال ("A") اور غیر فعال ("B") کمپارٹمنٹس کے درمیان کرومیٹن کی حیثیت کی تبدیلی کو ظاہر کرتے ہیں، اور TE ایمپلیفیکیشن کا تعلق جین کے علاقوں میں A کمپارٹمنٹ کے تناسب میں اضافے سے تھا (~ 7,000 جین ) D5 کے نسبت K2 اور A2 میں۔تین جینوموں کے درمیان صرف 42 فیصد ٹاپولوجیکل ایسوسی ایٹنگ ڈومین (TAD) کی حدود محفوظ تھیں۔ہمارا ڈیٹا نسب سے متعلق TAD حدود کی تشکیل کے بعد TEs کی حالیہ توسیع کو متاثر کرتا ہے۔یہ مطالعہ پودوں میں اعلیٰ ترتیب والے کرومیٹن ڈھانچے کے ارتقاء میں ٹرانسپوسن ثالثی جینوم کی توسیع کے کردار پر روشنی ڈالتا ہے۔