-
پروٹومکس
پروٹومکس میں کسی خلیے، ٹشو یا کسی جاندار کے موجود مواد کے مجموعی پروٹین کی مقدار کے لیے ٹیکنالوجیز کا استعمال شامل ہے۔پروٹومکس پر مبنی ٹیکنالوجیز کو مختلف تحقیقی ترتیبات کے لیے مختلف صلاحیتوں میں استعمال کیا جاتا ہے جیسے کہ مختلف تشخیصی مارکروں کا پتہ لگانا، ویکسین کی تیاری کے لیے امیدوار، روگجنک طریقہ کار کو سمجھنا، مختلف اشاروں کے جواب میں اظہار کے نمونوں میں ردوبدل اور مختلف بیماریوں میں فعال پروٹین کے راستوں کی تشریح۔فی الحال، مقداری پروٹومکس ٹیکنالوجیز کو بنیادی طور پر TMT، لیبل فری اور DIA مقداری حکمت عملیوں میں تقسیم کیا گیا ہے۔
-
میٹابولومکس
میٹابولوم جینوم کا ٹرمینل ڈاون اسٹریم پروڈکٹ ہے اور ایک سیل، ٹشو یا جاندار میں موجود تمام کم مالیکیولر-وزن مالیکیولز (میٹابولائٹس) کی کل تکمیل پر مشتمل ہوتا ہے۔میٹابولومکس کا مقصد جسمانی محرکات یا بیماری کی حالتوں کے تناظر میں چھوٹے مالیکیولز کی وسیع چوڑائی کی پیمائش کرنا ہے۔میٹابولومکس کے طریقہ کار دو الگ الگ گروپوں میں آتے ہیں: غیر ٹارگٹڈ میٹابولومکس، ایک نمونے میں تمام قابل پیمائش تجزیہ کاروں کا ایک مطلوبہ جامع تجزیہ جس میں GC-MS/LC-MS کا استعمال کرتے ہوئے کیمیکل نامعلوم شامل ہیں، اور ہدف شدہ میٹابولومکس، کیمیاوی خصوصیات کے متعین گروپوں کی پیمائش اور بائیو کیمیکل تشریح شدہ میٹابولائٹس۔
-
بلکڈ سیگریگینٹ تجزیہ
بلکڈ سیگریگینٹ تجزیہ (BSA) ایک تکنیک ہے جو فینوٹائپ سے وابستہ جینیاتی مارکروں کی فوری شناخت کے لیے استعمال کی جاتی ہے۔بی ایس اے کے مرکزی ورک فلو میں انتہائی مخالف فینوٹائپس والے افراد کے دو گروپوں کو منتخب کرنا، تمام افراد کے ڈی این اے کو دو بڑے ڈی این اے بنانے کے لیے جمع کرنا، دو پولوں کے درمیان تفریق کی ترتیب کی نشاندہی کرنا شامل ہے۔اس تکنیک کو بڑے پیمانے پر پودوں/جانوروں کے جینوموں میں ہدف شدہ جینوں کے ذریعے مضبوطی سے منسلک جینیاتی مارکروں کی شناخت میں استعمال کیا گیا ہے۔
-
ڈی این اے / آر این اے کی ترتیب - نینو پور سیکوینسر
ONT کی ترتیب ایک واحد مالیکیول ریئل ٹائم الیکٹریکل سگنل سیکوینسنگ ٹیکنالوجی ہے جس کی بنیاد نینو پورس پر ہے، ہر پلیٹ فارم کی ترتیب کا اصول ایک جیسا ہے۔دوہرے پھنسے ہوئے DNA/RNA بائیو فلم میں سرایت شدہ نینو پورس پروٹین کے ساتھ جڑے ہوں گے اور موٹر پروٹین کی قیادت کے نیچے کھولے جائیں گے، بائیو فلم کے دونوں اطراف سے وولٹیج کے فرق کی کارروائی کے تحت، ڈی این اے/آر این اے اسٹرینڈز نینو پور چینل پروٹین سے ایک خاص حد تک گزرتے ہیں۔ شرحDNA/RNA اسٹرینڈ پر مختلف اڈوں کی کیمیائی خصوصیات کے فرق کی وجہ سے، جب ایک واحد بیس یا DNA مالیکیول نینو پور چینل سے گزرتا ہے، تو یہ مختلف برقی سگنلز کی تبدیلی کا سبب بنے گا۔ان سگنلز کا پتہ لگانے اور ان کے مطابق، متعلقہ بنیادی اقسام کا حساب لگایا جا سکتا ہے، اور ترتیب کا حقیقی وقت کا پتہ لگانے کو مکمل کیا جا سکتا ہے۔
-
ڈی این اے / آر این اے کی ترتیب - پی سی بائیو سیکوینسر
PacBio سیکوینسنگ پلیٹ فارم ایک طویل پڑھا جانے والا سیکوینسنگ پلیٹ فارم ہے، جسے تھرڈ جنریشن سیکوینسنگ (TGS) ٹیکنالوجیز میں سے ایک کے نام سے بھی جانا جاتا ہے۔بنیادی ٹکنالوجی، سنگل مالیکیول ریئل ٹائم (SMRT)، دسیوں کلو بیس کی لمبائی کے ساتھ پڑھنے کی نسل کو طاقت دیتی ہے۔"Sequencing-by-Synthesis" کی بنیاد پر، واحد نیوکلیوٹائڈ ریزولوشن زیرو موڈ ویو گائیڈ (ZMW) کے ذریعے حاصل کیا جاتا ہے، جہاں صرف نچلے حصے میں محدود حجم (مالیکیول ترکیب کی سائٹ) کو روشن کیا جاتا ہے۔مزید برآں، SMRT کی ترتیب بڑی حد تک NGS سسٹم میں ترتیب کے لحاظ سے مخصوص تعصب سے گریز کرتی ہے، اس میں لائبریری کی تعمیر کے عمل میں PCR ایمپلیفیکیشن کے زیادہ تر اقدامات کی ضرورت نہیں ہوتی ہے۔
پلیٹ فارم: سیکوئل II، ریویو
